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Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G04010.1 | AT | phospholipid sterol acyl transferase 1 | JGI | N/A | IEA |
GO:0006629 | GO-bp | lipid metabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0006629 | GO-bp | lipid metabolic process | JGI | N/A | IEA |
GO:0008374 | GO-mf | O-acyltransferase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0008374 | GO-mf | O-acyltransferase activity | JGI | N/A | IEA |
KOG2369 | KOG | Lecithin:cholesterol acyltransferase (LCAT)/Acyl-ceramide synthase | JGI | N/A | IEA |
PTHR11440 | Panther | LECITHIN-CHOLESTEROL ACYLTRANSFERASE-RELATED | JGI | N/A | IEA |
PTHR11440:SF7 | Panther | PHOSPHOLIPID--STEROL O-ACYLTRANSFERASE | JGI | N/A | IEA |
PF02450 | PFAM | Lecithin:cholesterol acyltransferase | JGI | N/A | IEA |
GN7V-68087 | SoyCyc9-rxn | Phospholipid:diacylglycerol acyltransferase | Plant Metabolic Network | ISS |
Glyma.03g165500 not represented in the dataset |
Glyma.03g165500 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.19g166800 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma03g32251 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.03g165500.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g165500 ID=Glyma.03g165500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g165500.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g165500 ID=Glyma.03g165500.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g165500.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g165500 ID=Glyma.03g165500.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g165500.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g165500 ID=Glyma.03g165500.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g165500.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g165500.1.p locus=Glyma.03g165500 ID=Glyma.03g165500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g165500.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g165500.5.p locus=Glyma.03g165500 ID=Glyma.03g165500.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||