SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.01g117200

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm01
Start:41056512
stop:41064005
Source:JGI
Version:Wm82.a4.v1
High confidence:yes



Annotations for Glyma.01g117200
Database IDAnnotation TypeAnnotation DescriptionAnnotation SourceMatch ScoreEvidence Code
AT1G47890.1AT AtRLP7,RLP7 JGI N/AIEA
GO:0005515GO-mf protein binding JGI N/AIEA
KOG0472 KOG Leucine-rich repeat protein JGI N/AIEA
PTHR27004PantherFam RECEPTOR-LIKE PROTEIN 12 ISOFORM X1 JGI N/AIEA
PF08263Pfam Leucine rich repeat N-terminal domain JGI N/AIEA
PF13855Pfam Leucine rich repeat JGI N/AIEA

Gene model name correspondences to Glyma.01g117200 Gene Call Version Wm82.a4.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma01g29030 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Coding sequences of Glyma.01g117200
>Glyma.01g117200.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.01g117200.1.p locus=Glyma.01g117200 id=Glyma.01g117200.1.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.01g117200.2 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.01g117200.2.p locus=Glyma.01g117200 id=Glyma.01g117200.2.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.01g117200.3 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.01g117200.3.p locus=Glyma.01g117200 id=Glyma.01g117200.3.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.01g117200.4 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.01g117200.4.p locus=Glyma.01g117200 id=Glyma.01g117200.4.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Predicted protein sequences of Glyma.01g117200
>Glyma.01g117200.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g117200.1 locus=Glyma.01g117200 id=Glyma.01g117200.1.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.01g117200.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g117200.2 locus=Glyma.01g117200 id=Glyma.01g117200.2.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
MRAHKLLLFFIQFCLINYSANIFPANGYFLGHQCSIVLHLKNNLIFNSTKSKKLTLWNQTEDCCQWHGVTCNEGRVIALDLSEESISGGLVNSSSLFSLQYLQSLNLAFNNLSSVIPSELYKLNNLRYLNLSNAGFEGQIPDEIFHLRRLVTLDLSSSFTSRDRLKLEKPDIAVFQNLTDITELYLDGVAISAKGQEWGHALSSSQKLRVLSMSSCNLSGPIDSSLAKLLPLTVLKLSHNNMSSAVPKSFVNFSNLVTLELRSCGLNGSFPKDIFQISTLKFLDISDNQDLGGSLPNFPQHGSLHDLNLSYTNFSGKLPGAISNLKQLSAIDLSYCQFNGTLPSSFSELSQLVYLDLSSNNFTGSLPSFNLSKNLTYLSLFNNHLSGVLPSSHFEGLKKLVSIDLGFNFFGGSLPSSLLKLPYLRELKLPFNQFNGSLDEFVIASPLLEMLDLCNNNIRGPIPMSIFNLRTLRVIQLKSNKFNGTIQLDKIRKLSNLIELGLSHNNLSVDINFRDDHDLSPFPHMTHIMLASCKLRRIPSFLINQSILIYLDLSDNGIEGPIPNWISQLGYLAHLNLSKNFLTHLQESNTLVRLTNLLLVDLSSNQLQESFPFIPSFITHLDYSNNRFNSVIPMDIGNHLPFMNFLSLSNNSFQGQIPESFCNASSLLLLDLSLNNFVGMIPMCITKLSNTLKVLHFGGNKLQGYIPNTLPTSCTLKLLDLNDNLLEGTIPKSLANCQKLQVLNLQKNLLSDRFPCFLTNISTLRIMDLRSNKLHGSIGCPRSSGDWEMLHVVDLASNNFSGAIPGALLNTWKAMKPEFGHLFFDLVDYYDQKNFKDLLTHTNKSIVAILAKLVTNVPRSILDQTSSDNYNTGELSRYQDSIIITYKGKQIKLVRIQRAFTYVDMSSNNFEGPIPNELMQFKGLNALNLSNNALSGHVPSSIGNLKNLESLDLSNNSFNGEIPTELASLSFLAYLNLSYNHLVGEIPKGTQIQSFDADSFEGNEELFGPPLTHNCSNDEVPTPETPHSHTESSIDWTFLSVELGCIFGFGIFILPLIFWSRWRLWYSKHVDEMLHRIIPQLDFAYQHRGGKRYKILVWRY*

>Glyma.01g117200.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g117200.3 locus=Glyma.01g117200 id=Glyma.01g117200.3.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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>Glyma.01g117200.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g117200.4 locus=Glyma.01g117200 id=Glyma.01g117200.4.p.Wm82.a4.v1 annot-version=Wm82.a4.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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