Report for Sequence Feature Glyma.03g118400
| Feature Type: | gene_model |
| Chromosome: | Gm03 |
| Start: | 34091657 |
| stop: | 34112672 |
| Source: | JGI |
| Version: | Wm82.a4.v1 |
| High confidence: | yes |
| 
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Annotations for Glyma.03g118400
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|
| AT1G02080.2 | AT |
|
JGI | N/A | IEA |
| K12604 | KEGG |
Messenger RNA biogenesis |
JGI | N/A | IEA |
| PTHR13162 | PantherFam |
CCR4-NOT TRANSCRIPTION COMPLEX |
JGI | N/A | IEA |
| PTHR13162:SF8 | PantherFam |
CCR4-NOT TRANSCRIPTION COMPLEX SUBUNIT 1 |
JGI | N/A | IEA |
| PF04054 | Pfam |
CCR4-Not complex component, Not1 |
JGI | N/A | IEA |
| PF12842 | Pfam |
Domain of unknown function (DUF3819) |
JGI | N/A | IEA |
| PF16415 | Pfam |
CCR4-NOT transcription complex subunit 1 CAF1-binding domain |
JGI | N/A | IEA |
| PF16417 | Pfam |
CCR4-NOT transcription complex subunit 1 TTP binding domain |
JGI | N/A | IEA |
| PF16418 | Pfam |
CCR4-NOT transcription complex subunit 1 HEAT repeat |
JGI | N/A | IEA |
Gene model name correspondences to Glyma.03g118400 Gene Call Version Wm82.a4.v1
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|
| Glyma03g27270 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
Coding sequences of Glyma.03g118400
>Glyma.03g118400.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g118400.1.p locus=Glyma.03g118400 id=Glyma.03g118400.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCCATGCATCCGATCGAATGACAGCAAAAGTAACCTTCTTCTTCTCACTCAAATCTCACGCAGTCTCTGTTCCAATTTCAGCTTCCCTATGATGACTCATTATCATTCCTTGCCCACCATGGCCAACACTTCCTCCAACCATATTCGCTTTCTCCTCAGCACCTTGAACGAAGTCAACTTTGACTCCGTTTTCCATCAACTCTCTCAGTTCACGGAATTTGGAACTACTGGATGCATTTTGCTGCTTCAAACTTGCTTGGATCACTATGGTTATGTCAGAAGAGATATGAAAGATGTGCAGCATGAACCAATTCTTGGGGCAGTCATTAAGCACCTCTTGGACAAACCAAACTTCAGCACAGTGTTTTCTGAGTCAATGAAGAATATAGAAATTAATGAAAGCTTTTTAGAAAGTTTTTGCAATGGATTGCAGTTATCTTTATTGGAAAAAATTATAAGCAGTCTTGCTTTATCTGATTCTGAGAATTCCGATGTCAGGCTGTGTGGCAAAATTTTTTGCATGGCTCAAATTGAGGAATTGTGTGCCAACCCCGGTTATCTGAGTTTCCATGAGCAAATTCACAATGTTATCATGTTCCTAAAGCAGTCTGAGGGTCTTTCCAAGCACGTGGATTCCTTTATGCAGATATTGTCACTTGTGCAGTTCAAAGACACACCACCTTTTGTCTTGACTCCATTGCTTCCTGATGAGATGCATGAGGCTGATTTTTTAAGGAATATGGAGTTGTTCCATGACAGTGGAGAAAATGATTTTGATGCTATTTTGGCTGACATACAGAAGGAAATGAACATGGGTGATATCGTGAAGGAACTAGGCTATGGATGCACGGTGGATGTCTCACAGTGCAAGGAAATATTTTCACTCTTCTTACCTTTAACTGAAAATACACTCTCTAAATTGCTTGGTGCTATTGCTTGTACCCATATTGGGCTGGAGGACAACCAAAACACATACTTAACTTTTCGTGCAGCCCATGGATACAATGTGCCTGAGTTGCCACCGCTGAACTCTTGGAATATTGATGTCTTGATTGATACACTTAAGCATCTTGCACCTCATACTAATTGGGTACGTGTTATTGAAAACCTTGATCATGAAGGGTTTTTTCTTCCTAGTGAAGAAGCGTTCTCTTTTCTCATGTCTGTATATAAGCATGCCTGTAAGGAACCATTTCCTCTCCATGCCATCTGTGGGCCAGTCTGGAAGAATACTGAGGGTCAGCTGTCTTTCCTTAAATATGCTGTATCAGCACCACCGGAAATTTTTACCTTTGCACACTCGGGAAGGCAGCTGGCATATGTTGATGCAATTAATGGCCACAAGCTTCAAAATGGACATGCAAATCATGCATGGCTGTGTCTTGATCTTTTAGATGTCCTCTGCCAGCTAGCTGAAAAGGGTCATGCCAGTATTGTTCGATCAATCTTTGATTATCCCCTTAAACACTGTCCTGAAGTTTTGCTTCTTGGGCTGGCACATATTAATACTGCCTACAACCTCTTGCAGCAGGAAGTATCTCTGATTGTTTTTCTCATGATTGTAAAAAGTGGTGTAGGCAGTGGGATGATTCTACACCTTTGGCATGTTAATCCCAATCTGGTATTGAGAGGGTTTGTTGATTCTCAAAACAATGATGCAGACAGCATTGTAAGAATTGTGGACATCTGCCAGGAGCTAAAGATTCTATCATCTGTGGTGGAAATCATGCCCTCTTATTATAGTATAAGGTTAGCAGCTGTAGCATCAAGAAAAGAATTTCTTGACCTTGAGAAGTGGTTGAGTAGCAACTTAACTACATACAAGGAAGCCTTTTTTGAGGAGTGCCTCAAGTTCTTAAAGGATTCCCATTTTGGTGGATCACAGAACCTTTCTGGCAAATCGTTTCATCAGTCTGGTGCTATTCTGAGTCTATATGCTGAGGCAGCTGCTACCATCTTGAAGGTTCTTAAATCTCACACCGACTTGGTTGCTTCTAGACAACTTTCTGAGGAGTTGGAGAGACTGCACGTATCTATTATAGATACGAATCCAAGGCTTCAAAATGGTGGGACAGCTGATTCATCTACTTCTGATGGATATGCGGATGACATTGAAGCTGAAGCAAACTCTTACTTCCATCAAATGTTTTCTGATCAGTTAACCATTAATGCAATGGTACAGATGCTCGCTCGATTCAAGGAATCTTCAGTGAAGAGGGAGAAATCAATTTTTGAATGCATGATTGCAAACTTGTTTGAGGAGTATAGATTTTTCCCAAAGTATCCTGAAAGGCAACTCAAAATTGCTGCAGTTCTCTTTGGTTCTGTGATCAAGCATCAGCTTGTAACTCATCTATCTTTGGGGATTGCTCTTCGTTATGTTCTTGATGCATTGCGCAAGCCTGCAGATTCGAAAATGTTTTTGTTTGGAAGTCTGGCATTGGAACAGTTTGTGGATCGTCTTATTGAGTGGCCTCAGTATTGCAATCATATTCTTCAAATTTCTCATTTGCGCAGTACACATTCAGAAATAGTTTCTTTCATTGAGCAGGCTCTCGCCAGGATTTCCTCTGGTCATTTGGATGTTGATGGGGCGAGTCATGCTTCTGTTATTAGTAACCATCATTCTGCACAGGCTACAATAGGACATGTGGAGCTCAGTGGCTCTAGTGTTATACAACCTGGGCAGCAACATTTGTCACTGCAGCTTCAACAGAGACGTGAAAATCCCTTGGATGATCGTCACAAAGCTTCTGTTGGTTCATCTACTGATGTAAAGCCATTGTTATCTTCTCTAGGGAAATCTTCAGTACTAACACCTACCGATGCTTCTAGTACCAATAAGTTACATAGCACAGTTAGCACTTCGTCAATGCTATCTTCATCTTCTCCTGGTTTTGTTCGTCCTTCCCGTGGAACTACTTCTGCCAGGTTTGGATCTGCCTTGAACATTGAAACTTTGGTTGCTGCTGCTGAGAAAAGAGAAATTCCTATTGAGGCTCCGGGGTCAGAGGTTCAGGACAAAATATTATTTATTATTAATAATGTTTCGGCTGCTAATGTTGAAGCTAAAGCAAAAGAGTTCACTGAAATTTTGAAAGAGCAGTACTATCCTTGGTTTGCACAGTATATGGTTATGAAAAGAGCAAGCATTGAGCCAAATTTCCATGACTTGTACTTGAAATTCCTGGATAAAGTTAATTCAAAGGCTTTGAACAAAGAGATTGTCCAGGCAACTTATGAAAATTGCAAGGTTCTCTTAGGATCAGAGCTCATAAAATCAAGTTCAGAGGAACGCTCTTTGCTTAAAAATTTGGGGAGCTGGCTTGGAAAGTTAACAATTGGCCGGAATCAGGTTTTGAGGGCTCGTGAAATAGACCCAAAGTCTTTGATTATGGAGGCATATGAGAAGGGGCTAATGATTGCTGTTATTCCATTTACGTCAAAGGTCCTTGAACCATGCCTAAACAGTCTTGCATATCAACCTCCTAATCCTTGGACTATGGGCATTTTGGGATTGCTTGCTGAGATTTATTCAATGCCAAACTTGAAAATGAACCTCAAGTTTGACATAGAGGTTTTATTCAAAAATCTGGGTGTTGATATGAAGGATGTCACACCAACCTCTCTCCTGAAGGATAGAAAAAGAGAATTTGAAGGAAATCCTGATTTCTCTAATAAAGATGTTGGGGGATCTCAATCACAAATGATTACTGATATAAAATCTGGCCTCGTACCTCCAGTAAATCAAGTGGAATTACCACTTGAAGTCACCAATCCATCCAACACGGGGGCTCATCCACATATACTCTCTCAGTATGCCGGGCCTCTTCATATTTCCTCGGGAGCATTGATGGAAGATGAAAAGGTTACACCTCTGGGATTGTCTGATTCACTTCCCTCTGCTCAAGGACTGTTACAAGCAAATCCTGGCCCAGTTCCTTTTTCTATTAGCCAGATTCCAACACAGATACCTAATATTGGGACTCACGTTATTATCAATCAAAAGCTCAGTGGTTTTGGGCTGCAAATGCATTTTCAGAGAGCTGTACCAATTGCAATGGATAGAGCTATCAAAGAGATAGTGTCTAGTATTGTGCAGCGTAGTGTTTCCATAGCAACACAAACAACCAAGGAGCTTGTTTTAAAGGACTATGCCATGGAATCTGATGAGACACGCATATTAAATGCGGCACACTTGATGGTCGCTAGTCTGGCTGGAAGTTTGGCTCATGTTACGTGCAAAGAACCATTACGGGCATCAATATCTGGCCAACTGAGGACTTCACTTCAGAACTTAAATATTGCTAATGAAATTTTGGAGCAAGCTGTGCAACTTGTCACCAATGATAATCTTGATCTAGGCTGTGCAGTCATTGAACAGGCTGCTACCGATAAGGCAATAAACACCATTGATACAGAGATTGGTCAACAACTCTCTTTGAGAAGGAAGCATCGAGAAGGTATGGGTTCTACATTTTTTGATGCAAATTTGTATCCTCAAGGTTCTATGGGTGGTGTTCCAGAGCCTCTTCGCCCCAAGCCTGGTCAGTTGTCCCTCTCACAACAACGTGTCTATGAGGACTTTGTTCGGCTTCCCTGGCAAAGCCAGTCTAGCCCGAGCTCACATTCTATGTCTTCTGGTGTTGCTGTTCAATCTGGCACTGGTCTTACTGGCACCAATGGTTCTGTATCAGGGCAGAGTAACCCTGGATACCCTGTCACCACAGGTTATGAAGGAGTATCTCGACCATTAGATGATATGACAGAATCAAATTTGGCTCCACATTTTAGTGCTTCCTCAATTAACATTAGAGCAGCTGACAGTGTTTCCCAGCATAGTTTGGAGAAAGACTCTGTTGCCTCATTTCCTTCAGCTGCTTCCACCCCTGAATTGCATGCAGTAGATTCTTCTGAAGTGAAAGAATCTGGAACTTCTTCACAGCCACTGGTTACATCAGGTGCTGTGGAGCGCCTTGGAAGTAGTTTTTTGGAGCC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>Glyma.03g118400.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g118400.3.p locus=Glyma.03g118400 id=Glyma.03g118400.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGATGACTCATTATCATTCCTTGCCCACCATGGCCAACACTTCCTCCAACCATATTCGCTTTCTCCTCAGCACCTTGAACGAAGTCAACTTTGACTCCGTTTTCCATCAACTCTCTCAGTTCACGGAATTTGGAACTACTGGATGCATTTTGCTGCTTCAAACTTGCTTGGATCACTATGGTTATGTCAGAAGAGATATGAAAGATGTGCAGCATGAACCAATTCTTGGGGCAGTCATTAAGCACCTCTTGGACAAACCAAACTTCAGCACAGTGTTTTCTGAGTCAATGAAGAATATAGAAATTAATGAAAGCTTTTTAGAAAGTTTTTGCAATGGATTGCAGTTATCTTTATTGGAAAAAATTATAAGCAGTCTTGCTTTATCTGATTCTGAGAATTCCGATGTCAGGCTGTGTGGCAAAATTTTTTGCATGGCTCAAATTGAGGAATTGTGTGCCAACCCCGGTTATCTGAGTTTCCATGAGCAAATTCACAATGTTATCATGTTCCTAAAGCAGTCTGAGGGTCTTTCCAAGCACGTGGATTCCTTTATGCAGATATTGTCACTTGTGCAGTTCAAAGACACACCACCTTTTGTCTTGACTCCATTGCTTCCTGATGAGATGCATGAGGCTGATTTTTTAAGGAATATGGAGTTGTTCCATGACAGTGGAGAAAATGATTTTGATGCTATTTTGGCTGACATACAGAAGGAAATGAACATGGGTGATATCGTGAAGGAACTAGGCTATGGATGCACGGTGGATGTCTCACAGTGCAAGGAAATATTTTCACTCTTCTTACCTTTAACTGAAAATACACTCTCTAAATTGCTTGGTGCTATTGCTTGTACCCATATTGGGCTGGAGGACAACCAAAACACATACTTAACTTTTCGTGCAGCCCATGGATACAATGTGCCTGAGTTGCCACCGCTGAACTCTTGGAATATTGATGTCTTGATTGATACACTTAAGCATCTTGCACCTCATACTAATTGGGTACGTGTTATTGAAAACCTTGATCATGAAGGGTTTTTTCTTCCTAGTGAAGAAGCGTTCTCTTTTCTCATGTCTGTATATAAGCATGCCTGTAAGCAGGAACCATTTCCTCTCCATGCCATCTGTGGGCCAGTCTGGAAGAATACTGAGGGTCAGCTGTCTTTCCTTAAATATGCTGTATCAGCACCACCGGAAATTTTTACCTTTGCACACTCGGGAAGGCAGCTGGCATATGTTGATGCAATTAATGGCCACAAGCTTCAAAATGGACATGCAAATCATGCATGGCTGTGTCTTGATCTTTTAGATGTCCTCTGCCAGCTAGCTGAAAAGGGTCATGCCAGTATTGTTCGATCAATCTTTGATTATCCCCTTAAACACTGTCCTGAAGTTTTGCTTCTTGGGCTGGCACATATTAATACTGCCTACAACCTCTTGCAGCAGGAAGTATCTCTGATTGTTTTTCTCATGATTGTAAAAAGTGGTGTAGGCAGTGGGATGATTCTACACCTTTGGCATGTTAATCCCAATCTGGTATTGAGAGGGTTTGTTGATTCTCAAAACAATGATGCAGACAGCATTGTAAGAATTGTGGACATCTGCCAGGAGCTAAAGATTCTATCATCTGTGGTGGAAATCATGCCCTCTTATTATAGTATAAGGTTAGCAGCTGTAGCATCAAGAAAAGAATTTCTTGACCTTGAGAAGTGGTTGAGTAGCAACTTAACTACATACAAGGAAGCCTTTTTTGAGGAGTGCCTCAAGTTCTTAAAGGATTCCCATTTTGGTGGATCACAGAACCTTTCTGGCAAATCGTTTCATCAGTCTGGTGCTATTCTGAGTCTATATGCTGAGGCAGCTGCTACCATCTTGAAGGTTCTTAAATCTCACACCGACTTGGTTGCTTCTAGACAACTTTCTGAGGAGTTGGAGAGACTGCACGTATCTATTATAGATACGAATCCAAGGCTTCAAAATGGTGGGACAGCTGATTCATCTACTTCTGATGGATATGCGGATGACATTGAAGCTGAAGCAAACTCTTACTTCCATCAAATGTTTTCTGATCAGTTAACCATTAATGCAATGGTACAGATGCTCGCTCGATTCAAGGAATCTTCAGTGAAGAGGGAGAAATCAATTTTTGAATGCATGATTGCAAACTTGTTTGAGGAGTATAGATTTTTCCCAAAGTATCCTGAAAGGCAACTCAAAATTGCTGCAGTTCTCTTTGGTTCTGTGATCAAGCATCAGCTTGTAACTCATCTATCTTTGGGGATTGCTCTTCGTTATGTTCTTGATGCATTGCGCAAGCCTGCAGATTCGAAAATGTTTTTGTTTGGAAGTCTGGCATTGGAACAGTTTGTGGATCGTCTTATTGAGTGGCCTCAGTATTGCAATCATATTCTTCAAATTTCTCATTTGCGCAGTACACATTCAGAAATAGTTTCTTTCATTGAGCAGGCTCTCGCCAGGATTTCCTCTGGTCATTTGGATGTTGATGGGGCGAGTCATGCTTCTGTTATTAGTAACCATCATTCTGCACAGGCTACAATAGGACATGTGGAGCTCAGTGGCTCTAGTGTTATACAACCTGGGCAGCAACATTTGTCACTGCAGCTTCAACAGAGACGTGAAAATCCCTTGGATGATCGTCACAAAGCTTCTGTTGGTTCATCTACTGATGTAAAGCCATTGTTATCTTCTCTAGGGAAATCTTCAGTACTAACACCTACCGATGCTTCTAGTACCAATAAGTTACATAGCACAGTTAGCACTTCGTCAATGCTATCTTCATCTTCTCCTGGTTTTGTTCGTCCTTCCCGTGGAACTACTTCTGCCAGGTTTGGATCTGCCTTGAACATTGAAACTTTGGTTGCTGCTGCTGAGAAAAGAGAAATTCCTATTGAGGCTCCGGGGTCAGAGGTTCAGGACAAAATATTATTTATTATTAATAATGTTTCGGCTGCTAATGTTGAAGCTAAAGCAAAAGAGTTCACTGAAATTTTGAAAGAGCAGTACTATCCTTGGTTTGCACAGTATATGGTTATGAAAAGAGCAAGCATTGAGCCAAATTTCCATGACTTGTACTTGAAATTCCTGGATAAAGTTAATTCAAAGGCTTTGAACAAAGAGATTGTCCAGGCAACTTATGAAAATTGCAAGGTTCTCTTAGGATCAGAGCTCATAAAATCAAGTTCAGAGGAACGCTCTTTGCTTAAAAATTTGGGGAGCTGGCTTGGAAAGTTAACAATTGGCCGGAATCAGGTTTTGAGGGCTCGTGAAATAGACCCAAAGTCTTTGATTATGGAGGCATATGAGAAGGGGCTAATGATTGCTGTTATTCCATTTACGTCAAAGGTCCTTGAACCATGCCTAAACAGTCTTGCATATCAACCTCCTAATCCTTGGACTATGGGCATTTTGGGATTGCTTGCTGAGATTTATTCAATGCCAAACTTGAAAATGAACCTCAAGTTTGACATAGAGGTTTTATTCAAAAATCTGGGTGTTGATATGAAGGATGTCACACCAACCTCTCTCCTGAAGGATAGAAAAAGAGAATTTGAAGGAAATCCTGATTTCTCTAATAAAGATGTTGGGGGATCTCAATCACAAATGATTACTGATATAAAATCTGGCCTCGTACCTCCAGTAAATCAAGTGGAATTACCACTTGAAGTCACCAATCCATCCAACACGGGGGCTCATCCACATATACTCTCTCAGTATGCCGGGCCTCTTCATATTTCCTCGGGAGCATTGATGGAAGATGAAAAGGTTACACCTCTGGGATTGTCTGATTCACTTCCCTCTGCTCAAGGACTGTTACAAGCAAATCCTGGCCCAGTTCCTTTTTCTATTAGCCAGATTCCAACACAGATACCTAATATTGGGACTCACGTTATTATCAATCAAAAGCTCAGTGGTTTTGGGCTGCAAATGCATTTTCAGAGAGCTGTACCAATTGCAATGGATAGAGCTATCAAAGAGATAGTGTCTAGTATTGTGCAGCGTAGTGTTTCCATAGCAACACAAACAACCAAGGAGCTTGTTTTAAAGGACTATGCCATGGAATCTGATGAGACACGCATATTAAATGCGGCACACTTGATGGTCGCTAGTCTGGCTGGAAGTTTGGCTCATGTTACGTGCAAAGAACCATTACGGGCATCAATATCTGGCCAACTGAGGACTTCACTTCAGAACTTAAATATTGCTAATGAAATTTTGGAGCAAGCTGTGCAACTTGTCACCAATGATAATCTTGATCTAGGCTGTGCAGTCATTGAACAGGCTGCTACCGATAAGGCAATAAACACCATTGATACAGAGATTGGTCAACAACTCTCTTTGAGAAGGAAGCATCGAGAAGGTATGGGTTCTACATTTTTTGATGCAAATTTGTATCCTCAAGGTTCTATGGGTGGTGTTCCAGAGCCTCTTCGCCCCAAGCCTGGTCAGTTGTCCCTCTCACAACAACGTGTCTATGAGGACTTTGTTCGGCTTCCCTGGCAAAGCCAGTCTAGCCCGAGCTCACATTCTATGTCTTCTGGTGTTGCTGTTCAATCTGGCACTGGTCTTACTGGCACCAATGGTTCTGTATCAGGGCAGAGTAACCCTGGATACCCTGTCACCACAGGTTATGAAGGAGTATCTCGACCATTAGATGATATGACAGAATCAAATTTGGCTCCACATTTTAGTGCTTCCTCAATTAACATTAGAGCAGCTGACAGTGTTTCCCAGCATAGTTTGGAGAAAGACTCTGTTGCCTCATTTCCTTCAGCTGCTTCCACCCCTGAATTGCATGCAGTAGATTCTTCTGAAGTGAAAGAATCTGGAACTTCTTCACAGCCACTGGTTACATCAGGTGCTGTGGAGCGCCTTGGAAGTAGTTTTTTGGAGCCTTCTCTCACAACAAGAGATGCCCTAGATAAATTCCAAATTGTTGCACAAAAGTTGGAAGCTATGGTCAGCAATGATTCCAGGGATGG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Predicted protein sequences of Glyma.03g118400
>Glyma.03g118400.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g118400.1 locus=Glyma.03g118400 id=Glyma.03g118400.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g118400.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g118400.3 locus=Glyma.03g118400 id=Glyma.03g118400.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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