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A previous version of this gene model can be found here:
| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT1G76630.1 | AT | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
| AT1G76630.2 | AT | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | JGI | N/A | IEA |
| GO:0006401 | GO-bp | RNA catabolic process | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0055087 | GO-cc | Ski complex | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0005515 | GO-mf | protein binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0005515 | GO-mf | protein binding | JGI | N/A | IEA |
| KOG1127 | KOG | TPR repeat-containing protein | JGI | N/A | IEA |
| PTHR23083 | Panther | TETRATRICOPEPTIDE REPEAT PROTEIN, TPR | JGI | N/A | IEA |
| PTHR23083:SF174 | Panther | JGI | N/A | IEA | |
| PF00515 | PFAM | Tetratricopeptide repeat | JGI | N/A | IEA |
|
Glyma.01G245200 not represented in the dataset |
Glyma.01G245200 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma.01g245200 | Wm82.a4.v1 | ISS | As supplied by JGI |
| Glyma01g45670 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.01g245200.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g245200 ID=Glyma.01g245200.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g245200.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g245200 ID=Glyma.01g245200.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g245200.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g245200 ID=Glyma.01g245200.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g245200.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g245200.1 locus=Glyma.01g245200 ID=Glyma.01g245200.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g245200.5.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g245200.5 locus=Glyma.01g245200 ID=Glyma.01g245200.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MCSNFLFFHQSWRILVPSGFWPLVCRLPEPPTLLLWLLTPVTHLLAYLKLLWFLGCLTLVRSTTFLLYRKVDEKQLARQMFDRARSIDPGLALPWASMSFESCVGRELESDEAFESCSRAVQIMPLAEFQLGLTKLALLSGHLSSSQVFGAIQQAVQLSPHYPESHNLHGLVCEARNDYKSASTFYRLARHAINIGSRSIHNSHIREISINLARSLSKAGNAADALQECEHLKKEGALDDEGLQVYGFSLWQLGENDLALSVARSLAATLSSMQKTSVATSICFICRLVYYIRGLDAAITSIVKMPKELFQSSKVSFVMTAINALDRQNRLGFVVSSSRYFLKYHEEIAGMHLLIALSKLVKNESDCCLDIQSGVAHLKKALHMFPNCSLIRNLLGYLMVSSKELNNCHVATRCCKLDHLDLSDQKGFKSASDIHGAGAVACYTTGNSIPKFTFPTCTKQCSNHPGAIRHLQKCFHQKPWNHDSRYLLVLNYLQRAREQRFPHHLCRILNRLTHAALSNDLYSRTEMLYRYRYFQLLLCASEISLQCGNHMTCITHAKKASELVLPDDYLFFAHLLLCRVYAMKGDHLSFQKEYIRCLELKTDYHIGWICLKLMECQYELQIDSNTIDLNFEECVKRSGKLCNMWMAVYNLVRGMISLQKRDLVSAEDFMAQACSLAGFESCLFLCHGAICMELVRQCHGSQFLSRAINSLTKVHEHSLIPLPFVSVLVAQAEGSHGSKERWNRNLRLEWYNWPPEMRPAELYFQMHMLARQLKVGPNASIESTQSPHRWVIRAIHMNPSCMRYWRILQKLMEET* >Glyma.01g245200.6.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g245200.6 locus=Glyma.01g245200 ID=Glyma.01g245200.6.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 MCSNFLFFHQSWRILVPSGFWPLVCRLPEPPTLLLWLLTPVTHLLAYLKLLWFLGCLTLVRSTTFLLYRKVDEKQLARQMFDRARSIDPGLALPWASMSFESCVGELESDEAFESCSRAVQIMPLAEFQLGLTKLALLSGHLSSSQVFGAIQQAVQLSPHYPESHNLHGLVCEARNDYKSASTFYRLARHAINIGSRSIHNSHIREISINLARSLSKAGNAADALQECEHLKKEGALDDEGLQVYGFSLWQLGENDLALSVARSLAATLSSMQKTSVATSICFICRLVYYIRGLDAAITSIVKMPKELFQSSKVSFVMTAINALDRQNRLGFVVSSSRYFLKYHEEIAGMHLLIALSKLVKNESDCCLDIQSGVAHLKKALHMFPNCSLIRNLLGYLMVSSKELNNCHVATRCCKLDHLDLSDQKGFKSASDIHGAGAVACYTTGNSIPKFTFPTCTKQCSNHPGAIRHLQKCFHQKPWNHDSRYLLVLNYLQRAREQRFPHHLCRILNRLTHAALSNDLYSRTEMLYRYRYFQLLLCASEISLQCGNHMTCITHAKKASELVLPDDYLFFAHLLLCRVYAMKGDHLSFQKEYIRCLELKTDYHIGWICLKLMECQYELQIDSNTIDLNFEECVKRSGKLCNMWMAVYNLVRGMISLQKRDLVSAEDFMAQACSLAGFESCLFLCHGAICMELVRQCHGSQFLSRAINSLTKVHEHSLIPLPFVSVLVAQAEGSHGSKERWNRNLRLEWYNWPPEMRPAELYFQMHMLARQLKVGPNASIESTQSPHRWVIRAIHMNPSCMRYWRILQKLMEET*
| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||