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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT3G50430.1 | AT | JGI | N/A | IEA | |
GO:0005488 | GO-mf | binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
PTHR16057 | Panther | WINS1, 2 PROTEIN | JGI | N/A | IEA |
PTHR16057:SF1 | Panther | PROTEIN LINES HOMOLOG | JGI | N/A | IEA |
Glyma.02g062800 not represented in the dataset |
Glyma.02g062800 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma02g06980 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.02g062800.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g062800.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g062800.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g062800.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g062800.1.p locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g062800.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g062800.1 locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSPAGELRWLCRLLHDSLRPYTEPRAFVSTSKEKEKEILIASSQVVTKIQLRIREFDSRAEAKRASDEERSCCSSPHSSVDQCLRKIVTEMMVLLTVKSEFVQHVVVNALVLVSKFLYTMGNNWDGFIHLLCCSLEMAIARMISCSSEPPSGAENSEFDCFDVEFLMQYGLKNFDWSTVAGVVRVLRVICKHLKEEDYDDGLIKVYYDSVNSCLLKMPWDLLDEYWSSEFGRMKDNSTINQLHLKNFSVMDPVMNFLGTFLQLLCSLVYRNDSVETGCDSVDKHPLFLTVVNLIPRLAKWCLSEQENNAEMHAIHYLKHKLLILMIRLGSLTGLDCRIRLSWLELLHNYFQELLQQPLTQFLSDQIDCLEDSPFLWSLCDGEACMKRSDHLRRQAVYLLLACSFSLICKRGEIANHCNNSTLCSSFTTNPDSEHDYFCRKKGSLELFKWILGHLPTAISINHEKYMQMCMNFISSFLQLYLREDDLLFEVLLLLFSISSSLQEQSESKDAAYHDVMKDFPFELSDIFNSVHLFHLFLSEIHYDHQVLLDYLISKDTGISCAKYLLRCLHLICNSWKLFVEFPLFGEFLDQSSCKRRKIVGDGLHFLADGMPTSIDNSGSIILHIKNYKEDRGGFKYYNIKPFKKAGECLLSLNNSVYNLHQKKLFPYNPKVLLKRLRRFQELCCQEKGFHGLKTE* >Glyma.02g062800.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g062800.2 locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSPAGELRWLCRLLHDSLRPYTEPRAFVSTSKEKEKEILIASSQVVTKIQLRIREFDSRAEAKRASDEERSCCSSPHSSVDQCLRKIVTEMMVLLTVKSEFVQHVVVNALVLVSKFLYTMGNNWDGFIHLLCCSLEMAIARMISCSSEPPSGAENSEFDCFDVEFLMQYGLKNFDWSTVAGVVRVLRVICKHLKEEDYDDGLIKVYYDSVNSCLLKMPWDLLDEYWSSEFGRMKDNSTINQLHLKNFSVMDPVMNFLGTFLQLLCSLVYRNDSVETGCDSVDKHPLFLTVVNLIPRLAKWCLSEQENNAEMHAIHYLKHKLLILMIRLGSLTGLDCRIRLSWLELLHNYFQELLQQPLTQFLSDQIDCLEDSPFLWSLCDGEACMKRSDHLRRQAVYLLLACSFSLICKRGEIANHCNNSTLCSSFTTNPDSEHDYFCRKKGSLELFKWILGHLPTAISINHEKYMQMCMNFISSFLQLYLREDDLLFEVLLLLFSISSSLQEQSESKDAAYHDVMKDFPFELSDIFNSVHLFHLFLSEIHYDHQVLLDYLISKDTGISCAKYLLSPQFLFPLFNHGG* >Glyma.02g062800.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g062800.3 locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSPAGELRWLCRLLHDSLRPYTEPRAFVSTSKEKEKEILIASSQVVTKIQLRIREFDSRAEAKRASDEERSCCSSPHSSVDQCLRKIVTEMGNNWDGFIHLLCCSLEMAIARMISCSSEPPSGAENSEFDCFDVEFLMQYGLKNFDWSTVAGVVRVLRVICKHLKEEDYDDGLIKVYYDSVNSCLLKMPWDLLDEYWSSEFGRMKDNSTINQLHLKNFSVMDPVMNFLGTFLQLLCSLVYRNDSVETGCDSVDKHPLFLTVVNLIPRLAKWCLSEQENNAEMHAIHYLKHKLLILMIRLGSLTGLDCRIRLSWLELLHNYFQELLQQPLTQFLSDQIDCLEDSPFLWSLCDGEACMKRSDHLRRQAVYLLLACSFSLICKRGEIANHCNNSTLCSSFTTNPDSEHDYFCRKKGSLELFKWILGHLPTAISINHEKYMQMCMNFISSFLQLYLREDDLLFEVLLLLFSISSSLQEQSESKDAAYHDVMKDFPFELSDIFNSVHLFHLFLSEIHYDHQVLLDYLISKDTGISCAKYLLRCLHLICNSWKLFVEFPLFGEFLDQSSCKRRKIVGDGLHFLADGMPTSIDNSGSIILHIKNYKEDRGGFKYYNIKPFKKAGECLLSLNNSVYNLHQKKLFPYNPKVLLKRLRRFQELCCQEKGFHGLKTE* >Glyma.02g062800.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g062800.4 locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSPAGELRWLCRLLHDSLRPYTEPRAFVSTSKEKEKEILIASSQVVTKIQLRIREFDSRAEAKRASDEERSCCSSPHSSVDQCLRKIVTEMGNNWDGFIHLLCCSLEMAIARMISCSSEPPSGAENSEFDCFDVEFLMQYGLKNFDWSTVAGVVRVLRVICKHLKEEDYDDGLIKVYYDSVNSCLLKMPWDLLDEYWSSEFGRMKDNSTINQLHLKNFSVMDPVMNFLGTFLQLLCSLVYRNDSVETGCDSVDKHPLFLTVVNLIPRLAKWCLSEQENNAEMHAIHYLKHKLLILMIRLGSLTGLDCRIRLSWLELLHNYFQELLQQPLTQFLSDQIDCLEDSPFLWSLCDGEACMKRSDHLRRQAVYLLLACSFSLICKRGEIANHCNNSTLCSSFTTNPDSEHDYFCRKKGSLELFKWILGHLPTAISINHEKYMQMCMNFISSFLQLYLREDDLLFEVLLLLFSISSSLQEQSESKDAAYHDVMKDFPFELSDIFNSVHLFHLFLSEIHYDHQVLLDYLISKDTGISCAKYLLRCLHLICNSWKLFVEFPLFGEFLDQSSCKRRKIVGDGLHFLADGMPTSIDNSGSIILHIKNYKEDRGGFKYYNIKPFKKAGECLLSLNNSVYNLHQKKLFPYNPKVLLKRLRRFQELCCQEKGFHGLKTE* >Glyma.02g062800.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g062800.5 locus=Glyma.02g062800 ID=Glyma.02g062800.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MSPAGELRWLCRLLHDSLRPYTEPRAFVSTSKEKEKEILIASSQVVTKIQLRIREFDSRAEAKRASDEERSCCSSPHSSVDQCLRKIVTEMMVLLTVKSEFVQHVVVNALVLVSKFLYTMGNNWDGFIHLLCCSLEMAIARMISCSSEPPSGAENSEFDCFDVEFLMQYGLKNFDWSTVAGVVRVLRVICKHLKEEDYDDGLIKVYYDSVNSCLLKMPWDLLDEYWSSEFGRMKDNSTINQLHLKNFSVMDPVMNFLGTFLQLLCSLVYRNDSVETGCDSVDKHPLFLTVVNLIPRLAKWCLSEQENNAEMHAIHYLKHKLLILMIRLGSLTGLDCRIRLSWLELLHNYFQELLQQPLTQFLSDQIDCLEDSPFLWSLCDGEACMKRSDHLRRQAVYLLLACSFSLICKRGEIANHCNNSTLCSSFTTNPDSEHDYFCRKKGSLELFKWILGHLPTAISINHEKYMQMCMNFISSFLQLYLREDDLLFEVLLLLFSISSSLQEQSESKDAAYHDVMKDFPFELSDIFNSVHLFHLFLSEIHYDHQVLLDYLISKDTGISCAKYLLRCLHLICNSWKLFVEFPLFGEFLDQSSCKRRKIVGDGLHFLADGMPTSIDNSGSIILHIKNYKEDRGGFKYYNIKPFKKAGECLLSLNNSVYNLHQKKLFPYNPKVLLKRLRRFQELCCQEKGFHGLKTE*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||