SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.02g238300

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm02
Start:44501600
stop:44519365
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.02g238300
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT5G58270.1AT ATATM3,ATM3,STA1 JGI N/AIEA
3.6.3.46EC JGI N/AIEA
GO:0006810GO-bp transport JGI N/AIEA
GO:0055085GO-bp transmembrane transport JGI N/AIEA
GO:0016021GO-cc integral component of membrane JGI N/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding JGI N/AIEA
GO:0016887GO-mf ATP hydrolysis activity JGI N/AIEA
GO:0042626GO-mf ATPase-coupled transmembrane transporter activity JGI N/AIEA
K05663KEGG JGI N/AIEA
PTHR24221PantherFam ATP-BINDING CASSETTE SUB-FAMILY B JGI N/AIEA
PF00005Pfam ABC transporter JGI N/AIEA
PF00664Pfam ABC transporter transmembrane region JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.02g238300 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma02g40490 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.02g238300
>Glyma.02g238300.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g238300.3.p locus=Glyma.02g238300 id=Glyma.02g238300.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g238300.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g238300.4.p locus=Glyma.02g238300 id=Glyma.02g238300.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g238300.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g238300.5.p locus=Glyma.02g238300 id=Glyma.02g238300.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g238300.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g238300.6.p locus=Glyma.02g238300 id=Glyma.02g238300.6.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.02g238300
>Glyma.02g238300.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g238300.3 locus=Glyma.02g238300 id=Glyma.02g238300.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g238300.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g238300.4 locus=Glyma.02g238300 id=Glyma.02g238300.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g238300.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g238300.5 locus=Glyma.02g238300 id=Glyma.02g238300.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g238300.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g238300.6 locus=Glyma.02g238300 id=Glyma.02g238300.6.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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