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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G25540.1 | AT | phytochrome and flowering time regulatory protein (PFT1) | JGI | N/A | IEA |
PTHR12433 | Panther | PROSTATE TUMOR OVEREXPRESSED GENE 1 (PTOV1) | JGI | N/A | IEA |
PTHR12433:SF5 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF11265 | PFAM | Mediator complex subunit 25 von Willebrand factor type A | JGI | N/A | IEA |
Locus | Gene Symbol | Protein Name |
---|---|---|
MED25-3 | Mediator Complex 25 gene 3 |
Glyma.02G098500 not represented in the dataset |
Glyma.02G098500 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma.02g098500 | Wm82.a4.v1 | ISS | As supplied by JGI |
Glyma02g10901 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
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>Glyma.02g098500.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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ATGGCGGCGAAACGGCTTATTGTCGTCGTGGAGAGCACCGCCGCCATGGGGCCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGATGTTTTGGTGAAAATGACTCAACTGTGCAGAACTCTTGTTCCAATGTGGAGTTTGCTCTAGTCTCCTATAATACACATGGATGTTATTCTGGTTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACAAGAGATCCAGATGTTTTCTTCATGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGTGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGGTGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTAGACATGCACCAGCATTGCATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCAGACACCAATTTATGTTCCGCAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGACTCATTCCCAGGGAACCGTTTATATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGTTTTCTATTTCTCTATCAGTCATCTGCCCGAAAGAACTTCCTAAAATTAAAGGCATCTACAATGCAGGAAATCGAAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCACAGGGTGCATTAAAGGTTGGTGAGGGTTACAGCAATTCTTCTGAGTCTGAGAAAGTTGCAGCAAAATGGCCCCCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGA >Glyma.02g098500.12 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g098500.12.p locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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ATGGCGGCGAAACGGCTTATTGTCGTCGTGGAGAGCACCGCCGCCATGGGGCCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGATGTTTTGGTGAAAATGACTCAACTGTGCAGAACTCTTGTTCCAATGTGGAGTTTGCTCTAGTCTCCTATAATACACATGGATGTTATTCTGGTTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACAAGAGATCCAGATGTTTTCTTCATGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGTGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGGTGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTAGACATGCACCAGCATTGCATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCAGACACCAATTTATGTTCCGCAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGACTCATTCCCAGGGAACCGTTTATATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGTTTTCTATTTCTCTATCAGTCATCTGCCCGAAAGAACTTCCTAAAATTAAAGGCATCTACAATGCAGGAAATCGAAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCACAGGGTGCATTAAAGGTTGGTGAGGGTTACAGCAATTCTTCTGAGTCTGAGAAAGTTGCAGCAAAATGGCCCCCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGA >Glyma.02g098500.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g098500.3.p locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGCGGCGAAACGGCTTATTGTCGTCGTGGAGAGCACCGCCGCCATGGGGCCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGATGTTTTGGTGAAAATGACTCAACTGTGCAGAACTCTTGTTCCAATGTGGAGTTTGCTCTAGTCTCCTATAATACACATGGATGTTATTCTGGTTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACAAGAGATCCAGATGTTTTCTTCATGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGTGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGGTGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTAGACATGCACCAGCATTGCATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCAGACACCAATTTATGTTCCGCAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGACTCATTCCCAGGGAACCGTTTATATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGGGAAATCGAAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCACAGGGTGCATTAAAGGTTGGTGAGAGTTGCAGCAAAATGGCCCCCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGAATAACAAAGAATATGTAGTTTTTCAGGCAATGAACCCATATGGATTTCGTGGTCACCTGGAGGATAAGAAAAAGCTGCTGCTTCAAAGGTTGCTATTCTGGATAAATAGAGAACTTGAGATTGTGGCCTTGCTGCAATTCTTATTTGGCAAATAG >Glyma.02g098500.7 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g098500.7.p locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGCGGCGAAACGGCTTATTGTCGTCGTGGAGAGCACCGCCGCCATGGGGCCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGATGTTTTGGTGAAAATGACTCAACTGTGCAGAACTCTTGTTCCAATGTGGAGTTTGCTCTAGTCTCCTATAATACACATGGATGTTATTCTGGTTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACAAGAGATCCAGATGTTTTCTTCATGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGTGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGGTGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTAGACATGCACCAGCATTGCATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCAGACACCAATTTATGTTCCGCAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGACTCATTCCCAGGGAACCGTTTATATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGTTTTCTATTTCTCTATCAGTCATCTGCCCGAAAGAACTTCCTAAAATTAAAGGCATCTACAATGCAGGAAATCGAAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCACAGGGTGCATTAAAGGTTGGTGAGGGTTACAGCAATTCTTCTGAGTCTGAGAAAGTTGCAGCAAAATGGCCCCCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGA >Glyma.02g098500.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g098500.8.p locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGCGGCGAAACGGCTTATTGTCGTCGTGGAGAGCACCGCCGCCATGGGGCCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGATGTTTTGGTGAAAATGACTCAACTGTGCAGAACTCTTGTTCCAATGTGGAGTTTGCTCTAGTCTCCTATAATACACATGGATGTTATTCTGGTTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACAAGAGATCCAGATGTTTTCTTCATGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGTGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGGTGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTAGACATGCACCAGCATTGCATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCAGACACCAATTTATGTTCCGCAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGACTCATTCCCAGGGAACCGTTTATATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGGGAAATCGAAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCACAGGGTGCATTAAAGGTTGGTGAGAGTTGCAGCAAAATGGCCCCCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGAATAACAAAGAATATGTAGTTTTTCAGGCAATGAACCCATATGGATTTCGTGGTCACCTGGAGGATAAGAAAAAGCTGCTGCTTCAAAGGTTGCTATTCTGGATAAATAGAGAACTTGAGATTGTGGCCTTGCTGCAATTCTTATTTGGCAAATAG >Glyma.02g098500.9 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.02g098500.9.p locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGCGGCGAAACGGCTTATTGTCGTCGTGGAGAGCACCGCCGCCATGGGGCCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGATGTTTTGGTGAAAATGACTCAACTGTGCAGAACTCTTGTTCCAATGTGGAGTTTGCTCTAGTCTCCTATAATACACATGGATGTTATTCTGGTTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACAAGAGATCCAGATGTTTTCTTCATGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGTGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGGTGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTAGACATGCACCAGCATTGCATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCAGACACCAATTTATGTTCCGCAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGACTCATTCCCAGGGAACCGTTTATATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGTTTTCTATTTCTCTATCAGTCATCTGCCCGAAAGAACTTCCTAAAATTAAAGGCATCTACAATGCAGGAAATCGAAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCACAGGGTGCATTAAAGGTTGGTGAGAGTTGCAGCAAAATGGCCCCCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGAATAACAAAGAATATGTAGTTTTTCAGGCAATGAACCCATATGGATTTCGTGGTCACCTGGAGGATAAGAAAAAGCTGCTGCTTCAAAGGTTGCTATTCTGGATAAATAGAGAACTTGAGATTGTGGCCTTGCTGCAATTCTTATTTGGCAAATAG
>Glyma.02g098500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g098500.1 locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENDSTVQNSCSNVEFALVSYNTHGCYSGCLVQRTGWTRDPDVFFMWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALVMFPNSQSGDPNQQNVDMHQHCILVAASNPYPLQTPIYVPQLQNLEQSETIDSFPGNRLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKELPKIKGIYNAGNRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGALKVGESCSKMAPCNANSSAYISSHMNNKEYVVFQAMNPYGFRGHLEDKKKLLLQRLLFWINRELEIVALLQFLFGK* >Glyma.02g098500.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g098500.10 locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENDSTVQNSCSNVEFALVSYNTHGCYSGCLVQRTGWTRDPDVFFMWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALVMFPNSQSGDPNQQNVDMHQHCILVAASNPYPLQTPIYVPQLQNLEQSETIDSFPGNRLYDAEAVAKAFPQGNRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGALKVGEGYSNSSESEKVAAKWPPVMQIVQLISQAT* >Glyma.02g098500.11.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g098500.11 locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENDSTVQNSCSNVEFALVSYNTHGCYSGCLVQRTGWTRDPDVFFMWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALVMFPNSQSGDPNQQNVDMHQHCILVAASNPYPLQTPIYVPQLQNLEQSETIDSFPGNRLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKELPKIKGIYNAGNRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGALKVGEGYSNSSESEKVAAKWPPVMQIVQLISQAT* >Glyma.02g098500.12.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g098500.12 locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.12.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENDSTVQNSCSNVEFALVSYNTHGCYSGCLVQRTGWTRDPDVFFMWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALVMFPNSQSGDPNQQNVDMHQHCILVAASNPYPLQTPIYVPQLQNLEQSETIDSFPGNRLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKELPKIKGIYNAGNRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGALKVGEGYSNSSESEK* >Glyma.02g098500.13.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.02g098500.13 locus=Glyma.02g098500 ID=Glyma.02g098500.13.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||