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Report for Sequence Feature Glyma.03g137400

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm03
Start:35358023
stop:35370577
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.03g137400
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT2G41830.1AT Uncharacterized protein JGI N/AIEA
GO:0005488GO-mf binding EnsemblGenomesN/AIEA
KOG1877 KOG Putative transmembrane protein cmp44E JGI N/AIEA
PTHR12444Panther UNCHARACTERIZED JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.03g137400
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.03g137400 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma03g29390 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.03g137400
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>Glyma.03g137400.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.03g137400
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>Glyma.03g137400.11 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g137400.11.p locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.13 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g137400.13.p locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g137400.3.p locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g137400.5.p locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g137400.6.p locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g137400.7.p locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.03g137400
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>Glyma.03g137400.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g137400.11 locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.12.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g137400.12 locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.13.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g137400.13 locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g137400.2 locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g137400.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g137400.3 locus=Glyma.03g137400 ID=Glyma.03g137400.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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