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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G06150.1 | AT | basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
AT1G06150.2 | AT | basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
GO:0006355 | GO-bp | regulation of transcription, DNA-templated | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0006468 | GO-bp | protein phosphorylation | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0035556 | GO-bp | intracellular signal transduction | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0005829 | GO-cc | cytosol | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0004674 | GO-mf | protein serine/threonine kinase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0046983 | GO-mf | protein dimerization activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
PTHR13902 | Panther | SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE WNK (WITH NO LYSINE)-RELATED | JGI | N/A | IEA |
PTHR13902:SF31 | Panther | JGI | N/A | IEA |
Glyma.03g161800 not represented in the dataset |
Glyma.03g161800 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.19g163300 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma03g31876 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.03g161800.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g161800 ID=Glyma.03g161800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g161800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g161800.1.p locus=Glyma.03g161800 ID=Glyma.03g161800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||