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| Database ID | Annotation Type | Annotation Description | Annotation Source | Match Score | Evidence Code |
|---|---|---|---|---|---|
| AT5G45140.1 | AT | nuclear RNA polymerase C2 | JGI | N/A | IEA |
| GO:0006351 | GO-bp | transcription, DNA-templated | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0006351 | GO-bp | transcription, DNA-templated | JGI | N/A | IEA |
| GO:0006383 | GO-bp | transcription by RNA polymerase III | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0000428 | GO-cc | DNA-directed RNA polymerase complex | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0005666 | GO-cc | DNA-directed RNA polymerase III complex | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0009507 | GO-cc | chloroplast | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0009536 | GO-cc | plastid | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0001056 | GO-mf | RNA polymerase III activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0003677 | GO-mf | DNA binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0003677 | GO-mf | DNA binding | JGI | N/A | IEA |
| GO:0003899 | GO-mf | DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0003899 | GO-mf | DNA-directed RNA polymerase activity | JGI | N/A | IEA |
| GO:0016740 | GO-mf | transferase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0016779 | GO-mf | nucleotidyltransferase activity | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| GO:0032549 | GO-mf | ribonucleoside binding | EnsemblGenomes | N/A | IEA |
| KOG0215 | KOG | RNA polymerase III, second largest subunit | JGI | N/A | IEA |
| PTHR20856 | Panther | DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE I SUBUNIT 2 | JGI | N/A | IEA |
| PTHR20856:SF8 | Panther | DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE III SUBUNIT RPC2 | JGI | N/A | IEA |
| PF00562 | PFAM | RNA polymerase Rpb2, domain 6 | JGI | N/A | IEA |
| PF04560 | PFAM | RNA polymerase Rpb2, domain 7 | JGI | N/A | IEA |
| PF04561 | PFAM | RNA polymerase Rpb2, domain 2 | JGI | N/A | IEA |
| PF04563 | PFAM | RNA polymerase beta subunit | JGI | N/A | IEA |
| PF04565 | PFAM | RNA polymerase Rpb2, domain 3 | JGI | N/A | IEA |
| PF04566 | PFAM | RNA polymerase Rpb2, domain 4 | JGI | N/A | IEA |
| PF04567 | PFAM | RNA polymerase Rpb2, domain 5 | JGI | N/A | IEA |
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Glyma.01G006500 not represented in the dataset |
Glyma.01G006500 not represented in the dataset |
| Libault et al. 2010, Plant Phys 152(2):541-552. Complete Transcriptome of the Soybean Root Hair Cell, a Single-Cell Model, and Its Alteration in Response to Bradyrhizobium japonicum Infection |
Severin et al. 2010, BMC Plant Biology 10:160 RNA-Seq Atlas of Glycine max: A guide to the soybean transcriptome |
Gene families from Phytozome are displayed using the PhyloTree viewer developed by LIS.
Gene information in GlycineMine developed by LIS.
Gene families from PhyloGenes.
| Paralog | Evidence | Comments |
|---|---|---|
| Glyma.07g125300 | IGC | Paralogs in soybean determined by Steven Cannon using BLAST, DAGChainer, PAML, and selection of gene pairs from synteny blocks with median Ks values of less than 0.35. |
| Corresponding Name | Annotation Version | Evidence | Comments |
|---|---|---|---|
| Glyma.01g006500 | Wm82.a4.v1 | ISS | As supplied by JGI |
| Glyma01g00975 | Wm82.a1.v1.1 | IGC | As supplied by JGI |
>Glyma.01g006500.2 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g006500 ID=Glyma.01g006500.2.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g006500.3 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g006500 ID=Glyma.01g006500.3.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 TCACCCATCTACAAGTGTCTCCGCCGCTTCTGTTTTCACTTTTCTGCATTAACAGAGCATCAAGAAGCAGAAACAGAGCACGATCCCTAAACAGAGCACGCTCACATTCTCACCGCAAAGTACAAAACCTACTCCGAACATAGCCCTGCAACTGACTGACACATCACCGTAATGGGTCTCAAGCACGATCCTTTGCAACAACCCACCACCAATCAGTTCAATGGGGGCAACAAGTTACCTGGTGACCATTGTGGTGATTCTGGTTTTGACCAAAGGGTCCTAACTGCTCCCATAAAATCTGCTGTTGACAAGTTCCAGCTTATTCCTGAGTTCCTCAAGGTTTTTAAATGTCGGAATTGGTAAACCATCCATGATGATTGATGAGGTTACTGAGGGCCTTACTCCACAAACGTGCCGCTTAAGTGACCTGACGTATGCGGCTCCAATATGTGCTGATGTTGAGTACACGCTACGAAGTCACGATAAACCAGACAACAAGAGAACGCTCAGAGTTGAAATTGGAAGAATGCCTATTATGCTGCGGAGTTGTTGTTGTGTCTTGCATGGGAAAGATGAAGCTGAACTTGCTAAACTTGGTGAGTGCCCCCTTGATCCCGGAGGATATTTTGTAATCAAAGGGACTGAGAAGGTGATTTTGATACAAGAACAACTGTCAAAGAATAGAATAATTATAGACACCGACAAGAAAGGAAACATTACTGCATCTGTTACAAGCAGCACGGAGAAAATAAAAACAAAAACTGTTATTGTGATGGAAAATGAGAAGCTCTGGTTACAATTGAATAAATTTCCTAAGAAGGTTCCTCTTATGGTAGTTATGAAAGCTATGGGGATGGAGAGTGATCAAGAAGTTATACAGATGGTTGGAAGAGATCCTCGTTATAGTTTTCTACTGTTGCCCTCTATTGAGGAATGTAGAAAATGTAAGGTATATACAAAAGAGCAAGCATTGGAGTACCTTGATAAGCTGGTAAAACGTCCCACTTATTCAAGCAATTCAGCTGAAAAGGAAGGAGCAGCATTTTCTGCCCTAAGAGATGTATTTCTTGCAAATGTGCCTGTGGATCAAGATAATTTTCAGAAAAAATGTATATATGTTGCTGTTATGATGAGACGCATAATGGATGCAATTTTAAATAAAGATGCAATGGATGACAAGGATTATGTGGGAAACAAGCGGTTGGAGTTATCTGGCCAGTTAATATCTCTGCTTTTTGAGGATCTCTTTAAGTCAATGACAACCGAAGTTAAGAACTTGACAGACAAAATGTTAGATAAGCCGGACAAGGCTAAGAATTTTGACATATGTACTCTTCTTACTAGGACTCGGAGTATCATCACTCTAGGTCTGGAAAGGACTCTCTCCACTGGTAATTTTGAAATTAAAAGGTTCAGAATGGAAAGGAAAGGAATGACACAGGTGTTACAAAGGTTATCATTTATTGGTGCTTTGGGCCACATGACAAGAGTCTCACCACAGTTTGAGAAGTCCAGGAAAGTAAGTGGACCTAGAGCTTTGCAGCCTAGCCAGTGGGGCATGCTTTGTCCTTGTGATACCCCTGAAGGTGAGTCTTGTGGACTAGTAAAGAACTTGGCTTTGATGACTCATGTTACTACTGATGAAGAGGAGAAGCCCTTGATTTCTCTGTTCTATTCTTTGGATGTTGCACGCATAGAACACCTCTTTGCAGAGGAGCTTCATACACCGGATTCCTTTCTTGTCATTTTTAATGGTTTAATCCTTGGCAAGCATAGGAGGCCACTGCATTTTGCTACTAGAATTAGAAAGTTGCGGAGAGCAGGTGAAATTGGTGAGTTTGTGTCTGTCTATGTCAATGAAAAGCAGCATTGTGTCTACTTAGCTTCTGATGGTGGTAGAGTTTGCCGTCCCCTGGTCATTGCTGACAAGGGAATATCAAGAATCAAACAGCATCATATGAAAGAATTAATGGATGGAGTATGCACATTTGATGATTTTTTACGAGATGGCTTGCTTGAGTATCTTGATGTTAATGAAGAAAACAATGCTTTGATTGCTTTATATGAAGGAGATGCCACATCAGAAACTACTCATATTGAGATTGAGCCTTTTACCATCTTGGGAGTTATTGCAGGGTTAATTCCATATCCTCATCATAATCAGTCACCTAGAAACACGTATCAGTGTGCCATGGGTAAGCAAGCTATGGGAAATATAGCATTTAACCAGCTGCGCCGGATGGACAGTTTGCTTTACCTACTGGTTTATCCTCAACGACCTTTGCTTACAACTAAGACAATTGAGCTGGTTGGATATGATAAGCTTGGAGCCGGTCAAAATGCCACAGTAGCTGTAATGAGCTATAGTGGTTATGATATAGAAGATGCCATTGTGATGAACAAGGCATCTCTTGATCGTGGGTTTGGTCGTTGTATTGTTATGAAGAAGTATAATGCCATCATTCAGAAGCATTCGAATGACACATCAGACCGAATACTTAGGCCTAATAGAACTGCAGACACCGCTGGACGTATGCAGATACTTGATGATGATGGTATTGCTGCTCCTGGGGAAATTCTTAGGCCATATGACATCTATATCAATAAACAATCACCGATTGATACACGTACTCCAAAAACAGGATCTGCAGCAAATTTGCCAGATAGTGCATATCGGTCCAATGCACAATCATTCAAGGGTAATGGAGGAGAAGTAGTTGATAGGGTGGTTCTATGCTCGGATAAGGATAATAACATGTGTATCAAATTTCTAATTCGTCACACTCGTAGACCTGAGCTTGGTGATAAGTTTAGCAGCAGACATGGGCAAAAAGGTGTTTGCGGAACTATTGTCCCGCAAGAAGACTTTCCGTTTTCTGAGAAAGGCATTTGTCCTGATCTGATTATGAATCCTCATGGTTTCCCAAGTCGAATGACTGTTGGAAAGATGATAGAGCTTCTTGGGGGGAAAGCAGGGGTTTCATGTGGTAGGTTTCATTACGGCAGTGCTTTTGGGGAGAGAAGTGGTCATGCTGACAAGGTTGAAACCATAAGTGAAACTCTTGTGAGTAAAGGCTTCAACTACAGTGGGAAAGATTTCATTTATTCAGGTATTACGGGTTGCCCACTGCAAGCATATATTTTCATGGGTCCAATTTACTACCAGAAATTAAAACATATGGTGCTTGATAAGATGCATGCTCGTGGTAGTGGCCCTCGTGTCATGTTAACTAGACAGCCTACAGAAGGGAGAGCTAGAAATGGAGGTCTTCGTGTTGGAGAAATGGAACGTGATTGCTTGATTGCATATGGTGCTAGTATGTTAATTTATGAGCGACTCATGTTGTCTAGTGATCCTTTTGAAGTTCAGGTATGTACCGCATGTGGGTTGTTAGGATATTACAACCATAAGCTGAAAACTGGTATTTGTTCATCTTGTAAGAATGGAGACAATATTTCTACCATGAAGCTACCATATGCATGCAAGCTCATGATTCAGGAACTCCAATCAATGAATATTGTTCCCCGCTTAAAACTGGCAGATGCGTGAGTTTAATTGATGATCCAGTTCTGGGCAATTATAAGGCAGAAAAAATGCCATTGGGCACTGTTCATGAATTTCTGCTGATTCTTTGTATATTAGCCTCTTCAATTTTGCTCAACCCTCCCCCCCTCCTTTTCACCTCCTGAAAAAAAATGTAAAGCTTAGGGACTGTTCGTTTCTCTTAGTGTTTTTTTTTCTTAAAATTAAAAACTGTCCTGTAAAACTTTTTCTACTGTTCAACTGTCAATTTCTATTTAAAAATTGATTAAGCTTTGAT >Glyma.01g006500.4 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g006500 ID=Glyma.01g006500.4.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 TCACCCATCTACAAGTGTCTCCGCCGCTTCTGTTTTCACTTTTCTGCATTAACAGAGCATCAAGAAGCAGAAACAGAGCACGATCCCTAAACAGAGCACGCTCACATTCTCACCGCAAAGTACAAAACCTACTCCGAACATAGCCCTGCAACTGACTGACACATCACCGTAATGGGTCTCAAGCACGATCCTTTGCAACAACCCACCACCAATCAGTTCAATGGGGGCAACAAGTTACCTGGTGACCATTGTGGTGATTCTGGTTTTGACCAAAGGGTCCTAACTGCTCCCATAAAATCTGCTGTTGACAAGTTCCAGCTTATTCCTGAGTTCCTCAAGGTTAGGGGATTGGTGAAGCAACATTTGGATTCCTTTAACTATTTTGTGAGGACAGATATAAAGAAAATCGTTCGTGCTAACAATCTTATCATGGCGAGTAGGTACCCACACATATATCTAAGGTTTTTAAATGTCGGAATTGGTAAACCATCCATGATGATTGATGAGGTTACTGAGGGCCTTACTCCACAAACGTGCCGCTTAAGTGACCTGACGTATGCGGCTCCAATATGTGCTGATGTTGAGTACACGCTACGAAGTCACGATAAACCAGACAACAAGAGAACGCTCAGAGTTGAAATTGGAAGAATGCCTATTATGCTGCGGAGTTGTTGTTGTGTCTTGCATGGGAAAGATGAAGCTGAACTTGCTAAACTTGGTGAGTGCCCCCTTGATCCCGGAGGATATTTTGTAATCAAAGGGACTGAGAAGGTGATTTTGATACAAGAACAACTGTCAAAGAATAGAATAATTATAGACACCGACAAGAAAGGAAACATTACTGCATCTGTTACAAGCAGCACGGAGAAAATAAAAACAAAAACTGTTATTGTGATGGAAAATGAGAAGCTCTGGTTACAATTGAATAAATTTCCTAAGAAGGTTCCTCTTATGGTAGTTATGAAAGCTATGGGGATGGAGAGTGATCAAGAAGTTATACAGATGGTTGGAAGAGATCCTCGTTATAGTTTTCTACTGTTGCCCTCTATTGAGGAATGTAGAAAATGTAAGGTATATACAAAAGAGCAAGCATTGGAGTACCTTGATAAGCTGGTAAAACGTCCCACTTATTCAAGCAATTCAGCTGAAAAGGAAGGAGCAGCATTTTCTGCCCTAAGAGATGTATTTCTTGCAAATGTGCCTGTGGATCAAGATAATTTTCAGAAAAAATGTATATATGTTGCTGTTATGATGAGACGCATAATGGATGCAATTTTAAATAAAGATGCAATGGATGACAAGGATTATGTGGGAAACAAGCGGTTGGAGTTATCTGGCCAGTTAATATCTCTGCTTTTTGAGGATCTCTTTAAGTCAATGACAACCGAAGTTAAGAACTTGACAGACAAAATGTTAGATAAGCCGGACAAGGCTAAGAATTTTGACATATGTACTCTTCTTACTAGGACTCGGAGTATCATCACTCTAGGTCTGGAAAGGACTCTCTCCACTGGTAATTTTGAAATTAAAAGGTTCAGAATGGAAAGGAAAGGAATGACACAGGTGTTACAAAGGTTATCATTTATTGGTGCTTTGGGCCACATGACAAGAGTCTCACCACAGTTTGAGAAGTCCAGGAAAGTAAGTGGACCTAGAGCTTTGCAGCCTAGCCAGTGGGGCATGCTTTGTCCTTGTGATACCCCTGAAGGTGAGTCTTGTGGACTAGTAAAGAACTTGGCTTTGATGACTCATGTTACTACTGATGAAGAGGAGAAGCCCTTGATTTCTCTGTTCTATTCTTTGGATGTTGCACGCATAGAACACCTCTTTGCAGAGGAGCTTCATACACCGGATTCCTTTCTTGTCATTTTTAATGGTTTAATCCTTGGCAAGCATAGGAGGCCACTGCATTTTGCTACTAGAATTAGAAAGTTGCGGAGAGCAGGTGAAATTGGTGAGTTTGTGTCTGTCTATGTCAATGAAAAGCAGCATTGTGTCTACTTAGCTTCTGATGGTGGTAGAGTTTGCCGTCCCCTGGTCATTGCTGACAAGGGAATATCAAGAATCAAACAGCATCATATGAAAGAATTAATGGATGGAGTATGCACATTTGATGATTTTTTACGAGATGGCTTGCTTGAGTATCTTGATGTTAATGAAGAAAACAATGCTTTGATTGCTTTATATGAAGGAGATGCCACATCAGAAACTACTCATATTGAGATTGAGCCTTTTACCATCTTGGGAGTTATTGCAGGGTTAATTCCATATCCTCATCATAATCAGTCACCTAGAAACACGTATCAGTGTGCCATGGGTAAGCAAGCTATGGGAAATATAGCATTTAACCAGCTGCGCCGGATGGACAGTTTGCTTTACCTACTGGTTTATCCTCAACGACCTTTGCTTACAACTAAGACAATTGAGCTGGTTGGATATGATAAGCTTGGAGCCGGTCAAAATGCCACAGTAGCTGTAATGAGCTATAGTGGTTATGATATAGAAGATGCCATTGTGATGAACAAGGCATCTCTTGATCGTGGGTTTGGTCGTTGTATTGTTATGAAGAAGTATAATGCCATCATTCAGAAGCATTCGAATGACACATCAGACCGAATACTTAGGCCTAATAGAACTGCAGACACCGCTGGACGTATGCAGATACTTGATGATGATGGTATTGCTGCTCCTGGGGAAATTCTTAGGCCATATGACATCTATATCAATAAACAATCACCGATTGATACACGTACTCCAAAAACAGGATCTGCAGCAAATTTGCCAGATAGTGCATATCGGTCCAATGCACAATCATTCAAGGGTAATGGAGGAGAAGTAGTTGATAGGGTGGTTCTATGCTCGGATAAGGATAATAACATGTGTATCAAATTTCTAATTCGTCACACTCGTAGACCTGAGCTTGGTGATAAGTTTAGCAGCAGACATGGGCAAAAAGGTGTTTGCGGAACTATTGTCCCGCAAGAAGACTTTCCGTTTTCTGAGAAAGGCATTTGTCCTGATCTGATTATGAATCCTCATGGTTTCCCAAGTCGAATGACTGTTGGAAAGATGATAGAGCTTCTTGGGGGGAAAGCAGGGGTTTCATGTGGTAGGTTTCATTACGGCAGTGCTTTTGGGGAGAGAAGTGGTCATGCTGACAAGGTTGAAACCATAAGTGAAACTCTTGTGAGTAAAGGCTTCAACTACAGTGGGAAAGATTTCATTTATTCAGGTGCTTGATAAGATGCATGCTCGTGGTAGTGGCCCTCGTGTCATGTTAACTAGACAGCCTACAGAAGGGAGAGCTAGAAATGGAGGTCTTCGTGTTGGAGAAATGGAACGTGATTGCTTGATTGCATATGGTGCTAGTATGTTAATTTATGAGCGACTCATGTTGTCTAGTGATCCTTTTGAAGTTCAGATTACCATTTGGTAGACGTGGAGACAATGTTCTATGGATTGGGATCAGGAAGGGAAGAGAGTGGAGA >Glyma.01g006500.5 sequence-type=transcript locus=Glyma.01g006500 ID=Glyma.01g006500.5.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g006500.1.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g006500.1 locus=Glyma.01g006500 ID=Glyma.01g006500.1.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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>Glyma.01g006500.9.p sequence-type=predicted peptide transcript=Glyma.01g006500.9 locus=Glyma.01g006500 ID=Glyma.01g006500.9.Wm82.a2.v1 annot-version=Wm82.a2.v1 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| Funded by the USDA-ARS. Developed by the USDA-ARS SoyBase and Legume Clade Database group at the Iowa State University, Ames, IA | ||