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Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.02g103800

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm02
Start:9803740
stop:9810851
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.02g103800
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT4G34100.2AT JGI N/AIEA
6.3.2.19EC JGI N/AIEA
GO:0008270GO-mf zinc ion binding JGI N/AIEA
K10661KEGG Ubiquitin system JGI N/AIEA
KOG1609 KOG Protein involved in mRNA turnover and stability JGI N/AIEA
PTHR13145PantherFam SSM4 PROTEIN JGI N/AIEA
PF12906Pfam RING-variant domain JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.02g103800 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma02g11570 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.02g103800
>Glyma.02g103800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g103800.1.p locus=Glyma.02g103800 id=Glyma.02g103800.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g103800.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g103800.3.p locus=Glyma.02g103800 id=Glyma.02g103800.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g103800.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g103800.4.p locus=Glyma.02g103800 id=Glyma.02g103800.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g103800.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g103800.5.p locus=Glyma.02g103800 id=Glyma.02g103800.5.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.02g103800
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>Glyma.02g103800.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g103800.3 locus=Glyma.02g103800 id=Glyma.02g103800.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MEIAHEPSPSLDGSPFAAAETLANSPSSSSSSPSSSSSSASSPRGAKGKEVESTASGTATSPAPAKYDDEDEEEEDVCRICRNPGDAENPLRYPCACSGSIKFVHQDCLLQWLNHSNARQCEVCKHAFSFSPVYAENAPARLPFQEFVVGMAMKACHVLQFFLRLSFVLSVWLLIIPFITFWIWRLAFVRSLGEAQRLFLSHLSTAVILTDCLHGFLLSASIVFIFLGATSLRDYFRHLREIGGQDADREDEVDRNGARIARRPPGQANRNINNGDGNGEDAGGVQGIAGAGQVIRRNAENVAARWEMQAARLEAHVEQMFDGLDDADGAEDVPFDELVGMQGPVFHLVENAFTVLASNMIFLGVVIFVPFSLGRIILHYLSWFFSTASGPVLSAVAPLADTSLSLANITLKNALTAVKNMSSETQENGSIGQVAEMLKANASEMSEMSNITSASAVILKGVSIGTSRISDVTTLAIGYVFILTLIFCYFGIVALIRYTKGEPLTMGRFYGIASIAETIPSLFRQFLAAMRHLMTMVKVAFLLVIELGVFPLMCGWWLDVCTIQMFGKTMVHRVQFFSASPLASSLVHWVVGIVYMLQISIFVSLLRGVLRNGVLYFLRDPADPNYNPFRDLIDDPVHKHARRVLLSVAVYGSLIVMLVFLPVKHAMRMAPSIFPLDISVSDPFTEIPADMLLFQICIPFAIEHFKLRTTIKSLLRYWFTAVGWALGLTDFLLPKPDESVNQENGNGEPARQERLQIVQAGVHDQGLVPFAGDDLNRAIITVEEMNAEEDYDNDEQSDSDYAFVLRIVLLLVIAWMTLLVFNSALIVVPISLGRTLFNSIPRLPITHGIKCNDLYAFIIGSYVIWTAVAGVRYSIEQIRKRRSSVLFGQIWKWCGILVKSSALLSIWIFVIPVLIGLLFELLVIVPMRVPVDESPVFLLYQDWALGLIFLKIWTRLVMLDHMMPLVDESWRVKFERVREDGFSRLQGLWVLREIVLPIIMKLLTALCVPYVLAKGVFPVLGYPLVINSAVYRFAWLGCLSFSFVCFCAKRFHVWFTNLHNSIRDDRYLIGRRLHNFGEHAEKANVAETNSGEKDTILLGTGLNQQDREADVGLRLRHVNQQVG*

>Glyma.02g103800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g103800.4 locus=Glyma.02g103800 id=Glyma.02g103800.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.02g103800.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g103800.5 locus=Glyma.02g103800 id=Glyma.02g103800.5.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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