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Report for Sequence Feature Glyma.03G021000

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm03
Start:2148298
stop:2162954
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.03G021000
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G35930.1AT AMP-dependent synthetase and ligase family protein JGI N/AIEA
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GO:0008152GO-bp metabolic process JGI N/AIEA
GO:0003824GO-mf catalytic activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0003824GO-mf catalytic activity JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding EnsemblGenomesN/AIEA
KOG1176 KOG Acyl-CoA synthetase JGI N/AIEA
KOG4649 KOG PQQ (pyrrolo-quinoline quinone) repeat protein JGI N/AIEA
PTHR24096Panther FAMILY NOT NAMED JGI N/AIEA
PTHR24096:SF31Panther JGI N/AIEA
PF00501PFAM AMP-binding enzyme JGI N/AIEA
GN7V-50690SoyCyc9-rxn phenylalanine racemase (ATP-hydrolysing) Plant Metabolic Network ISS

Expression Patterns of Glyma.03G021000
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.03G021000 not represented in the dataset
Glyma.03G021000 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.03G021000 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma.03g021000 Wm82.a4.v1ISS As supplied by JGI
Glyma03g02390 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.03G021000
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>Glyma.03g021000.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g021000.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g021000.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.03G021000
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Predicted protein sequences of Glyma.03G021000
>Glyma.03g021000.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g021000.1 locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g021000.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g021000.2 locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g021000.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g021000.3 locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g021000.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g021000.4 locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g021000.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g021000.5 locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.03g021000.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.03g021000.6 locus=Glyma.03g021000 ID=Glyma.03g021000.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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