Glyma.01g073400

SoyBase SoyBase transitions to NEW site on 10/1/2024
Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research

Report for Sequence Feature Glyma.01g073400

Feature Type:	gene_model
Chromosome:	Gm01
Start:	14046570
stop:	14097862
Source:	JGI
Version:	Wm82.a2.v1
High confidence:	yes

A previous version of this gene model can be found here:

Annotations for Glyma.01g073400

Database ID	Annotation Type	Annotation Description	Annotation Source	Match Score	Evidence Code
AT2G44980.2	AT	SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein	JGI	N/A	IEA
GO:0003676	GO-mf	nucleic acid binding	JGI	N/A	IEA
GO:0003677	GO-mf	DNA binding	JGI	N/A	IEA
GO:0004386	GO-mf	helicase activity	JGI	N/A	IEA
GO:0005524	GO-mf	ATP binding	EnsemblGenomes	N/A	IEA
GO:0005524	GO-mf	ATP binding	JGI	N/A	IEA
KOG0385	KOG	Chromatin remodeling complex WSTF-ISWI, small subunit	JGI	N/A	IEA
PTHR10799	Panther	SWI/SNF-RELATED MATRIX-ASSOCIATED ACTIN-DEPENDENT REGULATOR OF CHROMATIN SUBFAMILY-RELATED	JGI	N/A	IEA
PTHR10799:SF111	Panther		JGI	N/A	IEA
PF00176	PFAM	SNF2 family N-terminal domain	JGI	N/A	IEA
PF00271	PFAM	Helicase conserved C-terminal domain	JGI	N/A	IEA

Expression Patterns of Glyma.01g073400

Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.01g073400 not represented in the dataset	Glyma.01g073400 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection	Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.

Gene information in GlycineMine developed by LIS.

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Gene families from PhyloGenes.

Gene model name correspondences to Glyma.01g073400 Gene Call Version Wm82.a2.v1

Corresponding Name	Annotation Version	Evidence	Comments
Glyma01g13945	Wm82.a1.v1.1	IGC	As supplied by JGI

Transcripts of Glyma.01g073400

Limit To All Plant Sequences

>Glyma.01g073400.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g073400.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g073400.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g073400.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g073400.6 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g073400.7 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.01g073400

Limit To All Plant Sequences

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Predicted protein sequences of Glyma.01g073400

Limit To All Plant Sequences

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>Glyma.01g073400.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g073400.5 locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g073400.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g073400.6 locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g073400.7.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g073400.7 locus=Glyma.01g073400 ID=Glyma.01g073400.7.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA

U.S. Public Domain