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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.04g055700

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm04
Start:4495139
stop:4501357
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.04g055700
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G33210.1AT SLOMO JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
KOG1947 KOG Leucine rich repeat proteins, some proteins contain F-box JGI N/AIEA
KOG4341 KOG F-box protein containing LRR JGI N/AIEA
PTHR24006PantherFam UBIQUITIN CARBOXYL-TERMINAL HYDROLASE JGI N/AIEA
PF12937Pfam F-box-like JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.04g055700 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma04g05850 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.04g055700
>Glyma.04g055700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g055700.1.p locus=Glyma.04g055700 id=Glyma.04g055700.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g055700.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g055700.2.p locus=Glyma.04g055700 id=Glyma.04g055700.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGAGAGGAACCGGCGTCGTTCCGACGGAGAGAGTAGTTCCGTTTCCGCTGAGGACACTCGCCGGAAGCGCGCCAGAGTCTACTTCGATTTCGATGGCCCTCATTGTATTGTGAAGTGTTCAAATGCTGGGAAATCCAGTGCATCTGTTGATGAATTTGTGGATTATGATAATTTTCAAAGATCGTCTCTTCGATCCAACGATGATGATGCATTGAGGTCGATGTCTGCTGGTGAGGAGAGTAACTTTGACGAAGGAGATGACAGTGACATCTCAAAAGTGGATGATCTAGAGGTCAAGATGGATCTTACGGATGACTTATTACATATGGTCTTTTCGTTTTTGGATCATCCCAATCTCTGCAAAGCTGCTAGAGTCTGTAAGCAGTGGTGGACTGCTAGTGCTCATGAAGTCTTCTGGAAGAGTTTGAATTTTGAAGATCGGAGCATATCTGTAGAGCAATTTGAGGACATCTGTAGGCGTTATCCTAATATCATGGCAATCCGTATGTCTGGTCCTGCCTGTAACCAGCTTGTCATGAAGGCCATTTCTTCGTTAAGAAATCTTGAGGCTTTAACATTGGGAAGAGCTCATATAATGGATAATTTTTTCCATGCTTTGGCCGATTGTTCTATGTTGAAAAGACTGACCATCAATGATGCTATACTTGGCAGTGGTATTCAGGAGATATCAGTCAATCACGACAGGCTGTGTCATCTCCAATTGACAAAGTGCCGTGTGATGCGTATAGCAGTCAGGTGCCCACAACTTGAAACTATGTCATTGAAGCGCAGTAACATGGCACAGACTGCGCTCAATTGCCCCCTTTTGCAAGAGCTTGATATAGGCTCTTGCCACAAACTTCCTGATTCTGCTATTCGTTCAGCTGTTACATCATGCTCGCAATTAGTTTCTTTGGACATGTCTAATTGTTCGAGTGTTAGTGATGAAACATTACGAGAAATATCCATGAATTGTGCTAACCTTAGTTTTCTTGATGCATCGTACTGCCCCAACCTATTCTTGGAGACTGTTAGACTGCCAATGTTAACAGTTCTGAAGCTTCACAGTTGTGATGGCATCACTGCAGCCTCAATGGCTGCAATATCTCACAGTTATATGTTGGAGGTTTTGGAGCTTGATAATTGTAGCCTATTGACATCAGTGTCTTTAGACCTTCCCCGCTTGCAGAATATTAGATTGGTACACTGTCGCAAATTTGCTGATTTGAACTTGATGACCCTAACGTTGTCGTCTATCTTGGTGTCCAATTGCCCTGTGCTCCATCGTATCAACATCACTTCAAATTCACTTCAAAAATTAACAATACCAAAGCAGGACAGTTTAACCACATTAGCTCTGCAATGCCAATCTTTACAAGAAGTGGATCTCTCTGAGTGTGAATCTTTGAATAACTCTGTATGCAATGTTTTTAATGATGGTGGAGGTTGCCCAATGTTGAAATCGTTAGTTCTTGGTAATTGTGAGAGTTTGACATCAGTTCAGTTCATCAGTACCTCTCTAATCAGTCTTTCCCTTGGTGGTTGCCGTGCAATAACTAATCTTGAACTCACATGCCCTAATCTAGAGAAAGTTATTTTGGATGGCTGTGATCATTTGGAAAGAGCATCATTTTGTCCAGTTGGTCTTTTATCTCTCAATTTAGGAATATGTCCAAAATTGAACACACTCAGCATTGAAGCACCGTTTATGGTTTCACTTGAGTTGAAAGGATGTGGTGTACTATCTGAAGCATTCATTAATTGTCCACTCTTAGCATCTCTCGATGCTTCCTTTTGCAGCCAACTAACGGATGGCTGCTTGTCTGCAACAACTGTCTCATGCCCACTGATTGAATCATTGATATTAATGTCATGCTCATCAATTGGTTCAGAGGGTCTTCGATCTCTGTATTGTCTTCCAAATTTGACTGTTCTTGACTTATCATACACTTTCTTGGTGAACATGCAGCCTGTCTTTGATTCTTGTTTGCAACTAAAGGTTTTAAAGCTGCAAGCATGCAAATATCTCACTGAAACATCACTTGAACCTCTTTACAAAGGAGGTGCTTTGCCAGCACTTCAGGAGTTGGACTTGTCTTATGGAACTCTCTGTCAATCAGCCATAGATGAGCTTCTTGCTTGCTGCACAAACCTAACTCATGTGAGTTTGAATGGCTGTGTGAATATGCATGATTTGAATTGGGGAAGCAGTCGTGGGCAAAGTGACAATTTCCCTGCTGTAAACACCCCATCCTGGGCAAGTTCTAATGAGATTATCTCTGAATCAAGTGAGCACTCTGCTCGCTTACTACAAAACCTCTACTGTGTTGGATGTCCAAATATTAGGAAGGTTGTCATTCCATTGAGGGAAAATTGTTTTCATTTGTTATTTTTAAACCTTTCGCTCTCGGCAAATTTGAAAGTGGTTGATGTCACATGTCTCAACCTATGCTTTCTTAATTTAAGCAATTGTTCCTCTTTGGAAATTTTGAAGTTAGAGTGTCCAAAATTGACCAGTCTATTCCTTCAGTCTTGCAATATTGACGATGAAGCTGTTGAAGCTGCTATATCAAAATGCACTATGCTGGAGACTCTTGACGTTCGCTTTTGTCCAAAGATAAGCTCAATAAGCATGGGAAGATTACGCACAATTTGTTCAAGTTTGAAGCGAATATTTAGCAGTTAG

>Glyma.04g055700.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g055700.3.p locus=Glyma.04g055700 id=Glyma.04g055700.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGTGGTGTTCTTCGCTAGGTGGCCCTCATTGTATTGTGAAGTGTTCAAATGCTGGGAAATCCAGTGCATCTGTTGATGAATTTGTGGATTATGATAATTTTCAAAGATCGTCTCTTCGATCCAACGATGATGATGCATTGAGGTCGATGTCTGCTGGTGAGGAGAGTAACTTTGACGAAGGAGATGACAGTGACATCTCAAAAGTGGATGATCTAGAGGTCAAGATGGATCTTACGGATGACTTATTACATATGGTCTTTTCGTTTTTGGATCATCCCAATCTCTGCAAAGCTGCTAGAGTCTGTAAGCAGTGGTGGACTGCTAGTGCTCATGAAGTCTTCTGGAAGAGTTTGAATTTTGAAGATCGGAGCATATCTGTAGAGCAATTTGAGGACATCTGTAGGCGTTATCCTAATATCATGGCAATCCGTATGTCTGGTCCTGCCTGTAACCAGCTTGTCATGAAGGCCATTTCTTCGTTAAGAAATCTTGAGGCTTTAACATTGGGAAGAGCTCATATAATGGATAATTTTTTCCATGCTTTGGCCGATTGTTCTATGTTGAAAAGACTGACCATCAATGATGCTATACTTGGCAGTGGTATTCAGGAGATATCAGTCAATCACGACAGGCTGTGTCATCTCCAATTGACAAAGTGCCGTGTGATGCGTATAGCAGTCAGGTGCCCACAACTTGAAACTATGTCATTGAAGCGCAGTAACATGGCACAGACTGCGCTCAATTGCCCCCTTTTGCAAGAGCTTGATATAGGCTCTTGCCACAAACTTCCTGATTCTGCTATTCGTTCAGCTGTTACATCATGCTCGCAATTAGTTTCTTTGGACATGTCTAATTGTTCGAGTGTTAGTGATGAAACATTACGAGAAATATCCATGAATTGTGCTAACCTTAGTTTTCTTGATGCATCGTACTGCCCCAACCTATTCTTGGAGACTGTTAGACTGCCAATGTTAACAGTTCTGAAGCTTCACAGTTGTGATGGCATCACTGCAGCCTCAATGGCTGCAATATCTCACAGTTATATGTTGGAGGTTTTGGAGCTTGATAATTGTAGCCTATTGACATCAGTGTCTTTAGACCTTCCCCGCTTGCAGAATATTAGATTGGTACACTGTCGCAAATTTGCTGATTTGAACTTGATGACCCTAACGTTGTCGTCTATCTTGGTGTCCAATTGCCCTGTGCTCCATCGTATCAACATCACTTCAAATTCACTTCAAAAATTAACAATACCAAAGCAGGACAGTTTAACCACATTAGCTCTGCAATGCCAATCTTTACAAGAAGTGGATCTCTCTGAGTGTGAATCTTTGAATAACTCTGTATGCAATGTTTTTAATGATGGTGGAGGTTGCCCAATGTTGAAATCGTTAGTTCTTGGTAATTGTGAGAGTTTGACATCAGTTCAGTTCATCAGTACCTCTCTAATCAGTCTTTCCCTTGGTGGTTGCCGTGCAATAACTAATCTTGAACTCACATGCCCTAATCTAGAGAAAGTTATTTTGGATGGCTGTGATCATTTGGAAAGAGCATCATTTTGTCCAGTTGGTCTTTTATCTCTCAATTTAGGAATATGTCCAAAATTGAACACACTCAGCATTGAAGCACCGTTTATGGTTTCACTTGAGTTGAAAGGATGTGGTGTACTATCTGAAGCATTCATTAATTGTCCACTCTTAGCATCTCTCGATGCTTCCTTTTGCAGCCAACTAACGGATGGCTGCTTGTCTGCAACAACTGTCTCATGCCCACTGATTGAATCATTGATATTAATGTCATGCTCATCAATTGGTTCAGAGGGTCTTCGATCTCTGTATTGTCTTCCAAATTTGACTGTTCTTGACTTATCATACACTTTCTTGGTGAACATGCAGCCTGTCTTTGATTCTTGTTTGCAACTAAAGGTTTTAAAGCTGCAAGCATGCAAATATCTCACTGAAACATCACTTGAACCTCTTTACAAAGGAGGTGCTTTGCCAGCACTTCAGGAGTTGGACTTGTCTTATGGAACTCTCTGTCAATCAGCCATAGATGAGCTTCTTGCTTGCTGCACAAACCTAACTCATGTGAGTTTGAATGGCTGTGTGAATATGCATGATTTGAATTGGGGAAGCAGTCGTGGGCAAAGTGACAATTTCCCTGCTGTAAACACCCCATCCTGGGCAAGTTCTAATGAGATTATCTCTGAATCAAGTGAGCACTCTGCTCGCTTACTACAAAACCTCTACTGTGTTGGATGTCCAAATATTAGGAAGGTTGTCATTCCATTGAGGGAAAATTGTTTTCATTTGTTATTTTTAAACCTTTCGCTCTCGGCAAATTTGAAAGTGGTTGATGTCACATGTCTCAACCTATGCTTTCTTAATTTAAGCAATTGTTCCTCTTTGGAAATTTTGAAGTTAGAGTGTCCAAAATTGACCAGTCTATTCCTTCAGTCTTGCAATATTGACGATGAAGCTGTTGAAGCTGCTATATCAAAATGCACTATGCTGGAGACTCTTGACGTTCGCTTTTGTCCAAAGATAAGCTCAATAAGCATGGGAAGATTACGCACAATTTGTTCAAGTTTGAAGCGAATATTTAGCAGTTAG

>Glyma.04g055700.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g055700.5.p locus=Glyma.04g055700 id=Glyma.04g055700.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGAGAGGAACCGGCGTCGTTCCGACGGAGAGAGTAGTTCCGTTTCCGCTGAGGACACTCGCCGGAAGCGCGCCAGAGTCTACTTCGATTTCGATGGCCCTCATTGTATTGTGAAGTGTTCAAATGCTGGGAAATCCAGTGCATCTGTTGATGAATTTGTGGATTATGATAATTTTCAAAGATCGTCTCTTCGATCCAACGATGATGATGCATTGAGGTCGATGTCTGCTGGTGAGGAGAGTAACTTTGACGAAGGAGATGACAGTGACATCTCAAAAGTGGATGATCTAGAGGTCAAGATGGATCTTACGGATGACTTATTACATATGGTCTTTTCGTTTTTGGATCATCCCAATCTCTGCAAAGCTGCTAGAGTCTGTAAGCAGTGGTGGACTGCTAGTGCTCATGAAGTCTTCTGGAAGAGTTTGAATTTTGAAGATCGGAGCATATCTGTAGAGCAATTTGAGGACATCTGTAGGCGTTATCCTAATATCATGGCAATCCGTATGTCTGGTCCTGCCTGTAACCAGCTTGTCATGAAGGCCATTTCTTCGTTAAGTGGTATTCAGGAGATATCAGTCAATCACGACAGGCTGTGTCATCTCCAATTGACAAAGTGCCGTGTGATGCGTATAGCAGTCAGGTGCCCACAACTTGAAACTATGTCATTGAAGCGCAGTAACATGGCACAGACTGCGCTCAATTGCCCCCTTTTGCAAGAGCTTGATATAGGCTCTTGCCACAAACTTCCTGATTCTGCTATTCGTTCAGCTGTTACATCATGCTCGCAATTAGTTTCTTTGGACATGTCTAATTGTTCGAGTGTTAGTGATGAAACATTACGAGAAATATCCATGAATTGTGCTAACCTTAGTTTTCTTGATGCATCGTACTGCCCCAACCTATTCTTGGAGACTGTTAGACTGCCAATGTTAACAGTTCTGAAGCTTCACAGTTGTGATGGCATCACTGCAGCCTCAATGGCTGCAATATCTCACAGTTATATGTTGGAGGTTTTGGAGCTTGATAATTGTAGCCTATTGACATCAGTGTCTTTAGACCTTCCCCGCTTGCAGAATATTAGATTGGTACACTGTCGCAAATTTGCTGATTTGAACTTGATGACCCTAACGTTGTCGTCTATCTTGGTGTCCAATTGCCCTGTGCTCCATCGTATCAACATCACTTCAAATTCACTTCAAAAATTAACAATACCAAAGCAGGACAGTTTAACCACATTAGCTCTGCAATGCCAATCTTTACAAGAAGTGGATCTCTCTGAGTGTGAATCTTTGAATAACTCTGTATGCAATGTTTTTAATGATGGTGGAGGTTGCCCAATGTTGAAATCGTTAGTTCTTGGTAATTGTGAGAGTTTGACATCAGTTCAGTTCATCAGTACCTCTCTAATCAGTCTTTCCCTTGGTGGTTGCCGTGCAATAACTAATCTTGAACTCACATGCCCTAATCTAGAGAAAGTTATTTTGGATGGCTGTGATCATTTGGAAAGAGCATCATTTTGTCCAGTTGGTCTTTTATCTCTCAATTTAGGAATATGTCCAAAATTGAACACACTCAGCATTGAAGCACCGTTTATGGTTTCACTTGAGTTGAAAGGATGTGGTGTACTATCTGAAGCATTCATTAATTGTCCACTCTTAGCATCTCTCGATGCTTCCTTTTGCAGCCAACTAACGGATGGCTGCTTGTCTGCAACAACTGTCTCATGCCCACTGATTGAATCATTGATATTAATGTCATGCTCATCAATTGGTTCAGAGGGTCTTCGATCTCTGTATTGTCTTCCAAATTTGACTGTTCTTGACTTATCATACACTTTCTTGGTGAACATGCAGCCTGTCTTTGATTCTTGTTTGCAACTAAAGGTTTTAAAGCTGCAAGCATGCAAATATCTCACTGAAACATCACTTGAACCTCTTTACAAAGGAGGTGCTTTGCCAGCACTTCAGGAGTTGGACTTGTCTTATGGAACTCTCTGTCAATCAGCCATAGATGAGCTTCTTGCTTGCTGCACAAACCTAACTCATGTGAGTTTGAATGGCTGTGTGAATATGCATGATTTGAATTGGGGAAGCAGTCGTGGGCAAAGTGACAATTTCCCTGCTGTAAACACCCCATCCTGGGCAAGTTCTAATGAGATTATCTCTGAATCAAGTGAGCACTCTGCTCGCTTACTACAAAACCTCTACTGTGTTGGATGTCCAAATATTAGGAAGGTTGTCATTCCATTGAGGGAAAATTGTTTTCATTTGTTATTTTTAAACCTTTCGCTCTCGGCAAATTTGAAAGTGGTTGATGTCACATGTCTCAACCTATGCTTTCTTAATTTAAGCAATTGTTCCTCTTTGGAAATTTTGAAGTTAGAGTGTCCAAAATTGACCAGTCTATTCCTTCAGTCTTGCAATATTGACGATGAAGCTGTTGAAGCTGCTATATCAAAATGCACTATGCTGGAGACTCTTGACGTTCGCTTTTGTCCAAAGATAAGCTCAATAAGCATGGGAAGATTACGCACAATTTGTTCAAGTTTGAAGCGAATATTTAGCAGTTAG
Predicted protein sequences of Glyma.04g055700
>Glyma.04g055700.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g055700.1 locus=Glyma.04g055700 id=Glyma.04g055700.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g055700.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g055700.2 locus=Glyma.04g055700 id=Glyma.04g055700.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g055700.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g055700.3 locus=Glyma.04g055700 id=Glyma.04g055700.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MWCSSLGGPHCIVKCSNAGKSSASVDEFVDYDNFQRSSLRSNDDDALRSMSAGEESNFDEGDDSDISKVDDLEVKMDLTDDLLHMVFSFLDHPNLCKAARVCKQWWTASAHEVFWKSLNFEDRSISVEQFEDICRRYPNIMAIRMSGPACNQLVMKAISSLRNLEALTLGRAHIMDNFFHALADCSMLKRLTINDAILGSGIQEISVNHDRLCHLQLTKCRVMRIAVRCPQLETMSLKRSNMAQTALNCPLLQELDIGSCHKLPDSAIRSAVTSCSQLVSLDMSNCSSVSDETLREISMNCANLSFLDASYCPNLFLETVRLPMLTVLKLHSCDGITAASMAAISHSYMLEVLELDNCSLLTSVSLDLPRLQNIRLVHCRKFADLNLMTLTLSSILVSNCPVLHRINITSNSLQKLTIPKQDSLTTLALQCQSLQEVDLSECESLNNSVCNVFNDGGGCPMLKSLVLGNCESLTSVQFISTSLISLSLGGCRAITNLELTCPNLEKVILDGCDHLERASFCPVGLLSLNLGICPKLNTLSIEAPFMVSLELKGCGVLSEAFINCPLLASLDASFCSQLTDGCLSATTVSCPLIESLILMSCSSIGSEGLRSLYCLPNLTVLDLSYTFLVNMQPVFDSCLQLKVLKLQACKYLTETSLEPLYKGGALPALQELDLSYGTLCQSAIDELLACCTNLTHVSLNGCVNMHDLNWGSSRGQSDNFPAVNTPSWASSNEIISESSEHSARLLQNLYCVGCPNIRKVVIPLRENCFHLLFLNLSLSANLKVVDVTCLNLCFLNLSNCSSLEILKLECPKLTSLFLQSCNIDDEAVEAAISKCTMLETLDVRFCPKISSISMGRLRTICSSLKRIFSS*

>Glyma.04g055700.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g055700.5 locus=Glyma.04g055700 id=Glyma.04g055700.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MERNRRRSDGESSSVSAEDTRRKRARVYFDFDGPHCIVKCSNAGKSSASVDEFVDYDNFQRSSLRSNDDDALRSMSAGEESNFDEGDDSDISKVDDLEVKMDLTDDLLHMVFSFLDHPNLCKAARVCKQWWTASAHEVFWKSLNFEDRSISVEQFEDICRRYPNIMAIRMSGPACNQLVMKAISSLSGIQEISVNHDRLCHLQLTKCRVMRIAVRCPQLETMSLKRSNMAQTALNCPLLQELDIGSCHKLPDSAIRSAVTSCSQLVSLDMSNCSSVSDETLREISMNCANLSFLDASYCPNLFLETVRLPMLTVLKLHSCDGITAASMAAISHSYMLEVLELDNCSLLTSVSLDLPRLQNIRLVHCRKFADLNLMTLTLSSILVSNCPVLHRINITSNSLQKLTIPKQDSLTTLALQCQSLQEVDLSECESLNNSVCNVFNDGGGCPMLKSLVLGNCESLTSVQFISTSLISLSLGGCRAITNLELTCPNLEKVILDGCDHLERASFCPVGLLSLNLGICPKLNTLSIEAPFMVSLELKGCGVLSEAFINCPLLASLDASFCSQLTDGCLSATTVSCPLIESLILMSCSSIGSEGLRSLYCLPNLTVLDLSYTFLVNMQPVFDSCLQLKVLKLQACKYLTETSLEPLYKGGALPALQELDLSYGTLCQSAIDELLACCTNLTHVSLNGCVNMHDLNWGSSRGQSDNFPAVNTPSWASSNEIISESSEHSARLLQNLYCVGCPNIRKVVIPLRENCFHLLFLNLSLSANLKVVDVTCLNLCFLNLSNCSSLEILKLECPKLTSLFLQSCNIDDEAVEAAISKCTMLETLDVRFCPKISSISMGRLRTICSSLKRIFSS*






Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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