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Deprecated: preg_match(): Passing null to parameter #2 ($subject) of type string is deprecated in /var/www/html/include/SeqFeatClass.php on line 1031

Report for Sequence Feature Glyma.01G175700

Feature Type:gene_model
Chromosome:Gm01
Start:51244446
stop:51248246
Source:JGI
Version:Wm82.a2.v1
High confidence:yes



A previous version of this gene model can be found here:

Expression Patterns of Glyma.01G175700
Gene expression representations made with eFP at the University of Toronto.
Waese et al. 2017, Plant Cell 29(8):1806-1821 ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology

Glyma.01G175700 not represented in the dataset
Glyma.01G175700 not represented in the dataset
Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552.
Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection 		Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160
RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome

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Gene model name correspondences to Glyma.01G175700 Gene Call Version Wm82.a2.v1
Corresponding NameAnnotation VersionEvidenceComments
Glyma.01g175700 Wm82.a4.v1ISS As supplied by JGI
Glyma01g38211 Wm82.a1.v1.1IGC As supplied by JGI


Transcripts of Glyma.01G175700
>Glyma.01g175700.10 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g175700 ID=Glyma.01g175700.10.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATTCAGCGCCTCCTCGTCTTCAATCCTTTCGTTATTCTCTTATTCATCCTTCTCTTCTGAATAATCCAGATCTCTTTCTGCCCTTTTCTCCGTCACGCTTTTCGTGACCGGATCTGTATGGATTTGATCCAGATCTACACGCCGATGGTGGTTTTGGCCGGGTCTTTCATAGATCTGGTGCGTAGAGGCTCAGATCTACGGTACCGAGAGAATCGATGACAAGAACGCAGATCCGACGGTAGATCCAGCCGATTCCGCTTGTTCGATCGCTACAGACCCCTGTATCGGATCATTAAGCAGCGTGTCTCGCGCGTTCTACACGTGTTGCCGATCTCGGATGTTGTAAAATTAGTTTATGATGTGAAGCTATGGAGTGGAAAATATGTGGATGTAGGAGATTTCGGGATGAATGGCCTCAAAACGCTTTGTCGTTTGTGGTTATTGAGTCCTGAGTGATCTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCAAAAAATGTTAATAAAAAAAGTTTTATTGGTTTGGGGAGAGATCGCACGGGGGTTGCCCGGGGTCTCTTCCTCTTGTGTGGTGTGGTGTTTGCTGTGCTCTCCTTTTCGTTATGCCTTTTATTATTACCTATCTGTCGCTCCACTCCGTATTACGACTCTGGATCAGAGGATACATCAGAGGATTCGCTCCAACCCCTATCGAGTAAGGTATTATCTGTCAATTTACATTCGAAAGGGTTAGGCTATTGAATTTTAAATAATTACAGATAAAATAATCGATAGCTTTGATTTTAAAAATTAATCATAATCATCGGTTAGGTTGCAACATAATACTTAATTCGCTTAATTTTTTAACTGCGCCTCAGAGTATTCATAACATATTCTATTAAATTAATAAGCTGGTGATGTAATTAATATTAATATGTAGTTTTGGCAATCTTATTGGCAGAAGATGCTAGGTGGAGTTCATCAATATTCTGGTAGGTATAATATCTTCATGAATCTAATATAACGTTATTCATAGTGAAAATAAATCGAGCCAAGGAATTTATTAATAATTGTCTTCATTTCATATTAGCTGCCTGCTGCGACTTCCTTATGCATAATTTTACTGTTTATAGAAATTGTGAAGCTATACTGTTGTAATTGTCATGTAAATTGTTCCCTTTTTCATCTTACTTGATTTGGTAAACTCCGGTTACTTGTATCCAAATAAGATGGGCCATTTGTATTGCGGGGGCTTTGTATAATTGTACAATTATCTACTTGTAAGAAGTTCAGATTCGGGCGACAACATTTGTAATGCAGAATTAGGTCATTAACATTGTAAATCTTCTGGCGATGATTGGAATATCAATGTGAAGACGCTATATGACTTCTGCTATGACAATATCATTGTGGTTGTCAAGGTATTTTTGAAGAAATATCGTGGATTTACAAAGAATCTGGTTAGGCTTCTACAATTCTTTAAGGTGAAGATAACTTCGGCTCTTTACACAAGCATAGAATGATATTTTTTCTTGGTATCAAGTTATTCAGTATGTATGTTTGTTTGTTTTAATTCCCTTGTGCTGCAATTATTTTGATATTTCTGCTGCGATTATTCAGTATAATTAAGTTATTCAGCGTATATTCAGTTATTTAGTACATTGTTATTCAGTATACATAATTATTCTTTGTATATATATAGTTATTCTGTAGTTTACATAGTAATTCTGTATAGTATAAATGGTTTTTTCTGTTTTCTATACAGTTATTTTGCTGCGATTTGTATACTGATTAAATTAATGCATGTTCTGTTTAAGTTCTTACCTGTATACTTGAAATGCTTATTGAGAACCTACAGTAAACAGAAGCCCAGAGTAGTATCTTCGATTTGGCCATCCTATTTTGAATGTTGCATTGTTTTTTAATGTATTTCAACTTCCATCTTCAATTCACTAATCATATATGTTATCTATTTGAGGTTGACTCGCCGATTTATAAATTTGTTACCTGTATGCTTTAAAAGCTTATTGAGAACCACAGAAAACAGAAGCCCAAAGTATCTTCGATTTGAAGTTCCTATTTTGATTGTTGTACTGTTTTTTAATGTATTTCAATTTCGACTACCATTTTCAACTCACTAATCATTTTTGTTGATGACTTGCCGATTTATATATTATTACATGTTCTTTTTTTACAAGTTCTTACCTGTGTAGTATTGCTTATTGAGAACCACAGAAATCTTCGATTTGAAGTTCCTATTTTTGAAGGTTCAACTGTTTTTTAATGTATGTCAACTTCCATTTTTAATTCAATAATCATTCATGTTATCTACTTGAGGCAGTTTACATGTTCTACTTTTAATCTGAAACAATGTTACTGAGTTTTAAAATAGTGTACCTGTTCCAGTAAATATAGTAGTGTTTATTTATTGTTATATTATTTTACGTATGATGTCAATAATGTGTAATGTATTTTTATTGATATAATAATTTTTATAGTGTTACGAGACACAATAAAAAGTCATTACGTTAAGGATTTATAGTGTCATagatgtttggataaaaataattctccttcaagtACAAGTTATTTAAGGACAGGATGATATTAATGTTTTATTTCGGTCCTCTTTATCTCCATGTCAGTGTTAATTTCATTTAATCTCAGTTTTTAAAGTTTATATGAAGTAATGGAATTTTAGATACTTTTTAATTTTTTAAATGATAAAATGTTTTGGACGACAGGACAATATGGATGTTTTATATAGATAAATCCATGTCAAAGTTAATTTCTTTTAATCACAGTTTTAAATTTTATATGAAGTAATGGAATTTTAAATATTTAAAAAAAATTATGTTTTTTGGTTGTTTTTTTGCATCTGATAAAGCTATACATATTTTAGCTCTTAAATCTGAATTTGTTAATTGACTGTTTAAGCAACACAATGTTGCTTTCTTCACGTTTTTTTTTTCATCTGATAAAGCTACATATTTTCGCTCTTAATCTGAATCTGTTAATTGACTTGTTTAAGCAACACAATGTTGCTTGCTTTCCACGTTATTTTTTAAGTACTTATCGGTGTTGGAATTTTCCTAAAGGTTCCCAGCGCCACTATCCGTGTCTTAACCTTTTTCGTTATTTTTTTTCAGTTTGTTATTGTCAATAAAACAGGTTTGTACACAATGGATATTTCGATAAGCGAGTATATTTTTGTAAGAAATTCGCCAGGATTTGTGTTTTTTTTATTATAAAAATTGGTCTTTATATATTGTACAATTTTTTCCAGAGGGTCTAAATGCATGAGTAGGTTTGTTTGAGAGAAGTTATTTTAGCTCTAAATTTGTATATCTGTTGGTGCATCTTTATTTTTAATAGCAAATTTCATGGTTTGTAATTATTGTATATTCGTTGATAGATCTGTAAGCTCAAAACGGTAGAGCGATCAGAGCATTTGTCCACTGACATGCTCTGGTAGGATGGTGGTTCGAATCCACCCAGATCTGCATGTTGAATAGTAATAAAGAAAAAAAAAATGAGGAGCGAAAATAGAATATAAGTGTGCTATTAAATTTAGATGAATAGAGTTATGTAACAGGTAATCTTTCTGGTTGTTT

>Glyma.01g175700.11 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g175700 ID=Glyma.01g175700.11.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g175700.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g175700 ID=Glyma.01g175700.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
ATTCAGCGCCTCCTCGTCTTCAATCCTTTCGTTATTCTCTTATTCATCCTTCTCTTCTGAATAATCCAGATCTCTTTCTGCCCTTTTCTCCGTCACGCTTTTCGTGACCGGATCTGTATGGATTTGATCCAGATCTACACGCCGATGGTGGTTTTGGCCGGGTCTTTCATAGATCTGGTGCGTAGAGGCTCAGATCTACGGTACCGAGGTACAACAGAGAATCGATGACAAGAACGCAGATCCGACGGTAGATCCAGCCGATTCCGCTTGTTCGATCGCTACAGACCCCTGTATCGGATCATTAAGCAGCGTGTCTCGCGCGTTCTACACGTGTTGCCGATCTCGGATGTTGTAAAATTAGTTTATGATGTGAAGCTATGGAGTGGAAAATATGTGGATGTAGGAGATTTCGGGATGAATGGCCTCAAAACGCTTTGTCGTTTGTGGTTATTGAGTCCTGAGTGATCTTGTCATCCGACCTTTGCCATGACAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCAAAAAATGTTAATAAAAAAAGTTTTATTGGTTTGGGGAGAGATCGCACGGGGGTTGCCCGGGGTCTCTTCCTCTTGTGTGGTGTGGTGTTTGCTGTGCTCTCCTTTTCGTTATGCCTTTTATTATTACCTATCTGTCGCTCCACTCCGTATTACGACTCTGGATCAGAGGATACATCAGAGGATTCGCTCCAACCCCTATCGAGTAAGTTTTGGCAATCTTATTGGCAGAAGATGCTAGGTGGAGTTCATCAATATTCTGCTGCCTGCTGCGACTTCCTTATGCATAATTTTACTGTTTATAGAAATTGTGAAGCTATACTGTTGTAATTGTCATGTAAATTGTTCCCTTTTTCATCTTACTTGATTTGGTAAACTCCGGTTACTTGTATCCAAATAAGATGGGCCATTTGTATTGCGGGGGCTTTGTATAATTGTACAATTATCTACTTGTAAGAAGTTCAGATTCGGGCGACAACATTTGTAATGCAGAATTAGGTCATTAACATTGTAAATCTTCTGGCGATGATTGGAATATCAATGTGAAGACGCTATATGACTTCTGCTATGACAATATCATTGTGGTTGTCAAGGTATTTTTGAAGAAATATCGTGGATTTACAAAGAATCTGGTTAGGCTTCTACAATTCTTTAAGGTGAAGATAACTTCGGCTCTTTACACAAGCATAGAATGATATTTTTTCTTGGTATCAAGTTATTCAGTATGTATGTTTGTTTGTTTTAATTCCCTTGTGCTGCAATTATTTTGATATTTCTGCTGCGATTATTCAGTATAATTAAGTTATTCAGCGTATATTCAGTTATTTAGTACATTGTTATTCAGTATACATAATTATTCTTTGTATATATATAGTTATTCTGTAGTTTACATAGTAATTCTGTATAGTATAAATGGTTTTTTCTGTTTTCTATACAGTTATTTTGCTGCGATTTGTATACTGATTAAATTAATGCATGTTCTGTTTAAGTTCTTACCTGTATACTTGAAATGCTTATTGAGAACCTACAGTAAACAGAAGCCCAGAGTAGTATCTTCGATTTGGCCATCCTATTTTGAATGTTGCATTGTTTTTTAATGTATTTCAACTTCCATCTTCAATTCACTAATCATATATGTTATCTATTTGAGGTTGACTCGCCGATTTATAAATTTGTTACCTGTATGCTTTAAAAGCTTATTGAGAACCACAGAAAACAGAAGCCCAAAGTATCTTCGATTTGAAGTTCCTATTTTGATTGTTGTACTGTTTTTTAATGTATTTCAATTTCGACTACCATTTTCAACTCACTAATCATTTTTGTTGATGACTTGCCGATTTATATATTATTACATGTTCTTTTTTTACAAGTTCTTACCTGTGTAGTATTGCTTATTGAGAACCACAGAAATCTTCGATTTGAAGTTCCTATTTTTGAAGGTTCAACTGTTTTTTAATGTATGTCAACTTCCATTTTTAATTCAATAATCATTCATGTTATCTACTTGAGGCAGTTTACATGTTCTACTTTTAATCTGAAACAATGTTACTGAGTTTTAAAATAGTGTACCTGTTCCAGTAAATATAGTAGTGTTTATTTATTGTTATATTATTTTACGTATGATGTCAATAATGTGTAATGTATTTTTATTGATATAATAATTTTTATAGTGTTACGAGACACAATAAAAAGTCATTACGTTAAGGATTTATAGTGTCATagatgtttggataaaaataattctccttcaagtACAAGTTATTTAAGGACAGGATGATATTAATGTTTTATTTCGGTCCTCTTTATCTCCATGTCAGTGTTAATTTCATTTAATCTCAGTTTTTAAAGTTTATATGAAGTAATGGAATTTTAGATACTTTTTAATTTTTTAAATGATAAAATGTTTTGGACGACAGGACAATATGGATGTTTTATATAGATAAATCCATGTCAAAGTTAATTTCTTTTAATCACAGTTTTAAATTTTATATGAAGTAATGGAATTTTAAATATTTAAAAAAAATTATGTTTTTTGGTTGTTTTTTTGCATCTGATAAAGCTATACATATTTTAGCTCTTAAATCTGAATTTGTTAATTGACTGTTTAAGCAACACAATGTTGCTTTCTTCACGTTTTTTTTTTCATCTGATAAAGCTACATATTTTCGCTCTTAATCTGAATCTGTTAATTGACTTGTTTAAGCAACACAATGTTGCTTGCTTTCCACGTTATTTTTTAAGTACTTATCGGTGTTGGAATTTTCCTAAAGGTTCCCAGCGCCACTATCCGTGTCTTAACCTTTTTCGTTATTTTTTTTCAGTTTGTTATTGTCAATAAAACAGGTTTGTACACAATGGATATTTCGATAAGCGAGTATATTTTTGTAAGAAATTCGCCAGGATTTGTGTTTTTTTTATTATAAAAATTGGTCTTTATATATTGTACAATTTTTTCCAGAGGGTCTAAATGCATGAGTAGGTTTGTTTGAGAGAAGTTATTTTAGCTCTAAATTTGTATATCTGTTGGTGCATCTTTATTTTTAATAGCAAATTTCATGGTTTGTAATTATTGTATATTCGTTGATAGATCTGTAAGCTCAAAACGGTAGAGCGATCAGAGCATTTGTCCACTGACATGCTCTGGTAGGATGGTGGTTCGAATCCACCCAGATCTGCATGTTGAATAGTAATAAAGAAAAAAAAAATGAGGAGCGAAAATAGAATATAAGTGTGCTATTAAATTTAGATGAATAGAGTTATGTAACAGGTAATCTTTCTGGTTGTTT

>Glyma.01g175700.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g175700 ID=Glyma.01g175700.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Coding sequences of Glyma.01G175700
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Predicted protein sequences of Glyma.01G175700
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>Glyma.01g175700.8.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g175700.8 locus=Glyma.01g175700 ID=Glyma.01g175700.8.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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>Glyma.01g175700.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g175700.9 locus=Glyma.01g175700 ID=Glyma.01g175700.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1
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Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA
 
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