Report for Sequence Feature Glyma.04g069600
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm04
Start: 5800170
stop: 5806868
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.04g069600
Expression Patterns of Glyma.04g069600
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Related Legume Genes
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS .
Gene information in GlycineMine developed by LIS .
Related Plant Genes
Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.04g069600
Paralog Evidence Comments
Glyma.06g071300 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.04g069600 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma04g07400 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.04g069600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.04g069600.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.04g069600 ID=Glyma.04g069600.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.04g069600.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.04g069600 ID=Glyma.04g069600.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.04g069600.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.04g069600 ID=Glyma.04g069600.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.04g069600.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.04g069600 ID=Glyma.04g069600.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
aaAAGTGGTGTACAAGAGTCGGCGGTTAGATTCCAGGTCGTTGTCGTCAGGGCCTGATCGCTATCAGCCTTTGCTTCGTTTTCTACCACTTTCAGTAATCCCATAATATCAAATTTTCCTCTTTTTTTTCATTTTGAAATAAAATATTTCTGGGTTCATCATTATTCATGGGAAATACTAATAGCTCCAACTTCTGGAATCAATAATCATGTGAATTTTGAAGATCTCAGTTACTAACAACACTTTCTCCATGGCTGCTACTGCTCCTTCATCTGCATACCCTTTTGGAATCCCTTTCCACTCCCACTCTCGAAGAGTGGATTGCTCAACCTCAACCTCCATGTTCCCCATTCACGCAGACCTCTCAACAATTTCTATGTGCCCACGTTCTGCTTCAAAGGGATTAGTTGATCAAGTATATGCACAGCTTGATAATGATGATTACTACAGGGAGAAAGTTCCAACACCCATTCTTGACATGGTTGAAAACCCTCTTTGCTTGAAGAACTTATCTCTTCAGGTTAGCTGAACTGAAACAACTAGCAGTTGAAATCCGTTCAGATTTGTCTTCTATTATGTCAGGTACACAAATATCACCGAAAGCAAGTATGGCAGTGGTTGAGCTGACAGTTGCAATACATCATGTTTTCAATGCTCCAGTAGACAAAATATTGTGGGATGTTGGGGATCAAACATATGCACATAAGATTCTTACAGGAAGGCGATCACTCATGACGACAATGAGAAGAAAGAATGGTCTTTCTGGTGTTACTTCCCGATTTGAGAGTGAATATGATGCATTTGGTGCAGGTCATGGATGCAGCAGTATTTCTGCTGGACTTGAATATTTCATTTCAGGCATGGCAGTTGCGCGGGATATTAAGGGGAGGCGAGAACGCGTAATTGCAGTTATCAGCAATTGGACAACTATGGCTGGTCAGGCGTATGAGGCAATGAGCAATGCAGGATATTTGGACTCAAATATGGTTGTGATTTTGAATGATAGCCGTCACTCTTTACTTCCAAAAATTGAGGAGGGCCCAAAGACATTTGTCAATGCCCTATCTAGTACCCTGAGCAAGCTCCAGTCCAGTAAATCTTTCCGGAGATTTAGAGAAGCTGCTAAGGGTGTTACGAAACGAATTGGTAGAGGTATGCATGAATTGGCAGCTAAAGTGGATGAATATGCTCGTGGTATGATGGGTCCTCTAGGTTCTACTCTTTTTGAAGAGCTTGGGTTGTACTACATAGGCCCAGTGGATGGACACAATATTGAAGATCTCATATGTGTTCTGCAAGAAGTAGCTTCCCTGGATTCAATGGGACCTGTCTTGGTACATGTGATAACTGACGAAAATCAGGGAGATGAAAACAGTCAGAAAAGTGATATATCAGATGGGCAGCAGGATGAAGGTTCTGTTAAATCTGATTCGTTAGATAATCCTGTTCGGCCTCAAACATATGGCAATTGCTTTGTGGAGACTTTGGTTGTAGAAGCAGAGAAAGACAAAGATATTGTTGTTGTTCATGCTGGATTAACGATGGAGCCATCACTTGAACTGTTTCAGGAAAAATTTCCAGATAGGTTTTTTGATGTGGGAATGGCTGAACAACATGCAGTCACATTTGCTTCTGGTTTGGCATGTGGTGGATTGAAGCCATTTTGTGTCATAGCTTCCTCCTTTCTACAAAGAGCCTATGACCAGGTGGTGCATGATGTTGATCAACAGAGAATTCCAGTGCGTTTTGTTATTACAAGTGCAGGATTGGTAGGTTCTGATGGTCCCCTTCAATGTGGAGCATTTGATATAAACTTTATGTCATGCTTACCAAACATGATTGTCATGGCCCCATCTGATGAGGTTGAACTCATGCACATGGTGGCTACTGCTACTCGCATCAATAGTCAGCCTATCTGCTTTCGGTATCCAAGGGGTGCCCTGGTTGGGAGAGGGTACACTATAAGCGATGGAATCCCCATCAAGATAGGAAGAGGAAGAGTTCTTGTTGAAGGCAAAGATGTTGCTTTCCTAGGATATGGATCGATGGTTCAGAACTGCCTAAAGGCTCATTCACTCCTCGCCAAGCTTGGCATTGAGGTAACTGTTGCTGATGCAAGGTTCTGCAAGCCCCTTGACATCAAGCTTCTGAGGCAGCTTTGTAAACACCACTCTTTTCTAGTTACTGTTGAGGAAGGATCTATTGGAGGATTTGGTTCCCAGGTTGCTCAGTTTATTGCGGTTAATGGACTACTCGATGGAAGAATTCAGTGGCGACCAATTGTTTTACCAGACAGATATATTGAGCATGCATCACCAAATGAACAGCTTGATCAAGCAGGGTTGAGTGGACATCACATTGCTGCCACGGCATTGAGTTTACTAGGCCGTACCCGTGAAGCTCTCCTATTTATGTGTTCCTGACTTATATTTCCAGATACCATGAATGGAAGCTGGATAGCTCCATAGGAAGAAGGAGAACCAACAAAGCAAAGATGTAAAGAATGCCATTTTCTCTGTATAGAACTGATGTTAAGTAGCACAACGGAAACTAACGGGAGTTTTGTTTTTTGGACATCTAACAGTGTAAATTGTTGAGAAAGTGACTTAATTGTGAAAATACTTGAATGGAGAACTTTGCTGTCATTTTTTTAGTGGATAAGTAGTTTTATTTTATTTCATGTTTC
>Glyma.04g069600.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.04g069600 ID=Glyma.04g069600.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
TGCTTTACGTTTTCCTTTTTAGATGAATAAATAAAATTTCTAAAGGTGAAATTTAAAATGACCTTGAAGTCGTATGTAGAATATTTCATTTCAGGCATGGCAGTTGCGCGGGATATTAAGGGGAGGCGAGAACGCGTAATTGCAGTTATCAGCAATTGGACAACTATGGCTGGTCAGGCGTATGAGGCAATGAGCAATGCAGGATATTTGGACTCAAATATGGTTGTGATTTTGAATGATAGCCGTCACTCTTTACTTCCAAAAATTGAGGAGGGCCCAAAGACATTTGTCAATGCCCTATCTAGTACCCTGAGCAAGCTCCAGTCCAGTAAATCTTTCCGGAGATTTAGAGAAGCTGCTAAGGGTGTTACGAAACGAATTGGTAGAGGTATGCATGAATTGGCAGCTAAAGTGGATGAATATGCTCGTGGTATGATGGGTCCTCTAGGTTCTACTCTTTTTGAAGAGCTTGGGTTGTACTACATAGGCCCAGTGGATGGACACAATATTGAAGATCTCATATGTGTTCTGCAAGAAGTAGCTTCCCTGGATTCAATGGGACCTGTCTTGGTACATGTGATAACTGACGAAAATCAGGGAGATGAAAACAGTCAGAAAAGTGATATATCAGATGGGCAGCAGGATGAAGGTTCTGTTAAATCTGATTCGTTAGATAATCCTGTTCGGCCTCAAACATATGGCAATTGCTTTGTGGAGACTTTGGTTGTAGAAGCAGAGAAAGACAAAGATATTGTTGTTGTTCATGCTGGATTAACGATGGAGCCATCACTTGAACTGTTTCAGGAAAAATTTCCAGATAGGTTTTTTGATGTGGGAATGGCTGAACAACATGCAGTCACATTTGCTTCTGGTTTGGCATGTGGTGGATTGAAGCCATTTTGTGTCATAGCTTCCTCCTTTCTACAAAGAGCCTATGACCAGGTGGTGCATGATGTTGATCAACAGAGAATTCCAGTGCGTTTTGTTATTACAAGTGCAGGATTGGTAGGTTCTGATGGTCCCCTTCAATGTGGAGCATTTGATATAAACTTTATGTCATGCTTACCAAACATGATTGTCATGGCCCCATCTGATGAGGTTGAACTCATGCACATGGTGGCTACTGCTACTCGCATCAATAGTCAGCCTATCTGCTTTCGGTATCCAAGGGGTGCCCTGGTTGGGAGAGGGTACACTATAAGCGATGGAATCCCCATCAAGATAGGAAGAGGAAGAGTTCTTGTTGAAGGCAAAGATGTTGCTTTCCTAGGATATGGATCGATGGTTCAGAACTGCCTAAAGGCTCATTCACTCCTCGCCAAGCTTGGCATTGAGGTAACTGTTGCTGATGCAAGGTTCTGCAAGCCCCTTGACATCAAGCTTCTGAGGCAGCTTTGTAAACACCACTCTTTTCTAGTTACTGTTGAGGAAGGATCTATTGGAGGATTTGGTTCCCAGGTTGCTCAGTTTATTGCGGTTAATGGACTACTCGATGGAAGAATTCAGTGGCGACCAATTGTTTTACCAGACAGATATATTGAGCATGCATCACCAAATGAACAGCTTGATCAAGCAGGGTTGAGTGGACATCACATTGCTGCCACGGCATTGAGTTTACTAGGCCGTACCCGTGAAGCTCTCCTATTTATGTGTTCCTGACTTATATTTCCAGATACCATGAATGGAAGCTGGATAGCTCCATAGGAAGAAGGAGAACCAACAAAGCAAAGATGTAAAGAATGCCATTTTCTCTGTATAGAACTGATGTTAAGTAGCACAACGGAAACTAACGGGAGTTTTGTTTTTTGGACATCTAACAGTGTAAATTGTTGAGAAAGTGACTTAATTGTGAAAATACTTGAATGGAGAACTTTGCTGTCATTTTTTTAGTGGATAAGTAGTTTTATTTTATTTCATGTTTC
Coding sequences of Glyma.04g069600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.04g069600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g069600.1.p locus=Glyma.04g069600 ID=Glyma.04g069600.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATGGCTGCTACTGCTCCTTCATCTGCATACCCTTTTGGAATCCCTTTCCACTCCCACTCTCGAAGAGTGGATTGCTCAACCTCAACCTCCATGTTCCCCATTCACGCAGACCTCTCAACAATTTCTATGTGCCCACGTTCTGCTTCAAAGGGATTAGTTGATCAAGTATATGCACAGCTTGATAATGATGATTACTACAGGGAGAAAGTTCCAACACCCATTCTTGACATGGTTGAAAACCCTCTTTGCTTGAAGAACTTATCTCTTCAGGAACTGAAACAACTAGCAGTTGAAATCCGTTCAGATTTGTCTTCTATTATGTCAGGTACACAAATATCACCGAAAGCAAGTATGGCAGTGGTTGAGCTGACAGTTGCAATACATCATGTTTTCAATGCTCCAGTAGACAAAATATTGTGGGATGTTGGGGATCAAACATATGCACATAAGATTCTTACAGGAAGGCGATCACTCATGACGACAATGAGAAGAAAGAATGGTCTTTCTGGTGTTACTTCCCGATTTGAGAGTGAATATGATGCATTTGGTGCAGGTCATGGATGCAGCAGTATTTCTGCTGGACTTGAATATTTCATTTCAGGCATGGCAGTTGCGCGGGATATTAAGGGGAGGCGAGAACGCGTAATTGCAGTTATCAGCAATTGGACAACTATGGCTGGTCAGGCGTATGAGGCAATGAGCAATGCAGGATATTTGGACTCAAATATGGTTGTGATTTTGAATGATAGCCGTCACTCTTTACTTCCAAAAATTGAGGAGGGCCCAAAGACATTTGTCAATGCCCTATCTAGTACCCTGAGCAAGCTCCAGTCCAGTAAATCTTTCCGGAGATTTAGAGAAGCTGCTAAGGGTGTTACGAAACGAATTGGTAGAGGTATGCATGAATTGGCAGCTAAAGTGGATGAATATGCTCGTGGTATGATGGGTCCTCTAGGTTCTACTCTTTTTGAAGAGCTTGGGTTGTACTACATAGGCCCAGTGGATGGACACAATATTGAAGATCTCATATGTGTTCTGCAAGAAGTAGCTTCCCTGGATTCAATGGGACCTGTCTTGGTACATGTGATAACTGACGAAAATCAGGGAGATGAAAACAGTCAGAAAAGTGATATATCAGATGGGCAGCAGGATGAAGGTTCTGTTAAATCTGATTCGTTAGATAATCCTGTTCGGCCTCAAACATATGGCAATTGCTTTGTGGAGACTTTGGTTGTAGAAGCAGAGAAAGACAAAGATATTGTTGTTGTTCATGCTGGATTAACGATGGAGCCATCACTTGAACTGTTTCAGGAAAAATTTCCAGATAGGTTTTTTGATGTGGGAATGGCTGAACAACATGCAGTCACATTTGCTTCTGGTTTGGCATGTGGTGGATTGAAGCCATTTTGTGTCATAGCTTCCTCCTTTCTACAAAGAGCCTATGACCAGGTGGTGCATGATGTTGATCAACAGAGAATTCCAGTGCGTTTTGTTATTACAAGTGCAGGATTGGTAGGTTCTGATGGTCCCCTTCAATGTGGAGCATTTGATATAAACTTTATGTCATGCTTACCAAACATGATTGTCATGGCCCCATCTGATGAGGTTGAACTCATGCACATGGTGGCTACTGCTACTCGCATCAATAGTCAGCCTATCTGCTTTCGGTATCCAAGGGGTGCCCTGGTTGGGAGAGGGTACACTATAAGCGATGGAATCCCCATCAAGATAGGAAGAGGAAGAGTTCTTGTTGAAGGCAAAGATGTTGCTTTCCTAGGATATGGATCGATGGTTCAGAACTGCCTAAAGGCTCATTCACTCCTCGCCAAGCTTGGCATTGAGGTAACTGTTGCTGATGCAAGGTTCTGCAAGCCCCTTGACATCAAGCTTCTGAGGCAGCTTTGTAAACACCACTCTTTTCTAGTTACTGTTGAGGAAGGATCTATTGGAGGATTTGGTTCCCAGGTTGCTCAGTTTATTGCGGTTAATGGACTACTCGATGGAAGAATTCAGTGGCGACCAATTGTTTTACCAGACAGATATATTGAGCATGCATCACCAAATGAACAGCTTGATCAAGCAGGGTTGAGTGGACATCACATTGCTGCCACGGCATTGAGTTTACTAGGCCGTACCCGTGAAGCTCTCCTATTTATGTGTTCCTGA
>Glyma.04g069600.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g069600.2.p locus=Glyma.04g069600 ID=Glyma.04g069600.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.04g069600
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
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