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Report for Sequence Feature Glyma.03g009200

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm03
Start:898477
stop:915179
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.03g009200
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G00450.1AT CCT,CRP JGI N/AIEA
GO:0006357GO-bp regulation of transcription by RNA polymerase II JGI N/AIEA
GO:0016592GO-cc mediator complex JGI N/AIEA
PTHR13992PantherFam NUCLEAR RECEPTOR CO-REPRESSOR RELATED NCOR JGI N/AIEA
PF09497Pfam Transcription mediator complex subunit Med12 JGI N/AIEA

Proteins Associated with Glyma.03g009200
LocusGene SymbolProtein Name
MED12-1 Mediator Complex 12 gene 1

Gene model name correspondences to Glyma.03g009200 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma03g01153 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.03g009200
>Glyma.03g009200.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g009200.1.p locus=Glyma.03g009200 id=Glyma.03g009200.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.03g009200.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.03g009200.2.p locus=Glyma.03g009200 id=Glyma.03g009200.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
ATGCAAAGGTATCATGCTGGCAGCTGCACTAGTGCAGTTAACAACAGTACAATAGGTGGACCATCTGCTAGGGACCCAGGAAGATCTGATTCACCTTCTTTGCCAGCTAACTTTGCTGTAAGTTCAAGGCGACAACTACCATTAAACCCATACAAGTTGAAGTGTGATAAAGAACCCTTGAACTCTAGGCTTGGGGCACCAGATTTTCATCCCCAAACGCCAAATTGTCCTGAAGAGACTCTGACCAGAGAATATTTGCAATCTGGATACAGGGATACAGTTGAGGGGCTCGAGGAAGCAAGAGAAATTTCACTAACTCAGGTTCCGCATTTTAACAAGAACATTGTTCTTAAATGCAAAGAGGCTATTAGAAAACGTCTGAGGGCCATCAATGAATCTCGTGCTCAGAAGAGGAAGGCTGGTCAAGTATATGGTGTGGCTCTTTCAGGATCACAACTTGGCAGGTCTGGCATTTTCCCTGAACTAAGACCCTGTGGTGAGGACTTCCAGAAGAAATGGATTGAGGGTTTATCTCAGCAGCACAAGCGATTACGCTCTTTGGCTGATCATGTTCCTCATGGTTATAAAAGGGCATCACTTTTAGAGGTTCTTATCAAGAATAATGTTCCATTGCTTAGGGCCACCTGGTTTATCAAGGTTACTTACCTCAATCAGGTTCGACCTGGTTCTGTTGGTATTTCTTCTGGGGCAGCTGACAAGATTCAGCTGTCTCGCTCTGATGTTTGGACCAAAGATGTTATCAATTACTTACAAACACTTGTGGATGAATTTTTGTCAAAGAATGCTTTGCATTCTGCTTCTCATGGTCGAGAGCGATCACCACAAATCCCTTATACTGGCTCACTGCAGAATAAAAATGATCCATTATTATCTGTTTCTGATGGTGAAGGACCATCCTTACATTTTAGATGGTGGTATATTGTGAGGCTTCTGCAATGGCATCATGCTGAAGGGTTGCTTCATTCTTCTCTTGTCATTGATTGGGTGTTTAATCAACTACAGGAAAAAGAACTGCTTGAGGTTTGGCAGCTGTTATTGCCTATTATATACGGTTTTTTAGAAACTATTGTCCTGTCTCAATCTTATGTACGCACTCTTGCTGGATTAGCTCTTCGTGTCATTCGTGATCCTGCTCCAGGTGGTTCTGACTTAGTAGATAATTCCAGGAGGGCATATACAGCTTATGCTGTGGTTGAGATGCTCCGGTATTTAATACTTGTGGTGCCAGATACTTTTGCTGCTCTGGATTGCTTTCCTTTACCATCCTCTGTAATTTCACATACAATGAATGATGGGAGTTTTGTACTAAAATCAACTGAAGCTGCAGGGAAGATAAAAAATAGTTCAGATGATTTTGGTCACATTATTTCATGTATTCAGAAACATACAGAAGATTTGGCGAAGTCTGCAAGCCCAGGCTATCCAGGTCATTGTCTAGCTAAAGTTGCAAAAGCTTTGGATAAATCTCTTGTGCTGGGTGATTTGCGTGTAGCATATAAATTTCTTTTTGAAGAACTTTGTGGTGGAACTGTATCTGAAGGCTGGGTTTCCAAAGTCAGCCCTTGCTTAAGGTTATCTCTGAAATGGTTTGGGACTGTAAATACAGCCCTTATATATTCTGTGTTTTTCCTCTGTGAGTGGGCAACTTGTGATTTTAGGGATTTTCGCAGTACTCCTCCTCGTGACATAAAGTTTACAGGTAGGAAAGATCTTTCCCAAGTGCATATAGCAGTTAGACTTTTACTGATGAAGATTAGGGATGTGAAGATTTCACAAAAACAAACAAATGAAAATCACAGAGCCAGTCATCTTGCAAAGAATTCGAGTCAGTGCCAGAATTGGAATTATGTGGGTAATGTATCCAGATCGAAATCTAGTTCAAAGAGTATGGGTTCTTCTGTATTTGAAAGCCCAGGTCCTCTACATGATATTATAGTTTGTTGGATTGATCAGCATGTGGTGCATAAAGGGGAAGGTCCCAAGCGCCTACATCTATTTATGGTTGAACTCATACGTGCAGGCATCTTTTACCCCTTGGCATATGTACGCCAGCTAATAGTGAGCGGGATCATGGATGTGTATGTAAATGTGGTTGACCTGGAGCGATGGAGGAGACACTATCGAATCTTAAAGCAGCTACCTGGATGCTTTATCCATGATGTTCTGGAAGAATCAGGGATTGTTGAAGGGCCGCAGCTCAAAGAAGCCTTGCAAATTTACTTGAATGAACGCCGCCTCATACTTCGGGGTCCTCTGAGCATGTCCCATGATGATGCCAATGGTTCCAATTTATCTGCTCTGAAGAAAAAAAAATATCCAGCTTCTACAAAGGATGAAGTTTCTGCAGTGCCAATTGATCAGAGAAATGTTATTTCTACCACAATATCTTCTAAAAGTGCAAAGGATAATGCTAACATTGAAGAACTAAGAACAGCAATCTCGGTACTGTTACAGCTACCTAATTGTTCATCTAATTTGAGCACTACAGGTGATGAATCTGAGGGCAGTGTTAGAAGACCTATTGGGTCTCCCTACAGCAAGATTGATCCAGTGGAGGGTACACCTGGGTGTGAAGAATGTAGCAGAGCAAAGAGACAAAAGTTAAGTGAGGAAAGAAGCTCATTTGTTCAAGGGCATTCTCCAGTTCAATCTGATGATGACGATGCATGGTGGGTGAAAAAGGGAATGAAATCCCCAGAGCCTCTCAAAGTTGATCAATCTCAGAAGTCAACCAAGCAGGTCACCAAGATTCGGCAAAAGAATGTGCGTAAAACTCAGAGTCTAGCTCAACTGGCAGCTTCTAGAATTGAGAGTAGCCAAGGGGCATCAACTAGTCATGTGTGTGGTAACAAGGTAAGCTGCCCTCACCATAAAACTGCTATGGATGGAGAGGGGCAGAGGTCTGTCGATTGCATCCAAACAAGTCATTTTGGGGATATAGTTTCCATTGGAAAAGCATTAAAGCAGCTACGTTTTGTTGAGAAAAGGGCACTAGCAGTTTGGCTGTTGACTGTTGTTAGGCAGGTAATTGAAGAGGTGGAGAAAAATATTGGTAAAGTTGGTCAGTTCGGCAGGCCTTTTCCTGTTGCGGATGATAGAGGCTCAATACGGTGGAAACTTGGTGAAGACGAACTTTCTGTGATTCTTTATTTGATGGATATCTCTGATGATTTGGTATCAGCTGTCAAGTTCCTCCTTTGGTTGCTGCCAAAGGTTCTTAATAGCCCCAATTCTACAATTCATTCTGGGAGGAATGTGCTGATGCTACCAAGGAATGTGGAAAACCAAGTTTGTGATGTGGGAGAGGCTTTTCTGCTATCATCACTCAGAAGGTATGAGAACATTCTTGTTGCAGCAGACCTTATTCCCGAAGCTTTGTCATCTGCAATGCATCGTGCTGCCACTGTTATTGCATCTATTGGAAGGGTTTCAGGGTCAGGGGCCCTAGCTTTTGCTCGGTATTTGTTGAGAAAATACAGCAATGTGGCTAGTGTCATCGAGTGGGAGAAAACTTTTAAGACTACATCTGATGCTAGACTTTCCTCTGAACTTGAGTCTGGTGGGTCAGTGGATGGAGAGTTAGGTTTACCCCTAGGAGTTCCAGCTGGAGTCAAGGACCATGATGATTTTTTCCGTCAGAAGATAAGTGGTGGTCGGTTACCGTCCAGAGTAGGTGCAGGCATGAGGGATATAGTGCAGCGTAATGTTGAAGAAGCGTTCCACTATCTTTTTGGAAAAGATAGAAAGCTATTTGCTGCTGGTACACCAAAAGGTCCTGCTTTAGAAAAATGGGATAATGGATATCAAATTGCTCACCAAATAGTTATGGGTTTGATTGATTGCATAAGGCAGACTGGTGGTGCTGCTCAAGAAGGAGATCCCTCTTTGGTCTCTTCTGCTGTTTCTGCGATTGTTGGCAGTGTTGGTCCAACTTTAGCAAAAATGCCTGATTTTTCATCTGGCAATAATCATTCAAATATAATGTCAGCTACAAATTCATTGAACTATGCCAGATGCATTCTGCGAATGCATATAACCTGTCTATGCCTGCTTAAGGAAGCTCTGGGAGAACGCCAAAGCCGTGTATTTGATATTGCTCTAGCTACTGAAGCTTCTAATGCTCTTGCAGGTGTTTTTACTCCTAGTAAAGCATCTCGTTCTCAGTTTCAAATGTCTCCTGAAGCCCATGATTCTAGTAACACTATTTCAAATGATATGGGAAGCAACTCTATTAAGGTTGTGGCAAAAACAACAAAAATTGCTGCTGCTGTTTCTGCACTTCTTGTTGGTGCAATTGTATATGGTGTTACCAGCCTGGAAAGGATGGTGGCAGTTCTCAGATTAAAGGAGGGGCTGGATGTGGCACAATTTGTAAGAAACGCTAGATCCAATTCAAATGGAAATGCTCGTTCAGTTATGGCTTTTAAGGTGGATAGTTCAATTGAAGGTCATGTCCATTGGTTTAGATTGCTTGTTGGAAACTGCAGAACAATCTGTGAAGGGTTAGTGGTGGAACTCTTGGGTGAACCATCTATTATGGCTCTTTCAAGGATGCAACTTATGCTTCCTCTAAATTTGGTCTTTCCACCTGCCTATTCAATATTTGCCTTTGTTAGGTGGCGACCTTTCATGCTGAATGCTACAGTTCGGGAAGACATGAATCAAATTTATCAGTCTCTTTCAATGGCCATAACTGATGCAATAAAACATTTGCCATTTCGAGATGTATGTTTTAGAGACTGTCAGGGTCTTTATGATCTTATGGCTGCAGATGCAAGTGATTCTGAACTTGCAACCTTGCTAGAGTTTAATGGGTCTGATATGCATTTAAAATCCACAGCATTTGTTCCCCTACGCTCTAGGCTTTTCCTGAACGCCATGATTGATTGTAAGATGCCACCATCTATTTATACAAAGGATGATGGGAGCCGAATGTCTGGACTTGGTGAGTCTAAAATTAAATTCACAGATAGTGAGTC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Predicted protein sequences of Glyma.03g009200
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>Glyma.03g009200.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g009200.2 locus=Glyma.03g009200 id=Glyma.03g009200.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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