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A previous version of this gene model can be found here:
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT3G61415.1 | AT | SKP1-like 21 | JGI | N/A | IEA |
| AT3G61415.2 | AT | SKP1-like 21 | JGI | N/A | IEA |
| GO:0006511 | GO-bp | ubiquitin-dependent protein catabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0006511 | GO-bp | ubiquitin-dependent protein catabolic process | JGI | N/A | IEA |
| KOG1724 | KOG | SCF ubiquitin ligase, Skp1 component | JGI | N/A | IEA |
| PTHR11165 | Panther | SKP1 | JGI | N/A | IEA |
| PTHR11165:SF5 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
| PF01466 | PFAM | Skp1 family, dimerisation domain | JGI | N/A | IEA |
| PF03931 | PFAM | Skp1 family, tetramerisation domain | JGI | N/A | IEA |
|
Glyma.03g008500 not represented in the dataset |
Glyma.03g008500 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Paralog | Evidence | Comments |
|---|---|---|
| Glyma.07g069800 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma03g01091 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.03g008500.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g008500 ID=Glyma.03g008500.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g008500.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g008500 ID=Glyma.03g008500.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g008500.14 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g008500 ID=Glyma.03g008500.14.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.03g008500.16 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g008500 ID=Glyma.03g008500.16.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||