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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT4G36760.1 | AT | aminopeptidase P1 | JGI | N/A | IEA |
GO:0006508 | GO-bp | proteolysis | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0009987 | GO-bp | cellular process | JGI | N/A | IEA |
GO:0016020 | GO-cc | membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016021 | GO-cc | integral component of membrane | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0004177 | GO-mf | aminopeptidase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016787 | GO-mf | hydrolase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0016787 | GO-mf | hydrolase activity | JGI | N/A | IEA |
GO:0046872 | GO-mf | metal ion binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
GO:0070006 | GO-mf | metalloaminopeptidase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
KOG2413 | KOG | Xaa-Pro aminopeptidase | JGI | N/A | IEA |
PTHR10804 | Panther | PROTEASE FAMILY M24 (METHIONYL AMINOPEPTIDASE, AMINOPEPTIDASE P) | JGI | N/A | IEA |
PTHR10804:SF6 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF00557 | PFAM | Metallopeptidase family M24 | JGI | N/A | IEA |
PF01321 | PFAM | Creatinase/Prolidase N-terminal domain | JGI | N/A | IEA |
Glyma.01g177700 not represented in the dataset |
Glyma.01g177700 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Paralog | Evidence | Comments |
---|---|---|
Glyma.11g064500 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma01g38410 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.01g177700.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g177700 ID=Glyma.01g177700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g177700.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g177700 ID=Glyma.01g177700.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g177700.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g177700 ID=Glyma.01g177700.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g177700.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g177700 ID=Glyma.01g177700.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g177700.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g177700 ID=Glyma.01g177700.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g177700.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.01g177700.1.p locus=Glyma.01g177700 ID=Glyma.01g177700.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||