Glyma.03g242400

Report for Sequence Feature Glyma.03g242400

Feature Type:	gene_model
Chromosome:	Gm03
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Source:	JGI
Version:	Wm82.a4.v1
High confidence:	yes

Annotations for Glyma.03g242400

Database ID	Annotation Type	Annotation Description	Annotation Source	Match Score	Evidence Code
AT3G06350.1	AT	EMB3004,MEE32	JGI	N/A	IEA
1.1.1.25	EC	shikimate dehydrogenase	JGI	N/A	IEA
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GO:0004764	GO-mf	shikimate 3-dehydrogenase (NADP+) activity	JGI	N/A	IEA
K13832	KEGG	Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis	JGI	N/A	IEA
KOG0692	KOG	Pentafunctional AROM protein	JGI	N/A	IEA
PTHR21089	PantherFam	SHIKIMATE DEHYDROGENASE	JGI	N/A	IEA
PTHR21089:SF10	PantherFam	DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE/SHIKIMATE DEHYDROGENASE	JGI	N/A	IEA
PF01487	Pfam	Type I 3-dehydroquinase	JGI	N/A	IEA
PF08501	Pfam	Shikimate dehydrogenase substrate binding domain	JGI	N/A	IEA

Gene model name correspondences to Glyma.03g242400 Gene Call Version Wm82.a4.v1

Corresponding Name	Annotation Version	Evidence	Comments
Glyma03g40236	Wm82.a1.v1.1	IGC	As supplied by JGI

Coding sequences of Glyma.03g242400

Limit To All Plant Sequences

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>Glyma.03g242400.11 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g242400.11.p locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.11.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.12 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g242400.12.p locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.12.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.13 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g242400.13.p locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.13.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g242400.5.p locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g242400.6.p locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.9 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g242400.9.p locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.9.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.03g242400

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.03g242400.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.1 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.10 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.10.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.11 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.11.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.12.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.12 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.12.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.13.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.13 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.13.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.14.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.14 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.14.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.15.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.15 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.15.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.16.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.16 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.16.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.17.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.17 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.17.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.4 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.5 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g242400.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g242400.6 locus=Glyma.03g242400 id=Glyma.03g242400.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA

U.S. Public Domain