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A previous version of this gene model can be found here:
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT1G60030.1 | AT | nucleobase-ascorbate transporter 7 | JGI | N/A | IEA |
| GO:0006810 | GO-bp | transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0006810 | GO-bp | transport | JGI | N/A | IEA |
| GO:0055085 | GO-bp | transmembrane transport | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0055085 | GO-bp | transmembrane transport | JGI | N/A | IEA |
| GO:0016020 | GO-cc | membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0016020 | GO-cc | membrane | JGI | N/A | IEA |
| GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0005215 | GO-mf | transporter activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0005215 | GO-mf | transporter activity | JGI | N/A | IEA |
| GO:0022857 | GO-mf | transmembrane transporter activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| KOG1292 | KOG | Xanthine/uracil transporters | JGI | N/A | IEA |
| PTHR11119 | Panther | XANTHINE-URACIL / VITAMIN C PERMEASE FAMILY MEMBER | JGI | N/A | IEA |
| PTHR11119:SF8 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
| PF00860 | PFAM | Permease family | JGI | N/A | IEA |
|
Glyma.02g031000 not represented in the dataset |
Glyma.02g031000 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Paralog | Evidence | Comments |
|---|---|---|
| Glyma.01g035000 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma02g03550 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.02g031000.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g031000.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g031000.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g031000.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g031000.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g031000.8 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.02g031000.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g031000.1.p locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGCAGCAGCTGCACCACCACCCAAGCCGGAAGAGCTTCAGCCACACCCTGTGAAAGATCAACTTCCAAATGTTTCATACTGCATCACTAGTCCTCCTCCATGGCCGGAGGCGATACTACTTGGTTTCCAACATTACTTGGTGATGCTTGGCACAACTGTTCTAATACCAACCACTCTTGTTACTCAGATGGGAGGAGGAAATGAAGAGAAAGCAAAAATGGTCCAGACTCTGCTGTTTGTTGCTGGCATAAACACATTTTTCCAAACACTATTTGGGACTCGTCTACCTGCAGTTATTGGAGGATCCTGCACCTTTGTGCCAACTACCATTTCTATCATTTTTGCTGGTCGCTACAGTGACATTGTGAATCCTCAGGAGAGGTTTGAGAGGATAATGCGTGGAACACAGGGTGCGCTTATTGTTGCTTCGACCTTGCAAATTGTTGTTGGCTTCAGTGGCCTTTGGCGCAATGTAGTGAGGTTCTTAAGCCCTCTCTCTGCTGTTCCCTTGGTTGCTCTGTCAGGCTTTGGACTTTATGAGTTGGGCTTTCCTGTGCTTGCAAAATGTGTGGAGATTGGGCTGCCGGAAATCGTATTCTTACTAGTATTTTCACAGTACATTCCTCATGTGATGAAAGGAGAAAAGCGTATCTTTGATCGATTTGCAGTTATATTCTCAGTGACAATTGTGTGGATTTATGCTCATCTTCTCACTGTGGGTGGAGCATATAAAAATGTACCACAGACAACTCAAGAGACTTGCAGAACTGATCGTGCTGGAATTATAAGTGGTGCACCTTGGATTAGAATCCCATATCCTTTCCAGTGGGGAGCTCCTACATTTGATGCTGGAGAAGCTTTTGCAACGATGGCTGCTTCATTTGTTGCACTAGTAGAGTCAACAGGTGCTTTTATTGCTGTTTCAAGGTATGCAAGTGCAACTCCAATGCCACCTTCAGTTCTTAGCCGTGGTATCGGTTGGCAGGGGGTAGGAATTTTGTTATCAGGGATCTTTGGGACAGGGAATGGATCATCAGTTTCTGTAGAGAATGCTGGACTCTTAGCTTTAACGCAAGTTGGTAGCCGCAGGGTTGTTCAAATATCAGCAGGATTCATGATCTTTTTCTCCATACTTGGAAAATTCGGAGCTGTGTTTGCTTCAATCCCAGCACCAATAGTTGCAGCTTTATATTGCCTTTTCTTTGCCTATGTGGGTTCTGCAGGCCTCGGTTTCCTTCAGTTTTGCAATTTAAACAGCTTTAGAACTAAACTCATCTTGGGGTTCTCTATTTTCATGGGCTTCTCTATACCACAATACTTCAATGAGTACACTGCATTTAAGAACTATGGTCCTGTGCACACTCACGCTAGATGGTTCAATGACATGATCAATGTCCCATTCTCATCAAAAGCATTTGTTGCTGGCTCCTTGGCACTGTTCTTGGATACCACATTGCACAACAAAGACAGTCAAACACGTAAGGACAGAGGCATGCACTGGTGGGACAGATTCAGTTCATTCAAGACAGATACAAGGAGTGAGGAGTTTTACTCTCTACCTTTCAATCTAAACAAGTTCTTTCCCTCTGTATGA 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>Glyma.02g031000.5 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g031000.5.p locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGCAGCAGCTGCACCACCACCCAAGCCGGAAGAGCTTCAGCCACACCCTGTGAAAGATCAACTTCCAAATGTTTCATACTGCATCACTAGTCCTCCTCCATGGCCGGAGGCGATACTACTTGGTTTCCAACATTACTTGGTGATGCTTGGCACAACTGTTCTAATACCAACCACTCTTGTTACTCAGATGGGAGGAGGAAATGAAGAGAAAGCAAAAATGGTCCAGACTCTGCTGTTTGTTGCTGGCATAAACACATTTTTCCAAACACTATTTGGGACTCGTCTACCTGCAGTTATTGGAGGATCCTGCACCTTTGTGCCAACTACCATTTCTATCATTTTTGCTGGTCGCTACAGTGACATTGTGAATCCTCAGGAGAGGTTTGAGAGGATAATGCGTGGAACACAGGGTGCGCTTATTGTTGCTTCGACCTTGCAAATTGTTGTTGGCTTCAGTGGCCTTTGGCGCAATGTAGTGAGGTTCTTAAGCCCTCTCTCTGCTGTTCCCTTGGTTGCTCTGTCAGGCTTTGGACTTTATGAGTTGGGCTTTCCTGTGCTTGCAAAATGTGTGGAGATTGGGCTGCCGGAAATCGTATTCTTACTAGTATTTTCACAGTACATTCCTCATGTGATGAAAGGAGAAAAGCGTATCTTTGATCGATTTGCAGTTATATTCTCAGTGACAATTGTGTGGATTTATGCTCATCTTCTCACTGTGGGTGGAGCATATAAAAATGTACCACAGACAACTCAAGAGACTTGCAGAACTGATCGTGCTGGAATTATAAGTGGTGCACCTTGGATTAGAATCCCATATCCTTTCCAGTGGGGAGCTCCTACATTTGATGCTGGAGAAGCTTTTGCAACGATGGCTGCTTCATTTGTTGCACTAGTAGAGTCAACAGGTGCTTTTATTGCTGTTTCAAGGTATGCAAGTGCAACTCCAATGCCACCTTCAGTTCTTAGCCGTGGTATCGGTTGGCAGGGGGTAGGAATTTTGTTATCAGGGATCTTTGGGACAGGGAATGGATCATCAGTTTCTGTAGAGAATGCTGGACTCTTAGCTTTAACGCAAGTTGGTAGCCGCAGGGTTGTTCAAATATCAGCAGGATTCATGATCTTTTTCTCCATACTTGGAAAATTCGGAGCTGTGTTTGCTTCAATCCCAGCACCAATAGTTGCAGCTTTATATTGCCTTTTCTTTGCCTATGTGGGTTCTGCAGGCCTCGGTTTCCTTCAGTTTTGCAATTTAAACAGCTTTAGAACTAAACTCATCTTGGGGTTCTCTATTTTCATGGGCTTCTCTATACCACAATACTTCAATGAGTACACTGCATTTAAGAACTATGGTCCTGTGCACACTCACGCTAGATGGTTCAATGACATGATCAATGTCCCATTCTCATCAAAAGCATTTGTTGCTGGCTCCTTGGCACTGTTCTTGGATACCACATTGCACAACAAAGACAGTCAAACACGTAAGGACAGAGGCATGCACTGGTGGGACAGATTCAGTTCATTCAAGACAGATACAAGGAGTGAGGAGTTTTACTCTCTACCTTTCAATCTAAACAAGTTCTTTCCCTCTGTATGA 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>Glyma.02g031000.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g031000.8.p locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGCAGCAGCTGCACCACCACCCAAGCCGGAAGAGCTTCAGCCACACCCTGTGAAAGATCAACTTCCAAATGTTTCATACTGCATCACTAGTCCTCCTCCATGGCCGGAGGCGATACTACTTGGTTTCCAACATTACTTGGTGATGCTTGGCACAACTGTTCTAATACCAACCACTCTTGTTACTCAGATGGGAGGAGGAAATGAAGAGAAAGCAAAAATGGTCCAGACTCTGCTGTTTGTTGCTGGCATAAACACATTTTTCCAAACACTATTTGGGACTCGTCTACCTGCAGTTATTGGAGGATCCTGCACCTTTGTGCCAACTACCATTTCTATCATTTTTGCTGGTCGCTACAGTGACATTGTGAATCCTCAGGAGAGGTTTGAGAGGATAATGCGTGGAACACAGGGTGCGCTTATTGTTGCTTCGACCTTGCAAATTGTTGTTGGCTTCAGTGGCCTTTGGCGCAATGTAGTGAGGTTCTTAAGCCCTCTCTCTGCTGTTCCCTTGGTTGCTCTGTCAGGCTTTGGACTTTATGAGTTGGGCTTTCCTGTGCTTGCAAAATGTGTGGAGATTGGGCTGCCGGAAATCGTATTCTTACTAGTATTTTCACAGTACATTCCTCATGTGATGAAAGGAGAAAAGCGTATCTTTGATCGATTTGCAGTTATATTCTCAGTGACAATTGTGTGGATTTATGCTCATCTTCTCACTGTGGGTGGAGCATATAAAAATGTACCACAGACAACTCAAGAGACTTGCAGAACTGATCGTGCTGGAATTATAAGTGGTGCACCTTGGATTAGAATCCCATATCCTTTCCAGTGGGGAGCTCCTACATTTGATGCTGGAGAAGCTTTTGCAACGATGGCTGCTTCATTTGTTGCACTAGTAGAGTCAACAGGTGCTTTTATTGCTGTTTCAAGGTATGCAAGTGCAACTCCAATGCCACCTTCAGTTCTTAGCCGTGGTATCGGTTGGCAGGGGGTAGGAATTTTGTTATCAGGGATCTTTGGGACAGGGAATGGATCATCAGTTTCTGTAGAGAATGCTGGACTCTTAGCTTTAACGCAAGTTGGTAGCCGCAGGGTTGTTCAAATATCAGCAGGATTCATGATCTTTTTCTCCATACTTGGAAAATTCGGAGCTGTGTTTGCTTCAATCCCAGCACCAATAGTTGCAGCTTTATATTGCCTTTTCTTTGCCTATGTGGGTTCTGCAGGCCTCGGTTTCCTTCAGTTTTGCAATTTAAACAGCTTTAGAACTAAACTCATCTTGGGGTTCTCTATTTTCATGGGCTTCTCTATACCACAATACTTCAATGAGTACACTGCATTTAAGAACTATGGTCCTGTGCACACTCACGCTAGATGGTTCAATGACATGATCAATGTCCCATTCTCATCAAAAGCATTTGTTGCTGGCTCCTTGGCACTGTTCTTGGATACCACATTGCACAACAAAGACAGTCAAACACGTAAGGACAGAGGCATGCACTGGTGGGACAGATTCAGTTCATTCAAGACAGATACAAGGAGTGAGGAGTTTTACTCTCTACCTTTCAATCTAAACAAGTTCTTTCCCTCTGTATGA
>Glyma.02g031000.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g031000.1 locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAAAPPPKPEELQPHPVKDQLPNVSYCITSPPPWPEAILLGFQHYLVMLGTTVLIPTTLVTQMGGGNEEKAKMVQTLLFVAGINTFFQTLFGTRLPAVIGGSCTFVPTTISIIFAGRYSDIVNPQERFERIMRGTQGALIVASTLQIVVGFSGLWRNVVRFLSPLSAVPLVALSGFGLYELGFPVLAKCVEIGLPEIVFLLVFSQYIPHVMKGEKRIFDRFAVIFSVTIVWIYAHLLTVGGAYKNVPQTTQETCRTDRAGIISGAPWIRIPYPFQWGAPTFDAGEAFATMAASFVALVESTGAFIAVSRYASATPMPPSVLSRGIGWQGVGILLSGIFGTGNGSSVSVENAGLLALTQVGSRRVVQISAGFMIFFSILGKFGAVFASIPAPIVAALYCLFFAYVGSAGLGFLQFCNLNSFRTKLILGFSIFMGFSIPQYFNEYTAFKNYGPVHTHARWFNDMINVPFSSKAFVAGSLALFLDTTLHNKDSQTRKDRGMHWWDRFSSFKTDTRSEEFYSLPFNLNKFFPSV* >Glyma.02g031000.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g031000.2 locus=Glyma.02g031000 ID=Glyma.02g031000.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||