SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.04g013200

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm04
Start:1001540
stop:1009001
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.04g013200
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G34450.1AT JGI N/AIEA
GO:0006886GO-bp intracellular protein transport JGI N/AIEA
GO:0016192GO-bp vesicle-mediated transport JGI N/AIEA
GO:0030117GO-cc membrane coat JGI N/AIEA
GO:0030126GO-cc COPI vesicle coat JGI N/AIEA
GO:0005198GO-mf structural molecule activity JGI N/AIEA
K17267KEGG Exosome JGI N/AIEA
PTHR10261PantherFam COATOMER SUBUNIT GAMMA JGI N/AIEA
PTHR10261:SF5PantherFam COATOMER SUBUNIT GAMMA-1 JGI N/AIEA
PF01602Pfam Adaptin N terminal region JGI N/AIEA
PF08752Pfam Coatomer gamma subunit appendage platform subdomain JGI N/AIEA
PF16381Pfam Coatomer subunit gamma-1 C-terminal appendage platform JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.04g013200 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma04g01470 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.04g013200
>Glyma.04g013200.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g013200.1.p locus=Glyma.04g013200 id=Glyma.04g013200.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g013200.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g013200.2.p locus=Glyma.04g013200 id=Glyma.04g013200.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCTCAGCCGCTTGTGAAGAAAGACGATGACCGCGACGACGAAGCTGACTATTCCCCCTTTCTTGGAATTGAAAAGGGGTCTGTTCTTCAGGAGGCCAGGGTTTTTAATGACCCTCAACTAGATGCTAGGAGATGTTCACAGGTTATTACAAAACTCCTATACCTACTGAATCAGGGAGAGACGTTTACAAAGGTTGAAGCCACAGAAGTTTTCTTTGCTGTGACTAAGCTTTTCCAGTCTAAAGATACGGGATTAAGGAGAATGGTCTACCTGATGATAAAGGAGATCTCTCCCTCTGCAGATGAGGTTATCATCGTCACAAGCTCTCTCATGAAGGATATGAACAGCAAGATTGATATGTACCGAGCAAATGCCATTCGAGTGCTGTGTCGTATCACTGACGGAACCCTCCTTTCACAAATTGAGAGGTATTTAAAACAAGCCATTGTAGATAAAAATCCAGTTGTTGCAAGTGCTGCTCTAGTTAGTGGCATTCATCTACTCCAGACAAATCCTGAAATTGTAAAAAGATGGAGCAATGAGGTTCAGGAAGCTGTTCAATCAAGAGCAGCCCTTGTACAATTTCATGCACTGGGTTTGCTGCATCAGAATGACCGGCTAGCAGTTAGCAAGCTGGTTACCAGCTTGACCAGGGGAACTGTTCGCTCACCTTTAGCGCAGTGCCTTTTGATCCGTTACACAAGTCAGGTTATTCATGAATCAGGCCATACACAGTCAGGGGAACGCCCCTTCTATGATTATCTTGAGAGTTGCCTTCGCCACAAGTCAGACATGGTGATTTTTGAAGCTGCCAGGGCAATAACAGAGCTCAATGGTGTAACAAGCCGAGAATTAACTCCAGCGATTACTGTTCTTCAGCTATTCTTAAGTTCGACTAAGCCAGTCTTGAGATTTGCTGCTGTCCGCACCTTGAACAAGGTGGCAATGACGCATCCAATGGCAGTCACCAACTGCAACATTGATATGGAAAGTTTAATCTCTGACCAGAACAGAAGCATTGCTACCCTCGCTATTACTACACTTTTGAAAACAGGAAATGAATCTAGTGTGGATCGTCTTATGAAGCAGATCACAAATTTCATGTCTGATATTGCTGATGAGTTCAAAATTGTTGTTGTTGAAGCAATAAGATCATTGTGCCTGAAGTTTCCTTTAAAATATCGATCTCTGATGAATTTCCTGAGTAATATTCTTAGGGAGGAAGGTGGTTTTGATTACAAGAAGGCAATTGTAGATTCAATTGTGATTCTCATTAGAGATATCCCTAATGCAAAGGAAGCTGGGTTGCTTCATCTTTGTGAGTTCATAGAAGATTGTGAGTTCACTTATTTGTCCACACAGATACTTCACTTCCTGGGAATTGAAGGACCAAAAACATCAGACCCGAGCAAATATATCCGTTACATTTATAATAGAGTACATCTTGAGAATGCAATTGTTAGGGCCAGTGCTGTGAGCACACTGGCAAAATTTGGTGCTGCTGTTGATGCGCTAAAGCCCCGCATATTTGTTCTGCTAAGGCGATGCCTTTTTGACAGTGATGATGAGGTTCGTGATAGGGCAACACTTTACCTGAACACACTTGGAGGTGATGGTTCAGTTGTTGAGACTGATAAAGATGTAAAGGACTTCCTGTTTGGGCCATTTGATGTCCCACTTGTCAATCTGGAGACTAGTTTGAAAAATTATGAGCCTTCAGAAGAAGCTTTTGACATTAACTCTGTGCCTAAGGAGGTCAAGTTCCAGCCTCTTGCAGAAAAGAAAGCCCCTGGTAAAAAGCCAACTGGTTTGGGTGCTCCCCCAAGTGGTCCCCCATCAACTGCAGATGCATATGAGAGGATGCTTTCAACCATTCCAGAGTGTGCAAACTTTGGGAAGCTTTTCAAGTCCTCAGCACCTGTGGAGCTCACTGAAGCTGAGACAGAATATGCAGTTAATGTCATTAAACACATTTTTGATAGGCATGTTGTGTTCCAGTACAACTGCACAAACACGATACCAGAGCAATTGTTGGAAGATGTTATTGTGACTGTGGATGCTTCAGATGCAGATGAATTCTCAGAGGTGTTCTCCAAGCCTCTCAGGTCTCTTCCTTATGATTCACCTGGACAGACTTTTGTGGCATTTGAGAAGCCAGAGGGAGTGCCAACAGTTGGAAAATTTTCTAACGTTCTGAAATTTATTATTAAAGAGGTTGACCCAACCACGGGTGAGGCTGAAGATGACGGTGTTGAAGATGAATACCAGCTGGAGGATCTGGAGATTGTTGCAGCAGATTATGTGTTGAAAGTGGGGGTGTCTAATTTTAGGAATGCATGGGAAAGCTTGGGCCCTGATTTTGAGCGTGTGGATGAGTATGGTCTTGGTCCTAGAGAGAGTTTGGCTGAAGCTGTAAATACTGTTATCAACCTACTTGGCTTGGAGCCTTGTGAGGGCACAGAGGAGGTTCCACCCAATTCAAGATCACACACATGCTTATTGTCGGGTGTATTCACAGGGAATATAAAGGTGCTTGTACGGTTGTCTTTTGGACTTGATGGTCCAAAGGATATTGCAATGAAATTGTCTGTCAGATCTGAGGACGAAACTGTCAGCGATACCATTCATGAGATTGTGGCAAGCGGCTAG

>Glyma.04g013200.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g013200.3.p locus=Glyma.04g013200 id=Glyma.04g013200.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGTCTACCTGATGATAAAGGAGATCTCTCCCTCTGCAGATGAGGTTATCATCGTCACAAGCTCTCTCATGAAGGATATGAACAGCAAGATTGATATGTACCGAGCAAATGCCATTCGAGTGCTGTGTCGTATCACTGACGGAACCCTCCTTTCACAAATTGAGAGGTATTTAAAACAAGCCATTGTAGATAAAAATCCAGTTGTTGCAAGTGCTGCTCTAGTTAGTGGCATTCATCTACTCCAGACAAATCCTGAAATTGTAAAAAGATGGAGCAATGAGGTTCAGGAAGCTGTTCAATCAAGAGCAGCCCTTGTACAATTTCATGCACTGGGTTTGCTGCATCAGATACGACAGAATGACCGGCTAGCAGTTAGCAAGCTGGTTACCAGCTTGACCAGGGGAACTGTTCGCTCACCTTTAGCGCAGTGCCTTTTGATCCGTTACACAAGTCAGGTTATTCATGAATCAGGCCATACACAGTCAGGGGAACGCCCCTTCTATGATTATCTTGAGAGTTGCCTTCGCCACAAGTCAGACATGGTGATTTTTGAAGCTGCCAGGGCAATAACAGAGCTCAATGGTGTAACAAGCCGAGAATTAACTCCAGCGATTACTGTTCTTCAGCTATTCTTAAGTTCGACTAAGCCAGTCTTGAGATTTGCTGCTGTCCGCACCTTGAACAAGGTGGCAATGACGCATCCAATGGCAGTCACCAACTGCAACATTGATATGGAAAGTTTAATCTCTGACCAGAACAGAAGCATTGCTACCCTCGCTATTACTACACTTTTGAAAACAGGAAATGAATCTAGTGTGGATCGTCTTATGAAGCAGATCACAAATTTCATGTCTGATATTGCTGATGAGTTCAAAATTGTTGTTGTTGAAGCAATAAGATCATTGTGCCTGAAGTTTCCTTTAAAATATCGATCTCTGATGAATTTCCTGAGTAATATTCTTAGGGAGGAAGGTGGTTTTGATTACAAGAAGGCAATTGTAGATTCAATTGTGATTCTCATTAGAGATATCCCTAATGCAAAGGAAGCTGGGTTGCTTCATCTTTGTGAGTTCATAGAAGATTGTGAGTTCACTTATTTGTCCACACAGATACTTCACTTCCTGGGAATTGAAGGACCAAAAACATCAGACCCGAGCAAATATATCCGTTACATTTATAATAGAGTACATCTTGAGAATGCAATTGTTAGGGCCAGTGCTGTGAGCACACTGGCAAAATTTGGTGCTGCTGTTGATGCGCTAAAGCCCCGCATATTTGTTCTGCTAAGGCGATGCCTTTTTGACAGTGATGATGAGGTTCGTGATAGGGCAACACTTTACCTGAACACACTTGGAGGTGATGGTTCAGTTGTTGAGACTGATAAAGATGTAAAGGACTTCCTGTTTGGGCCATTTGATGTCCCACTTGTCAATCTGGAGACTAGTTTGAAAAATTATGAGCCTTCAGAAGAAGCTTTTGACATTAACTCTGTGCCTAAGGAGGTCAAGTTCCAGCCTCTTGCAGAAAAGAAAGCCCCTGGTAAAAAGCCAACTGGTTTGGGTGCTCCCCCAAGTGGTCCCCCATCAACTGCAGATGCATATGAGAGGATGCTTTCAACCATTCCAGAGTGTGCAAACTTTGGGAAGCTTTTCAAGTCCTCAGCACCTGTGGAGCTCACTGAAGCTGAGACAGAATATGCAGTTAATGTCATTAAACACATTTTTGATAGGCATGTTGTGTTCCAGTACAACTGCACAAACACGATACCAGAGCAATTGTTGGAAGATGTTATTGTGACTGTGGATGCTTCAGATGCAGATGAATTCTCAGAGGTGTTCTCCAAGCCTCTCAGGTCTCTTCCTTATGATTCACCTGGACAGACTTTTGTGGCATTTGAGAAGCCAGAGGGAGTGCCAACAGTTGGAAAATTTTCTAACGTTCTGAAATTTATTATTAAAGAGGTTGACCCAACCACGGGTGAGGCTGAAGATGACGGTGTTGAAGATGAATACCAGCTGGAGGATCTGGAGATTGTTGCAGCAGATTATGTGTTGAAAGTGGGGGTGTCTAATTTTAGGAATGCATGGGAAAGCTTGGGCCCTGATTTTGAGCGTGTGGATGAGTATGGTCTTGGTCCTAGAGAGAGTTTGGCTGAAGCTGTAAATACTGTTATCAACCTACTTGGCTTGGAGCCTTGTGAGGGCACAGAGGAGGTTCCACCCAATTCAAGATCACACACATGCTTATTGTCGGGTGTATTCACAGGGAATATAAAGGTGCTTGTACGGTTGTCTTTTGGACTTGATGGTCCAAAGGATATTGCAATGAAATTGTCTGTCAGATCTGAGGACGAAACTGTCAGCGATACCATTCATGAGATTGTGGCAAGCGGCTAG

>Glyma.04g013200.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.04g013200.4.p locus=Glyma.04g013200 id=Glyma.04g013200.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGGCTCAGCCGCTTGTGAAGAAAGACGATGACCGCGACGACGAAGCTGACTATTCCCCCTTTCTTGGAATTGAAAAGGGGTCTGTTCTTCAGGAGGCCAGGGTTTTTAATGACCCTCAACTAGATGCTAGGAGATGTTCACAGGTTATTACAAAACTCCTATACCTACTGAATCAGGGAGAGACGTTTACAAAGGTTGAAGCCACAGAAGTTTTCTTTGCTGTGACTAAGCTTTTCCAGTCTAAAGATACGGGATTAAGGAGAATGGTCTACCTGATGATAAAGGAGATCTCTCCCTCTGCAGATGAGGTTATCATCGTCACAAGCTCTCTCATGAAGGATATGAACAGCAAGATTGATATGTACCGAGCAAATGCCATTCGAGTGCTGTGTCGTATCACTGACGGAACCCTCCTTTCACAAATTGAGAGGTATTTAAAACAAGCCATTGTAGATAAAAATCCAGTTGTTGCAAGTGCTGCTCTAGTTAGTGGCATTCATCTACTCCAGACAAATCCTGAAATTGTAAAAAGATGGAGCAATGAGGTTCAGGAAGCTGTTCAATCAAGAGCAGCCCTTGTACAATTTCATGCACTGGGTTTGCTGCATCAGATACGACAGAATGACCGGCTAGCAGTTAGCAAGCTGGTTACCAGCTTGACCAGGGGAACTGTTCGCTCACCTTTAGCGCAGTGCCTTTTGATCCGTTACACAAGTCAGGTTATTCATGAATCAGGCCATACACAGTCAGGGGAACGCCCCTTCTATGATTATCTTGAGAGTTGCCTTCGCCACAAGTCAGACATGGTGATTTTTGAAGCTGCCAGGGCAATAACAGAGCTCAATGGTGTAACAAGCCGAGAATTAACTCCAGCGATTACTGTTCTTCAGCTATTCTTAAGTTCGACTAAGCCAGTCTTGAGATTTGCTGCTGTCCGCACCTTGAACAAGGTGGCAATGACGCATCCAATGGCAGTCACCAACTGCAACATTGATATGGAAAGTTTAATCTCTGACCAGAACAGAAGCATTGCTACCCTCGCTATTACTACACTTTTGAAAACAGGAAATGAATCTAGTGTGGATCGTCTTATGAAGCAGATCACAAATTTCATGTCTGATATTGCTGATGAGTTCAAAATTGTTGTTGTTGAAGCAATAAGATCATTGTGCCTGAAGTTTCCTTTAAAATATCGATCTCTGATGAATTTCCTGAGTAATATTCTTAGGGAGGAAGGTGGTTTTGATTACAAGAAGGCAATTGTAGATTCAATTGTGATTCTCATTAGAGATATCCCTAATGCAAAGGAAGCTGGGTTGCTTCATCTTTGTGAGTTCATAGAAGATTGTGAGTTCACTTATTTGTCCACACAGATACTTCACTTCCTGGGAATTGAAGGACCAAAAACATCAGACCCGAGCAAATATATCCGTTACATTTATAATAGAGTACATCTTGAGAATGCAATTGTTAGGGCCAGTGCTGTGAGCACACTGGCAAAATTTGGTGCTGCTGTTGATGCGCTAAAGCCCCGCATATTTGTTCTGCTAAGGCGATGCCTTTTTGACAGTGATGATGAGGTTCGTGATAGGGCAACACTTTACCTGAACACACTTGGAGGTGATGGTTCAGTTGTTGAGACTGATAAAGATGTAAAGGACTTCCTGTTTGGGCCATTTGATGTCCCACTTGTCAATCTGGAGACTAGTTTGAAAAATTATAAGAAGCTTTTGACATTAACTCTGTGCCTAAGGAGGTCAAGTTCCAGCCTCTTGCAGAAAAGAAAGCCCCTGGTAAAAAGCCAACTGGTTTGGGTGCTCCCCCAAGTGGTCCCCCATCAACTGCAGATGCATATGAGAGGATGCTTTCAACCATTCCAGAGTGTGCAAACTTTGGGAAGCTTTTCAAGTCCTCAGCACCTGTGGAGCTCACTGAAGCTGAGACAGAATATGCAGTTAATGTCATTAAACACATTTTTGATAGGCATGTTGTGTTCCAGTACAACTGCACAAACACGATACCAGAGCAATTGTTGGAAGATGTTATTGTGA
Predicted protein sequences of Glyma.04g013200
>Glyma.04g013200.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g013200.1 locus=Glyma.04g013200 id=Glyma.04g013200.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g013200.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g013200.2 locus=Glyma.04g013200 id=Glyma.04g013200.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.04g013200.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g013200.3 locus=Glyma.04g013200 id=Glyma.04g013200.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MVYLMIKEISPSADEVIIVTSSLMKDMNSKIDMYRANAIRVLCRITDGTLLSQIERYLKQAIVDKNPVVASAALVSGIHLLQTNPEIVKRWSNEVQEAVQSRAALVQFHALGLLHQIRQNDRLAVSKLVTSLTRGTVRSPLAQCLLIRYTSQVIHESGHTQSGERPFYDYLESCLRHKSDMVIFEAARAITELNGVTSRELTPAITVLQLFLSSTKPVLRFAAVRTLNKVAMTHPMAVTNCNIDMESLISDQNRSIATLAITTLLKTGNESSVDRLMKQITNFMSDIADEFKIVVVEAIRSLCLKFPLKYRSLMNFLSNILREEGGFDYKKAIVDSIVILIRDIPNAKEAGLLHLCEFIEDCEFTYLSTQILHFLGIEGPKTSDPSKYIRYIYNRVHLENAIVRASAVSTLAKFGAAVDALKPRIFVLLRRCLFDSDDEVRDRATLYLNTLGGDGSVVETDKDVKDFLFGPFDVPLVNLETSLKNYEPSEEAFDINSVPKEVKFQPLAEKKAPGKKPTGLGAPPSGPPSTADAYERMLSTIPECANFGKLFKSSAPVELTEAETEYAVNVIKHIFDRHVVFQYNCTNTIPEQLLEDVIVTVDASDADEFSEVFSKPLRSLPYDSPGQTFVAFEKPEGVPTVGKFSNVLKFIIKEVDPTTGEAEDDGVEDEYQLEDLEIVAADYVLKVGVSNFRNAWESLGPDFERVDEYGLGPRESLAEAVNTVINLLGLEPCEGTEEVPPNSRSHTCLLSGVFTGNIKVLVRLSFGLDGPKDIAMKLSVRSEDETVSDTIHEIVASG*

>Glyma.04g013200.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.04g013200.4 locus=Glyma.04g013200 id=Glyma.04g013200.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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