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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research
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| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT2G40770.1 | AT | zinc ion binding;DNA binding;helicases;ATP binding;nucleic acid binding | JGI | N/A | IEA |
| GO:0003677 | GO-mf | DNA binding | JGI | N/A | IEA |
| GO:0005524 | GO-mf | ATP binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0005524 | GO-mf | ATP binding | JGI | N/A | IEA |
| GO:0046872 | GO-mf | metal ion binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0046872 | GO-mf | metal ion binding | JGI | N/A | IEA |
| KOG0298 | KOG | DEAD box-containing helicase-like transcription factor/DNA repair protein | JGI | N/A | IEA |
| PTHR10799 | Panther | SWI/SNF-RELATED MATRIX-ASSOCIATED ACTIN-DEPENDENT REGULATOR OF CHROMATIN SUBFAMILY-RELATED | JGI | N/A | IEA |
| PTHR10799:SF59 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
| PF00176 | PFAM | SNF2 family N-terminal domain | JGI | N/A | IEA |
|
Glyma.02g219200 not represented in the dataset |
Glyma.02g219200 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma02g38370 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.02g219200.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g219200 ID=Glyma.02g219200.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||
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