Report for Sequence Feature Glyma.02g201300
Feature Type: gene_model
Chromosome: Gm02
Start: 38506022
stop: 38523460
Source: JGI
Version: Wm82.a2.v1
High confidence: yes
A previous version of this gene model can be found here:
Annotations for Glyma.02g201300
Proteins Associated with Glyma.02g201300
Locus Gene Symbol Protein Name
SPY1 probable UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase SPINDLY-like
Expression Patterns of Glyma.02g201300
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology
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Gene information in GlycineMine developed by LIS .
Related Plant Genes
Gene families from PhyloGenes .
Paralogs of Glyma.02g201300
Paralog Evidence Comments
Glyma.10g075300 IGC Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35.
Gene model name correspondences to Glyma.02g201300 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding Name Annotation Version Evidence Comments
Glyma02g36210 Wm82.a1.v1.1 IGC As supplied by JGI
Transcripts of Glyma.02g201300
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.02g201300.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g201300 ID=Glyma.02g201300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g201300.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g201300 ID=Glyma.02g201300.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
GCGCCTAATGTTGTAATCAACGAAGCAGTGTCAGGGCTCTCTCTCTCTCTCTGGGTTTTGGGAGACATCCAACTACCGTGTCGGAGAGGGAGCGTTGCGTGGCCATCACCACCTCGAACCAACACCAACAACTCACTCCCTCGTTGAAGATTCTTCATTCGCCATTATTCCATTCCAAAAATCATGCTCCTCTTCTTCAGGGTTTAGGTTTTTAACctctctctctttctccctctctcGCGCGCGCTTCCCATGCCCTATCCCTACCACCCCATCACCTGAAAGAACCTTCTAGAAGCACCCCTCATATCAAAAGGCTTTACAAGTGGATCCTTCTTACAAAGCAGCTGCTGAGTGCCTAGCCATTGTTTTAACGGATATTGGTACCAACATAAAGCTTGCAGGAAACACTCAGGAAGGAATTCAAAAATATTTTGAAGCTCTCAAAATAGATCCACACTATGCTCCAGCATATTATAACCTTGGTGTGGTCTATTCTGAAATGATGCAATATGACATGGCCCTCACTTTCTATGAAAAGGCTGCATCTGAGAGGCCTATGTATGCTGAAGCATACTGTAATATGGGTGTAATATATAAAAATCGTGGTGATTTGGAAGCAGCTATTACTTGTTATGAGAGGTGTTTAGCTGTTTCACCTAACTTTGAGATTGCAAAGAATAATATGGCTATAGCTTTGACAGATTTGGGAACAAAGGTTAAATTGGAGGGTGACATTGACCATGGTGTGGCTTTTTATAAGAAAGCTTTGTATTATAATTGGCATTATGCTGATGCTATGTATAATCTTGGGGTTGCTTATGGTGAGATGCTTAAGTTTGATATGGCTATTGTGTTCTATGAACTTGCCTTCCACTTCAATCCGCATTGTGCGGAAGCTTGTAACAATCTAGGTGTTATATATAAAGATCGTGACAACCTTGACAAAGCAGTGGAATGTTACCAGCTTGCTTTGGGAATCAAACCTAACTTTTCACAGTCATTAAACAACCTTGGCGTTGTATACACTGTCCAGGGTAAAATGGATGCTGCGGCGAGTATGATTGAGAAAGCTATAATCGCAAATCCAACATATGCAGAAGCATACAATAACCTAGGAGTTCTTTACAGGGATGCTGGTGATATCGCTCTAGCAATTAATGCTTATGAGCAATGTCTTAAGATTGATCCTGATTCTCGAAATGCTGGCCAGAACCGTTTACTTGCGATGAATTACATAGATGAAGGAAATGATGACAAACTTTTTGAGGCTCACAGGGACTGGGGTAGGCGATTTATGAGACTATATTCACAGTTCACATCATGGGACAACTCAAAAGATCCTGAACGGCCTCTTGTGATAGGATATGTCTCTCCTGATTATTTTACACATTCTGTGTCATATTTCATAGAAGCTCCCCTTCTCTATCATGACTATACCAATTATAAAGTGGTTGTTTATTCAGCAGTTGTCAAGGCAGATGCAAAAACCATCCGGTTTAGAGAGAAAGTCTTAAAGAAGGGTGGGATCTGGAAAGATATTTATGGAACTGATGAAAAGAAGGTTGCCGACATGGTTAGAGAAGATCAAGTTGATATTTTAATAGAGCTTACTGGTCACACTGCAAACAATAAGCTGGGAATGATGGCATGTCGACCTGCTCCCGTTCAGGTGACTTGGATTGGTTATCCCAATACAACAGGATTGCCTACAATTGATTATAGAATAACTGATTCTCAGGCAGACCCTCCCGAAACAAAGCAGAAGCATGTTGAAGAGTTAGTTCGATTACCGGATTGCTTCCTTTGTTACACTCCTTCCCCTGAGGCTGGTCCTGTTTGTCCAACTCCTGCTCTTTCCAATGGCTTCGTTACATTTGGTAGTTTTAACAATCTTGCCAAGATTACACCCAAGGTACTGCAGGTCTGGGCAAAGATACTATGTGCAATTCCAAATTCTCGTCTTGTGGTGAAATGTAAACCGTTTTGCTGTGATAGTGTGAGACAGAGGTTTCTTTCAACACTAGAGAAGTTAGGTCTTGAACCACTACGAGTTGATCTTCTGCCCCTTATTCTTCTTAACCATGATCATATGCAAGCTTATTCTCTAATGGACATCAGTTTGGACACATTTCCATATGCTGGAACAACCACGACTTGTGAATCTTTATACATGGGAGTTCCATGTGTTACAATGGCTGGTTCAGTGCATGCACACAATGTTGGTGTTAGTCTCCTTAGCAAAGTTGGTCTGGGCAATTTGATTGCCAAAAATGAAGATGAATATGTAAAATTGGCTGTGAAGTTGGCCTCTGATATTTCGGCACTACAAAATTTGAGAATGAGTCTTCGAGAGCTCATGTCTAAGTCCCCTCTCTGCAATGGAGCAAAATTTACCCTTGGTCTAGAGTCAACATATAGGAAAATGTGGCGCAGATATTGTAAAGGAGATGTTCCGGCTTTGAAACGCATGGAGCTGTTGCAACAACCTGTTTCTTCAAATGACCCATCCAATAAGAACTCTGAGCCAACAAGGGCCACAAACTCAAGTGAGGGCAGCCCCGGATCTGTCAAGGCCAATGGATTCAGTTCAACACAACCACCGAAGCTTAATTTTGTCAATTGTGAAGAAAATGGTGGGTCGCTGAATCACAGTAGTAAGCAAGGTATGGTGGGTTCAAGTTGAATTTCATGAGAGTCCTTTGTTGTGATTCAAGGATGCTAAGCTGTATTAGGTTGATATGATGTATATTGTGGTTGCTACTGGAAGAGGCTTGCAGCTCCACGGCATCACAAGAGGCTAAATTTTCATAGAATGACAATTTTTTCTGGGAAAGAAGTGTAAGCAACAGTTACCAAATCGATTTGTGTCCTCAACTGCTGTTGATACTCCCAGAGGTGATGCTGCTTTGAAATGGCATCCTTCAATATCTGTAACACATTTTCGCCCCCTTAATTATAATAGCCAGTTGAGAGTGTAAATTGTGTAATATTTATTTAATTTTTTTTTTGGGGTATGGACTTCTTTTCTAGCATGTTGTTGAAGGATGGAGTGTACCTGTGTGAATGTAATAGGCTTTCATGTGAAAAACAGGGGTGGACAAATTAAGATTTCTGTGTTGATTAAGATAGGAATATGAAAGTTTGGCTCTGAAGTACTAAAGAGTTCAAAACATGTCTACAGAGGAAACAATATCAGAAGCAACTTAATTAGCTCTTAAGCTAGTAGTAGTACTCTAATTTGATAACTGTTATTATGACATTGGTCAATGCTATTATGTGACGAGATGTGGGCATAATTTTACCCTTCCTT
>Glyma.02g201300.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g201300 ID=Glyma.02g201300.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.02g201300
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NT Limit To All Plant Sequences
>Glyma.02g201300.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g201300.1.p locus=Glyma.02g201300 ID=Glyma.02g201300.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATGGCGTGGACGGAAGATAGTGATGGGAATAATGGGAGGGAAAAGTTGGTTGGGGAAAATGGGTTTTTGAAAGTGTCTGAGCCTTCTTCTGATGGTTCTGTTGGGGATGGGGGTTCGGTGAGTAAGAGATGTGAAGGGAAGGACGATGTTTCGTATGCCAACATCCTGCGTTCAAGGAACAAGTTTGTGGATGCTCTTGCGCTGTATGAGCGCGTGCTGGAGAGTGATGGCGGGAATGTTGAGGCTCTTATTGGGAAAGGGATATGTTTGCAGATGCAGAATATGGGTAGGCTTGCTTTTGAGAGTTTTGCCGAGGCTATCAGGTTGGACCCTCAGAATGCTTGTGCTCTCACACATTGCGGTATTCTGTACAAAGACGAAGGTCGCCTCGTGGAGGCAGCCGAGTCATATCAAAAGGCTTTACAAGTGGATCCTTCTTACAAAGCAGCTGCTGAGTGCCTAGCCATTGTTTTAACGGATATTGGTACCAACATAAAGCTTGCAGGAAACACTCAGGAAGGAATTCAAAAATATTTTGAAGCTCTCAAAATAGATCCACACTATGCTCCAGCATATTATAACCTTGGTGTGGTCTATTCTGAAATGATGCAATATGACATGGCCCTCACTTTCTATGAAAAGGCTGCATCTGAGAGGCCTATGTATGCTGAAGCATACTGTAATATGGGTGTAATATATAAAAATCGTGGTGATTTGGAAGCAGCTATTACTTGTTATGAGAGGTGTTTAGCTGTTTCACCTAACTTTGAGATTGCAAAGAATAATATGGCTATAGCTTTGACAGATTTGGGAACAAAGGTTAAATTGGAGGGTGACATTGACCATGGTGTGGCTTTTTATAAGAAAGCTTTGTATTATAATTGGCATTATGCTGATGCTATGTATAATCTTGGGGTTGCTTATGGTGAGATGCTTAAGTTTGATATGGCTATTGTGTTCTATGAACTTGCCTTCCACTTCAATCCGCATTGTGCGGAAGCTTGTAACAATCTAGGTGTTATATATAAAGATCGTGACAACCTTGACAAAGCAGTGGAATGTTACCAGCTTGCTTTGGGAATCAAACCTAACTTTTCACAGTCATTAAACAACCTTGGCGTTGTATACACTGTCCAGGGTAAAATGGATGCTGCGGCGAGTATGATTGAGAAAGCTATAATCGCAAATCCAACATATGCAGAAGCATACAATAACCTAGGAGTTCTTTACAGGGATGCTGGTGATATCGCTCTAGCAATTAATGCTTATGAGCAATGTCTTAAGATTGATCCTGATTCTCGAAATGCTGGCCAGAACCGTTTACTTGCGATGAATTACATAGATGAAGGAAATGATGACAAACTTTTTGAGGCTCACAGGGACTGGGGTAGGCGATTTATGAGACTATATTCACAGTTCACATCATGGGACAACTCAAAAGATCCTGAACGGCCTCTTGTGATAGGATATGTCTCTCCTGATTATTTTACACATTCTGTGTCATATTTCATAGAAGCTCCCCTTCTCTATCATGACTATACCAATTATAAAGTGGTTGTTTATTCAGCAGTTGTCAAGGCAGATGCAAAAACCATCCGGTTTAGAGAGAAAGTCTTAAAGAAGGGTGGGATCTGGAAAGATATTTATGGAACTGATGAAAAGAAGGTTGCCGACATGGTTAGAGAAGATCAAGTTGATATTTTAATAGAGCTTACTGGTCACACTGCAAACAATAAGCTGGGAATGATGGCATGTCGACCTGCTCCCGTTCAGGTGACTTGGATTGGTTATCCCAATACAACAGGATTGCCTACAATTGATTATAGAATAACTGATTCTCAGGCAGACCCTCCCGAAACAAAGCAGAAGCATGTTGAAGAGTTAGTTCGATTACCGGATTGCTTCCTTTGTTACACTCCTTCCCCTGAGGCTGGTCCTGTTTGTCCAACTCCTGCTCTTTCCAATGGCTTCGTTACATTTGGTAGTTTTAACAATCTTGCCAAGATTACACCCAAGGTACTGCAGGTCTGGGCAAAGATACTATGTGCAATTCCAAATTCTCGTCTTGTGGTGAAATGTAAACCGTTTTGCTGTGATAGTGTGAGACAGAGGTTTCTTTCAACACTAGAGAAGTTAGGTCTTGAACCACTACGAGTTGATCTTCTGCCCCTTATTCTTCTTAACCATGATCATATGCAAGCTTATTCTCTAATGGACATCAGTTTGGACACATTTCCATATGCTGGAACAACCACGACTTGTGAATCTTTATACATGGGAGTTCCATGTGTTACAATGGCTGGTTCAGTGCATGCACACAATGTTGGTGTTAGTCTCCTTAGCAAAGTTGGTCTGGGCAATTTGATTGCCAAAAATGAAGATGAATATGTAAAATTGGCTGTGAAGTTGGCCTCTGATATTTCGGCACTACAAAATTTGAGAATGAGTCTTCGAGAGCTCATGTCTAAGTCCCCTCTCTGCAATGGAGCAAAATTTACCCTTGGTCTAGAGTCAACATATAGGAAAATGTGGCGCAGATATTGTAAAGGAGATGTTCCGGCTTTGAAACGCATGGAGCTGTTGCAACAACCTGTTTCTTCAAATGACCCATCCAATAAGAACTCTGAGCCAACAAGGGCCACAAACTCAAGTGAGGGCAGCCCCGGATCTGTCAAGGCCAATGGATTCAGTTCAACACAACCACCGAAGCTTAATTTTGTCAATTGTGAAGAAAATGGTGGGTCGCTGAATCACAGTAGTAAGCAAGGTATGGTGGGTTCAAGTTGA
>Glyma.02g201300.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g201300.2.p locus=Glyma.02g201300 ID=Glyma.02g201300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g201300.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g201300.3.p locus=Glyma.02g201300 ID=Glyma.02g201300.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.02g201300
Show Sequence BLAST Sequence at SoyBase BLAST Sequence against GenBank NR Limit To All Plant Sequences
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>Glyma.02g201300.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g201300.3 locus=Glyma.02g201300 ID=Glyma.02g201300.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g201300.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g201300.4 locus=Glyma.02g201300 ID=Glyma.02g201300.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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