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Report for Sequence Feature Glyma.02g162300

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm02
Start:21052064
stop:21076949
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.02g162300
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT2G40860.1AT protein kinase family protein / protein phosphatase 2C ( PP2C) family protein JGI N/AIEA
GO:0006468GO-bp protein phosphorylation EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0006468GO-bp protein phosphorylation JGI N/AIEA
GO:0035556GO-bp intracellular signal transduction EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005622GO-cc intracellular EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0003824GO-mf catalytic activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0003824GO-mf catalytic activity JGI N/AIEA
GO:0004672GO-mf protein kinase activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0004672GO-mf protein kinase activity JGI N/AIEA
GO:0004871GO-mf signal transducer activity EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding EnsemblGenomesN/AIEA
GO:0005524GO-mf ATP binding JGI N/AIEA
KOG0192 KOG Tyrosine kinase specific for activated (GTP-bound) p21cdc42Hs JGI N/AIEA
KOG0698 KOG Serine/threonine protein phosphatase JGI N/AIEA
PTHR13832Panther PROTEIN PHOSPHATASE 2C JGI N/AIEA
PTHR23257Panther SERINE-THREONINE PROTEIN KINASE JGI N/AIEA
PTHR23257:SF161Panther JGI N/AIEA
PF00069PFAM Protein kinase domain JGI N/AIEA
PF00481PFAM Protein phosphatase 2C JGI N/AIEA

Expression Patterns of Glyma.02g162300
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.02g162300 not represented in the dataset
Glyma.02g162300 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.02g162300 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma02g21970 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.02g162300
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>Glyma.02g162300.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.12 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.13 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.8 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.9 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.02g162300
>Glyma.02g162300.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.1.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.10 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.10.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.11 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.11.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.12 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.12.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.13 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.13.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.2.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.3.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.4.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATGTTTTTCTTCAAGTTATTTGAATCTCCAAATCTAGCACAAAAGTTACATGTGGAAGAGTGGATCCCAACTCTGAACGATGCACTTATGATAGCAATGCAGTTAGCAAAGGCTTTGCAATATCTGCATAACCTCGGGATTGTGCATAGAGATGTGAAACCGGCAAATATTCTTCTTGACAAAAACCTTTGTCCACACCTCACAGATTTTGGTTTGGCAGAATACAAGAATGATCTTAAGAGAGTTTCTACTGAGAATTGGAAGTCTTCTGGAAAGCCTACTGGTGGTTTCCACAAAAAGAATATGGTTGGAACACTCATTTACATGGCACCTGAAATATTAAGAAAAGAGTTACATACAGAAAAGTCAGATGTATACAGTTTTGGGATATCAATCAATGAACTCCTAACTGGTGTTGTGCCATACACTGATCTTCGTACAGAAGCGCAGGCTCACACAGTGCTTGAGATGAACTATACTGAGCAGCAATTAACAGCAGCTGTCGTTTCTGATGGATTACGGCCTGTCCTTGCTGCCGAGGACTTGGGTATACCGTCAAGATTATTATCAATGATTAAAAAATGCTGGGATGCAGATCCTAATAACAGACCTGCTTTTGATGACATTGTTGAGGAACTTGATTTAGTTATGGAGCATGGTAAGTTAAAGAAGGCAGAAGATATTCATATCAGACCTTATAACTTGCATGTTGTTCAACCTGCGGGCAAGACTGATCACTTTAAGGCTTATCAAGAGAGTTTTAGCTGGTTCACTCGTGGCGAACTTTTGGCCAGGAGTGCCTCTAGTGCAAATGATTCTGGTTTGATAACTAGGTGCGAGTCTTCTGACAAGCCTTCAGCATACCACCCAACAATGTCTTGGGGATCTTATGCTACCTGTGGGAGAAGGGAGACTATGGAGGATACACATTTCATTCTTCCCCATATTTGTGATGAAAAGGATGCCTATGCTTTTGGTATCTTTGATGGCCATAGGGGTGCAGCAGCTGCTGCCTTTTCTTCTAGAGCTGTACCAGCAGTTTTGCAGACTTCAGATTTCATGGGCAGTCCTGCTAATGCACTAGCGGAAGCATTCATTAAGACAGATGCTGCCTTCAGAAAAGAGCTTGATTCCTATCGCAAATCCAACAGATGTATCCAGAAGGATTGGCATCCTGGGTGTACAGCAATTGCTATTCTTATAGTCAGAAACAAGCTATTTGTTGCTAACATTGGTGATTGCAGGGTAATCTTATGTCGTGCTGGTAATCCAATTGCTCTAAGTAAGGATCATGTTGCAAGCTGTCTTCAAGAGAGAGAGCGTGTTATTCGGCAGGGGGGCCAAGTACATTGGCAAGTTGATACTTGGAGGGTTGGTCTTCCTGCACTTCAGGTTACTCGTTCTATTGGTGATGATGATTTGAAGCCTGCTGTAACTGCAGAACCTGAGATAACTGAGAGTACCTTGTGCCCAGAGGATGAATTTCTGGTCATGGCTAGCGATGGCCTGTGGGATGCCATAAGCAGTATGGAGGTCATAAATATAATAAAAGATACTGTTAAAGAGCCTGGAATGTGCTCCAAGAGGTTAGCTACTGAAGCAGTGGAACGAGGCAGCAAAGATAATATCACAGTTATCGTTGTTTTCTTACGTCCTGTGTCTACAGCAGAGAGAATTTATTAG

>Glyma.02g162300.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.5.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.6 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.6.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.02g162300.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g162300.7.p locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.02g162300
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>Glyma.02g162300.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g162300.8 locus=Glyma.02g162300 ID=Glyma.02g162300.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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