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A previous version of this gene model can be found here:
Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
---|---|---|---|---|---|
AT1G25540.1 | AT | phytochrome and flowering time regulatory protein (PFT1) | JGI | N/A | IEA |
PTHR12433 | Panther | PROSTATE TUMOR OVEREXPRESSED GENE 1 (PTOV1) | JGI | N/A | IEA |
PTHR12433:SF5 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
PF11265 | PFAM | Mediator complex subunit 25 von Willebrand factor type A | JGI | N/A | IEA |
Locus | Gene Symbol | Protein Name |
---|---|---|
MED25-2 | Mediator Complex 25 gene 2 |
Glyma.01g086600 not represented in the dataset |
Glyma.01g086600 not represented in the dataset |
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
---|---|---|---|
Glyma01g21831 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.01g086600.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g086600.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g086600.1 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.01g086600.1.p locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGCTCGCGGGAGTGGCACTGAACACAGCACTGCCCAGTGGCCACCCGCCACTGCATTCATCCCACGCCCAAAAATTAATTCGAAAAAAACAAAACAGTGTGCGCTTCTTTCTTAATTCATTTCATTTTGCAGTTATGCGGCGTGATGGCGGCAAAACGGCTTATCGTCGTTGTGGAAAGCACCGCCGCCATGGGACCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGAACTCTTCTTCTAGTGTGGAGTTTGCTTTAGTCTCCTATAATACTCATGGATGTTATTCTGATTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACTAGAGACCCAGATGTTTTCTTCCTGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGCGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGATGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTGGAAATCCATCAGCATTGTATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCGGACACCAATTTGTGTTCCACAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGAATCATTCCCAGGGAACTGTTTGTATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGTTTTCTATTTCTCTGTCAGTCATATGCCCGAAACAACTGCCCAAAATTAAAGCCATCTACAATGCAGGAAAACGGAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCGCAGGGTGTGTTGAAGGTCGGTGAGATTTGCAGCAAAATGGCCTGCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGAATAACAAAGAATATGTAGTTTTACGAGCAATGTACCCATATGGATTTCGTGGTCAGCAGCAGATAAGAAGAAGCTGCTGCTTCAAAGGAGTTGCTATTCTGGATAAATAG 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ATGCTCGCGGGAGTGGCACTGAACACAGCACTGCCCAGTGGCCACCCGCCACTGCATTCATCCCACGCCCAAAAATTAATTCGAAAAAAACAAAACAGTGTGCGCTTCTTTCTTAATTCATTTCATTTTGCAGTTATGCGGCGTGATGGCGGCAAAACGGCTTATCGTCGTTGTGGAAAGCACCGCCGCCATGGGACCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGAACTCTTCTTCTAGTGTGGAGTTTGCTTTAGTCTCCTATAATACTCATGGATGTTATTCTGATTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACTAGAGACCCAGATGTTTTCTTCCTGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGCGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGATGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTGGAAATCCATCAGCATTGTATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCGGACACCAATTTGTGTTCCACAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGAATCATTCCCAGGGAACTGTTTGTATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGTTTTCTATTTCTCTGTCAGTCATATGCCCGAAACAACTGCCCAAAATTAAAGCCATCTACAATGCAGGAAAACGGAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCGCAGGGTGTGTTGAAGGTCGGTGAGATTTGCAGCAAAATGGCCTGCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGAATAACAAAGAATATGTAGTTTTACGAGCAATGTACCCATATGGATTTCGTGGTCAGCAGCAGATAAGAAGAAGCTGCTGCTTCAAAGGAGTTGCTATTCTGGATAAATAG 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>Glyma.01g086600.8 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.01g086600.8.p locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGCTCGCGGGAGTGGCACTGAACACAGCACTGCCCAGTGGCCACCCGCCACTGCATTCATCCCACGCCCAAAAATTAATTCGAAAAAAACAAAACAGTGTGCGCTTCTTTCTTAATTCATTTCATTTTGCAGTTATGCGGCGTGATGGCGGCAAAACGGCTTATCGTCGTTGTGGAAAGCACCGCCGCCATGGGACCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGAACTCTTCTTCTAGTGTGGAGTTTGCTTTAGTCTCCTATAATACTCATGGATGTTATTCTGATTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACTAGAGACCCAGATGTTTTCTTCCTGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGCGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGATGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTGGAAATCCATCAGCATTGTATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCGGACACCAATTTGTGTTCCACAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGAATCATTCCCAGGGAACTGTTTGTATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGTTTTCTATTTCTCTGTCAGTCATATGCCCGAAACAACTGCCCAAAATTAAAGCCATCTACAATGCAGGAAAACGGAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCGCAGGGTGTGTTGAAGGTCGGTGAGGGCAATTCTTCTGTCTCTGAGTCTGAGAAATTTGCAGCAAAATGGCCTGCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGA >Glyma.01g086600.9 sequence-type=CDS polypeptide=Glyma.01g086600.9.p locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 ATGGCGGCAAAACGGCTTATCGTCGTTGTGGAAAGCACCGCCGCCATGGGACCCTATTGGGAGACCATTCTGAGGGATTATCTCGACAAGATTATCAGGTGTTTTGGTGAAAATGTCTCAACTGTGCAGAACTCTTCTTCTAGTGTGGAGTTTGCTTTAGTCTCCTATAATACTCATGGATGTTATTCTGATTGTCTTGTGCAACGGACTGGCTGGACTAGAGACCCAGATGTTTTCTTCCTGTGGCTATCATCTATACCCTTTAGCGGTGGCGGTTTTAATGATGCAGTGATTGCTGAAGGGCTTGCTGAAGCTCTGATGATGTTCCCAAATTCTCAAAGTGGAGACCCTAATCAGCAGAATGTGGAAATCCATCAGCATTGTATCCTTGTTGCAGCAAGTAATCCTTATCCGTTGCGGACACCAATTTGTGTTCCACAACTGCAGAACCTAGAGCAGAGTGAAACCATTGAATCATTCCCAGGGAACTGTTTGTATGATGCTGAAGCTGTAGCTAAAGCATTTCCTCAGGGAAAACGGAATAGTAAAGCAGCTGATCCACCAGTTTTGGCTAAAACCCCTCATTTTCTTATTTTAATATCAGAAGGTTTCAGGGAAGCGCAGGGTGTGTTGAAGGTCGGTGAGGGCAATTCTTCTGTCTCTGAGTCTGAGAAATTTGCAGCAAAATGGCCTGCTGTAATGCAAATAGTTCAGCTTATATCTCAAGCCACATGA
>Glyma.01g086600.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.1 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MLAGVALNTALPSGHPPLHSSHAQKLIRKKQNSVRFFLNSFHFAVMRRDGGKTAYRRCGKHRRHGTLLGDHSEGLSRQDYQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEICSKMACCNANSSAYISSHMNNKEYVVLRAMYPYGFRGQQQIRRSCCFKGVAILDK* >Glyma.01g086600.10.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.10 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENVSTVQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEGNSSVSESEK* >Glyma.01g086600.2.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.2 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENVSTVQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEICSKMACCNANSSAYISSHMNNKEYVVLRAMYPYGFRGQQQIRRSCCFKGVAILDK* >Glyma.01g086600.3.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.3 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENVSTVQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEICSKMACCNANSSAYISSHMNNKEYVVLRAMYPYGFRGQQQIRRSCCFKGVAILDK* >Glyma.01g086600.4.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.4 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MLAGVALNTALPSGHPPLHSSHAQKLIRKKQNSVRFFLNSFHFAVMRRDGGKTAYRRCGKHRRHGTLLGDHSEGLSRQDYQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEICSKMACCNANSSAYISSHMNNKEYVVLRAMYPYGFRGQQQIRRSCCFKGVAILDK* >Glyma.01g086600.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.5 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENVSTVQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEICSKMACCNANSSAYISSHMNNKEYVVLRAMYPYGFRGQQQIRRSCCFKGVAILDK* >Glyma.01g086600.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.6 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENVSTVQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEICSKMACCNANSSAYISSHMNNKEYVVLRAMYPYGFRGQQQIRRSCCFKGVAILDK* >Glyma.01g086600.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.7 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MLAGVALNTALPSGHPPLHSSHAQKLIRKKQNSVRFFLNSFHFAVMRRDGGKTAYRRCGKHRRHGTLLGDHSEGLSRQDYQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEICSKMACCNANSSAYISSHMNNKEYVVLRAMYPYGFRGQQQIRRSCCFKGVAILDK* >Glyma.01g086600.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.8 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MLAGVALNTALPSGHPPLHSSHAQKLIRKKQNSVRFFLNSFHFAVMRRDGGKTAYRRCGKHRRHGTLLGDHSEGLSRQDYQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQFSISLSVICPKQLPKIKAIYNAGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEGNSSVSESEKFAAKWPAVMQIVQLISQAT* >Glyma.01g086600.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g086600.9 locus=Glyma.01g086600 ID=Glyma.01g086600.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MAAKRLIVVVESTAAMGPYWETILRDYLDKIIRCFGENVSTVQNSSSSVEFALVSYNTHGCYSDCLVQRTGWTRDPDVFFLWLSSIPFSGGGFNDAVIAEGLAEALMMFPNSQSGDPNQQNVEIHQHCILVAASNPYPLRTPICVPQLQNLEQSETIESFPGNCLYDAEAVAKAFPQGKRNSKAADPPVLAKTPHFLILISEGFREAQGVLKVGEGNSSVSESEKFAAKWPAVMQIVQLISQAT*
Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||